Protein–RNA interactions for Protein: B1ARD8

Slfn8, Schlafen 8, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn8B1ARD8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slfn8B1ARD8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slfn8B1ARD8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slfn8B1ARD8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slfn8B1ARD8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slfn8B1ARD8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slfn8B1ARD8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slfn8B1ARD8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slfn8B1ARD8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slfn8B1ARD8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slfn8B1ARD8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slfn8B1ARD8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Slfn8B1ARD8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slfn8B1ARD8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slfn8B1ARD8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slfn8B1ARD8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slfn8B1ARD8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slfn8B1ARD8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slfn8B1ARD8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slfn8B1ARD8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slfn8B1ARD8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slfn8B1ARD8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slfn8B1ARD8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slfn8B1ARD8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slfn8B1ARD8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Slfn8B1ARD8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slfn8B1ARD8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slfn8B1ARD8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slfn8B1ARD8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slfn8B1ARD8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slfn8B1ARD8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slfn8B1ARD8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slfn8B1ARD8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slfn8B1ARD8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slfn8B1ARD8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slfn8B1ARD8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Slfn8B1ARD8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Slfn8B1ARD8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Slfn8B1ARD8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slfn8B1ARD8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slfn8B1ARD8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slfn8B1ARD8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Slfn8B1ARD8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slfn8B1ARD8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slfn8B1ARD8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slfn8B1ARD8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slfn8B1ARD8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slfn8B1ARD8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slfn8B1ARD8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slfn8B1ARD8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slfn8B1ARD8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slfn8B1ARD8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slfn8B1ARD8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slfn8B1ARD8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slfn8B1ARD8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slfn8B1ARD8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slfn8B1ARD8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Slfn8B1ARD8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slfn8B1ARD8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slfn8B1ARD8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Slfn8B1ARD8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slfn8B1ARD8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slfn8B1ARD8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slfn8B1ARD8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slfn8B1ARD8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slfn8B1ARD8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slfn8B1ARD8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slfn8B1ARD8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slfn8B1ARD8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slfn8B1ARD8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slfn8B1ARD8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Slfn8B1ARD8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slfn8B1ARD8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slfn8B1ARD8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slfn8B1ARD8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slfn8B1ARD8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slfn8B1ARD8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slfn8B1ARD8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slfn8B1ARD8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slfn8B1ARD8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slfn8B1ARD8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slfn8B1ARD8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slfn8B1ARD8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slfn8B1ARD8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slfn8B1ARD8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slfn8B1ARD8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slfn8B1ARD8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slfn8B1ARD8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slfn8B1ARD8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slfn8B1ARD8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Slfn8B1ARD8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slfn8B1ARD8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slfn8B1ARD8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slfn8B1ARD8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slfn8B1ARD8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slfn8B1ARD8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slfn8B1ARD8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slfn8B1ARD8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slfn8B1ARD8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slfn8B1ARD8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms