Protein–RNA interactions for Protein: A6X8I0

Gm1993, Predicted gene 1993, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1993A6X8I0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm1993A6X8I0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm1993A6X8I0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm1993A6X8I0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm1993A6X8I0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm1993A6X8I0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm1993A6X8I0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm1993A6X8I0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm1993A6X8I0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm1993A6X8I0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm1993A6X8I0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm1993A6X8I0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm1993A6X8I0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm1993A6X8I0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm1993A6X8I0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm1993A6X8I0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm1993A6X8I0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm1993A6X8I0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm1993A6X8I0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm1993A6X8I0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm1993A6X8I0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm1993A6X8I0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm1993A6X8I0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm1993A6X8I0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm1993A6X8I0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm1993A6X8I0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm1993A6X8I0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm1993A6X8I0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm1993A6X8I0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm1993A6X8I0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm1993A6X8I0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm1993A6X8I0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm1993A6X8I0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm1993A6X8I0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm1993A6X8I0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm1993A6X8I0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm1993A6X8I0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm1993A6X8I0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm1993A6X8I0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm1993A6X8I0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm1993A6X8I0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm1993A6X8I0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm1993A6X8I0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm1993A6X8I0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm1993A6X8I0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm1993A6X8I0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm1993A6X8I0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm1993A6X8I0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm1993A6X8I0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm1993A6X8I0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm1993A6X8I0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm1993A6X8I0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm1993A6X8I0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm1993A6X8I0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm1993A6X8I0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm1993A6X8I0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm1993A6X8I0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gm1993A6X8I0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gm1993A6X8I0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gm1993A6X8I0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gm1993A6X8I0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gm1993A6X8I0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gm1993A6X8I0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gm1993A6X8I0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm1993A6X8I0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm1993A6X8I0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm1993A6X8I0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm1993A6X8I0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm1993A6X8I0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm1993A6X8I0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm1993A6X8I0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm1993A6X8I0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm1993A6X8I0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm1993A6X8I0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm1993A6X8I0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm1993A6X8I0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm1993A6X8I0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm1993A6X8I0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm1993A6X8I0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm1993A6X8I0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm1993A6X8I0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm1993A6X8I0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm1993A6X8I0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm1993A6X8I0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm1993A6X8I0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm1993A6X8I0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Gm1993A6X8I0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm1993A6X8I0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm1993A6X8I0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm1993A6X8I0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm1993A6X8I0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm1993A6X8I0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm1993A6X8I0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm1993A6X8I0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm1993A6X8I0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm1993A6X8I0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm1993A6X8I0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm1993A6X8I0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm1993A6X8I0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm1993A6X8I0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms