Protein–RNA interactions for Protein: A2AMT6

Vmn1r2, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r2A2AMT6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn1r2A2AMT6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn1r2A2AMT6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn1r2A2AMT6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn1r2A2AMT6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn1r2A2AMT6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn1r2A2AMT6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn1r2A2AMT6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn1r2A2AMT6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn1r2A2AMT6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn1r2A2AMT6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn1r2A2AMT6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn1r2A2AMT6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn1r2A2AMT6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn1r2A2AMT6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn1r2A2AMT6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn1r2A2AMT6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn1r2A2AMT6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn1r2A2AMT6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn1r2A2AMT6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn1r2A2AMT6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn1r2A2AMT6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn1r2A2AMT6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn1r2A2AMT6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn1r2A2AMT6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn1r2A2AMT6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn1r2A2AMT6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn1r2A2AMT6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn1r2A2AMT6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn1r2A2AMT6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn1r2A2AMT6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn1r2A2AMT6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn1r2A2AMT6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn1r2A2AMT6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn1r2A2AMT6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn1r2A2AMT6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn1r2A2AMT6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn1r2A2AMT6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn1r2A2AMT6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn1r2A2AMT6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn1r2A2AMT6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn1r2A2AMT6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn1r2A2AMT6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn1r2A2AMT6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn1r2A2AMT6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn1r2A2AMT6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn1r2A2AMT6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn1r2A2AMT6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn1r2A2AMT6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn1r2A2AMT6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn1r2A2AMT6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn1r2A2AMT6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn1r2A2AMT6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn1r2A2AMT6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn1r2A2AMT6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn1r2A2AMT6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn1r2A2AMT6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn1r2A2AMT6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn1r2A2AMT6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn1r2A2AMT6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn1r2A2AMT6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn1r2A2AMT6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn1r2A2AMT6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn1r2A2AMT6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn1r2A2AMT6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn1r2A2AMT6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn1r2A2AMT6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vmn1r2A2AMT6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vmn1r2A2AMT6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vmn1r2A2AMT6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vmn1r2A2AMT6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vmn1r2A2AMT6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vmn1r2A2AMT6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn1r2A2AMT6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn1r2A2AMT6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn1r2A2AMT6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn1r2A2AMT6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn1r2A2AMT6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn1r2A2AMT6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn1r2A2AMT6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn1r2A2AMT6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn1r2A2AMT6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn1r2A2AMT6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn1r2A2AMT6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn1r2A2AMT6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn1r2A2AMT6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn1r2A2AMT6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn1r2A2AMT6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn1r2A2AMT6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn1r2A2AMT6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn1r2A2AMT6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn1r2A2AMT6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn1r2A2AMT6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn1r2A2AMT6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn1r2A2AMT6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn1r2A2AMT6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn1r2A2AMT6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn1r2A2AMT6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vmn1r2A2AMT6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn1r2A2AMT6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 151.9 ms