Protein–RNA interactions for Protein: A2AGU5

Cldn34d, Claudin 34D, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34dA2AGU5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn34dA2AGU5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cldn34dA2AGU5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cldn34dA2AGU5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cldn34dA2AGU5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cldn34dA2AGU5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cldn34dA2AGU5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cldn34dA2AGU5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cldn34dA2AGU5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn34dA2AGU5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn34dA2AGU5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cldn34dA2AGU5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cldn34dA2AGU5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cldn34dA2AGU5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cldn34dA2AGU5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cldn34dA2AGU5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn34dA2AGU5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn34dA2AGU5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn34dA2AGU5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn34dA2AGU5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn34dA2AGU5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn34dA2AGU5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cldn34dA2AGU5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cldn34dA2AGU5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cldn34dA2AGU5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cldn34dA2AGU5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cldn34dA2AGU5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cldn34dA2AGU5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cldn34dA2AGU5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cldn34dA2AGU5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cldn34dA2AGU5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn34dA2AGU5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn34dA2AGU5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cldn34dA2AGU5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cldn34dA2AGU5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cldn34dA2AGU5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cldn34dA2AGU5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cldn34dA2AGU5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cldn34dA2AGU5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cldn34dA2AGU5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cldn34dA2AGU5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cldn34dA2AGU5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cldn34dA2AGU5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cldn34dA2AGU5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cldn34dA2AGU5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cldn34dA2AGU5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cldn34dA2AGU5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cldn34dA2AGU5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cldn34dA2AGU5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cldn34dA2AGU5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cldn34dA2AGU5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cldn34dA2AGU5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cldn34dA2AGU5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cldn34dA2AGU5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cldn34dA2AGU5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cldn34dA2AGU5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cldn34dA2AGU5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cldn34dA2AGU5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cldn34dA2AGU5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cldn34dA2AGU5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn34dA2AGU5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn34dA2AGU5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn34dA2AGU5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn34dA2AGU5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn34dA2AGU5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn34dA2AGU5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn34dA2AGU5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn34dA2AGU5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn34dA2AGU5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cldn34dA2AGU5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cldn34dA2AGU5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cldn34dA2AGU5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cldn34dA2AGU5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cldn34dA2AGU5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cldn34dA2AGU5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cldn34dA2AGU5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cldn34dA2AGU5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cldn34dA2AGU5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cldn34dA2AGU5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Cldn34dA2AGU5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cldn34dA2AGU5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cldn34dA2AGU5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Cldn34dA2AGU5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cldn34dA2AGU5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cldn34dA2AGU5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cldn34dA2AGU5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cldn34dA2AGU5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cldn34dA2AGU5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Cldn34dA2AGU5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cldn34dA2AGU5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cldn34dA2AGU5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cldn34dA2AGU5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cldn34dA2AGU5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cldn34dA2AGU5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cldn34dA2AGU5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cldn34dA2AGU5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cldn34dA2AGU5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cldn34dA2AGU5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cldn34dA2AGU5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cldn34dA2AGU5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms