Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Cdc27A2A6Q5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cdc27A2A6Q5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cdc27A2A6Q5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cdc27A2A6Q5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cdc27A2A6Q5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cdc27A2A6Q5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cdc27A2A6Q5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cdc27A2A6Q5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cdc27A2A6Q5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cdc27A2A6Q5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cdc27A2A6Q5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cdc27A2A6Q5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cdc27A2A6Q5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cdc27A2A6Q5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cdc27A2A6Q5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cdc27A2A6Q5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdc27A2A6Q5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdc27A2A6Q5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cdc27A2A6Q5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cdc27A2A6Q5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cdc27A2A6Q5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Cdc27A2A6Q5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdc27A2A6Q5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdc27A2A6Q5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdc27A2A6Q5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdc27A2A6Q5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdc27A2A6Q5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdc27A2A6Q5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdc27A2A6Q5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdc27A2A6Q5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdc27A2A6Q5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdc27A2A6Q5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdc27A2A6Q5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdc27A2A6Q5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdc27A2A6Q5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdc27A2A6Q5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdc27A2A6Q5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdc27A2A6Q5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdc27A2A6Q5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdc27A2A6Q5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Cdc27A2A6Q5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Cdc27A2A6Q5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdc27A2A6Q5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdc27A2A6Q5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdc27A2A6Q5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdc27A2A6Q5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdc27A2A6Q5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdc27A2A6Q5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdc27A2A6Q5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdc27A2A6Q5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdc27A2A6Q5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdc27A2A6Q5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdc27A2A6Q5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdc27A2A6Q5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdc27A2A6Q5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdc27A2A6Q5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdc27A2A6Q5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdc27A2A6Q5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdc27A2A6Q5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdc27A2A6Q5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdc27A2A6Q5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdc27A2A6Q5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdc27A2A6Q5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdc27A2A6Q5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdc27A2A6Q5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdc27A2A6Q5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdc27A2A6Q5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdc27A2A6Q5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdc27A2A6Q5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdc27A2A6Q5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdc27A2A6Q5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdc27A2A6Q5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdc27A2A6Q5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdc27A2A6Q5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdc27A2A6Q5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdc27A2A6Q5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdc27A2A6Q5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdc27A2A6Q5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdc27A2A6Q5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdc27A2A6Q5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdc27A2A6Q5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cdc27A2A6Q5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdc27A2A6Q5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdc27A2A6Q5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdc27A2A6Q5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdc27A2A6Q5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdc27A2A6Q5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdc27A2A6Q5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdc27A2A6Q5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdc27A2A6Q5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdc27A2A6Q5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdc27A2A6Q5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdc27A2A6Q5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdc27A2A6Q5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdc27A2A6Q5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdc27A2A6Q5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdc27A2A6Q5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdc27A2A6Q5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdc27A2A6Q5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms