Protein–RNA interactions for Protein: A2A699

Fam171a2, Protein FAM171A2, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171a2A2A699 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam171a2A2A699 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam171a2A2A699 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam171a2A2A699 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam171a2A2A699 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam171a2A2A699 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam171a2A2A699 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam171a2A2A699 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam171a2A2A699 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam171a2A2A699 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam171a2A2A699 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam171a2A2A699 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam171a2A2A699 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam171a2A2A699 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam171a2A2A699 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam171a2A2A699 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam171a2A2A699 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam171a2A2A699 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam171a2A2A699 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam171a2A2A699 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam171a2A2A699 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam171a2A2A699 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam171a2A2A699 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam171a2A2A699 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam171a2A2A699 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam171a2A2A699 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam171a2A2A699 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam171a2A2A699 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam171a2A2A699 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam171a2A2A699 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam171a2A2A699 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam171a2A2A699 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam171a2A2A699 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam171a2A2A699 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam171a2A2A699 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam171a2A2A699 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam171a2A2A699 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam171a2A2A699 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam171a2A2A699 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam171a2A2A699 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam171a2A2A699 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam171a2A2A699 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam171a2A2A699 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam171a2A2A699 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam171a2A2A699 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam171a2A2A699 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam171a2A2A699 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam171a2A2A699 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam171a2A2A699 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam171a2A2A699 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam171a2A2A699 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam171a2A2A699 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam171a2A2A699 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam171a2A2A699 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam171a2A2A699 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam171a2A2A699 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam171a2A2A699 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam171a2A2A699 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam171a2A2A699 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam171a2A2A699 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam171a2A2A699 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam171a2A2A699 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam171a2A2A699 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam171a2A2A699 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam171a2A2A699 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam171a2A2A699 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam171a2A2A699 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fam171a2A2A699 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fam171a2A2A699 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fam171a2A2A699 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam171a2A2A699 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam171a2A2A699 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam171a2A2A699 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam171a2A2A699 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam171a2A2A699 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam171a2A2A699 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam171a2A2A699 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam171a2A2A699 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam171a2A2A699 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam171a2A2A699 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam171a2A2A699 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam171a2A2A699 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam171a2A2A699 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam171a2A2A699 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam171a2A2A699 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam171a2A2A699 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam171a2A2A699 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam171a2A2A699 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Fam171a2A2A699 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam171a2A2A699 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam171a2A2A699 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam171a2A2A699 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam171a2A2A699 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam171a2A2A699 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam171a2A2A699 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam171a2A2A699 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam171a2A2A699 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam171a2A2A699 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam171a2A2A699 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam171a2A2A699 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms