Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pkd2l1A2A259 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pkd2l1A2A259 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pkd2l1A2A259 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pkd2l1A2A259 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pkd2l1A2A259 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pkd2l1A2A259 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pkd2l1A2A259 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pkd2l1A2A259 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pkd2l1A2A259 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pkd2l1A2A259 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pkd2l1A2A259 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pkd2l1A2A259 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pkd2l1A2A259 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pkd2l1A2A259 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pkd2l1A2A259 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pkd2l1A2A259 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pkd2l1A2A259 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pkd2l1A2A259 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pkd2l1A2A259 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pkd2l1A2A259 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pkd2l1A2A259 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pkd2l1A2A259 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pkd2l1A2A259 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pkd2l1A2A259 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pkd2l1A2A259 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pkd2l1A2A259 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pkd2l1A2A259 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pkd2l1A2A259 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pkd2l1A2A259 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pkd2l1A2A259 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pkd2l1A2A259 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pkd2l1A2A259 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pkd2l1A2A259 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pkd2l1A2A259 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pkd2l1A2A259 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pkd2l1A2A259 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pkd2l1A2A259 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pkd2l1A2A259 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pkd2l1A2A259 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pkd2l1A2A259 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pkd2l1A2A259 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pkd2l1A2A259 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pkd2l1A2A259 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pkd2l1A2A259 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pkd2l1A2A259 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pkd2l1A2A259 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pkd2l1A2A259 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pkd2l1A2A259 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pkd2l1A2A259 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pkd2l1A2A259 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pkd2l1A2A259 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pkd2l1A2A259 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pkd2l1A2A259 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pkd2l1A2A259 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pkd2l1A2A259 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pkd2l1A2A259 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pkd2l1A2A259 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pkd2l1A2A259 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pkd2l1A2A259 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pkd2l1A2A259 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pkd2l1A2A259 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pkd2l1A2A259 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pkd2l1A2A259 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pkd2l1A2A259 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pkd2l1A2A259 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pkd2l1A2A259 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pkd2l1A2A259 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pkd2l1A2A259 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pkd2l1A2A259 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pkd2l1A2A259 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pkd2l1A2A259 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pkd2l1A2A259 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pkd2l1A2A259 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pkd2l1A2A259 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pkd2l1A2A259 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pkd2l1A2A259 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pkd2l1A2A259 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pkd2l1A2A259 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pkd2l1A2A259 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pkd2l1A2A259 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pkd2l1A2A259 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pkd2l1A2A259 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pkd2l1A2A259 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pkd2l1A2A259 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pkd2l1A2A259 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pkd2l1A2A259 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pkd2l1A2A259 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pkd2l1A2A259 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pkd2l1A2A259 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pkd2l1A2A259 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pkd2l1A2A259 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Pkd2l1A2A259 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pkd2l1A2A259 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pkd2l1A2A259 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pkd2l1A2A259 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pkd2l1A2A259 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pkd2l1A2A259 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pkd2l1A2A259 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pkd2l1A2A259 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms