Protein–RNA interactions for Protein: A0AUP1

Ccdc112, Coiled-coil domain-containing protein 112, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc112A0AUP1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc112A0AUP1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc112A0AUP1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc112A0AUP1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc112A0AUP1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc112A0AUP1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc112A0AUP1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc112A0AUP1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc112A0AUP1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc112A0AUP1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc112A0AUP1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc112A0AUP1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc112A0AUP1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc112A0AUP1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccdc112A0AUP1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc112A0AUP1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc112A0AUP1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc112A0AUP1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc112A0AUP1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc112A0AUP1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc112A0AUP1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc112A0AUP1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc112A0AUP1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc112A0AUP1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc112A0AUP1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc112A0AUP1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc112A0AUP1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc112A0AUP1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc112A0AUP1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc112A0AUP1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc112A0AUP1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc112A0AUP1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc112A0AUP1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc112A0AUP1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc112A0AUP1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc112A0AUP1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc112A0AUP1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc112A0AUP1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc112A0AUP1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc112A0AUP1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc112A0AUP1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc112A0AUP1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc112A0AUP1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc112A0AUP1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc112A0AUP1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc112A0AUP1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc112A0AUP1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc112A0AUP1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc112A0AUP1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc112A0AUP1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc112A0AUP1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc112A0AUP1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc112A0AUP1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc112A0AUP1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc112A0AUP1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc112A0AUP1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc112A0AUP1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc112A0AUP1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc112A0AUP1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc112A0AUP1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc112A0AUP1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc112A0AUP1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc112A0AUP1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc112A0AUP1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc112A0AUP1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc112A0AUP1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc112A0AUP1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc112A0AUP1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc112A0AUP1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc112A0AUP1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc112A0AUP1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc112A0AUP1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc112A0AUP1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc112A0AUP1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc112A0AUP1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc112A0AUP1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc112A0AUP1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc112A0AUP1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc112A0AUP1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc112A0AUP1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc112A0AUP1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc112A0AUP1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc112A0AUP1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc112A0AUP1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc112A0AUP1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc112A0AUP1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc112A0AUP1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc112A0AUP1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccdc112A0AUP1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc112A0AUP1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc112A0AUP1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc112A0AUP1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc112A0AUP1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc112A0AUP1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc112A0AUP1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc112A0AUP1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc112A0AUP1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc112A0AUP1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc112A0AUP1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc112A0AUP1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms