Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIT1

Ccdc194, Coiled-coil domain-containing protein 194, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc194A0A140LIT1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc194A0A140LIT1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc194A0A140LIT1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc194A0A140LIT1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc194A0A140LIT1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc194A0A140LIT1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc194A0A140LIT1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc194A0A140LIT1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc194A0A140LIT1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc194A0A140LIT1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ccdc194A0A140LIT1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc194A0A140LIT1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc194A0A140LIT1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc194A0A140LIT1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc194A0A140LIT1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc194A0A140LIT1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc194A0A140LIT1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc194A0A140LIT1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc194A0A140LIT1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc194A0A140LIT1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc194A0A140LIT1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc194A0A140LIT1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc194A0A140LIT1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc194A0A140LIT1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc194A0A140LIT1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc194A0A140LIT1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc194A0A140LIT1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc194A0A140LIT1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc194A0A140LIT1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc194A0A140LIT1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc194A0A140LIT1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc194A0A140LIT1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc194A0A140LIT1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc194A0A140LIT1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc194A0A140LIT1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc194A0A140LIT1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc194A0A140LIT1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc194A0A140LIT1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc194A0A140LIT1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc194A0A140LIT1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc194A0A140LIT1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc194A0A140LIT1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc194A0A140LIT1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc194A0A140LIT1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc194A0A140LIT1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc194A0A140LIT1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc194A0A140LIT1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc194A0A140LIT1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc194A0A140LIT1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc194A0A140LIT1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc194A0A140LIT1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc194A0A140LIT1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc194A0A140LIT1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc194A0A140LIT1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc194A0A140LIT1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc194A0A140LIT1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc194A0A140LIT1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc194A0A140LIT1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc194A0A140LIT1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc194A0A140LIT1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc194A0A140LIT1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc194A0A140LIT1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc194A0A140LIT1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc194A0A140LIT1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc194A0A140LIT1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc194A0A140LIT1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc194A0A140LIT1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc194A0A140LIT1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc194A0A140LIT1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc194A0A140LIT1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc194A0A140LIT1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc194A0A140LIT1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc194A0A140LIT1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc194A0A140LIT1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc194A0A140LIT1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc194A0A140LIT1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc194A0A140LIT1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc194A0A140LIT1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc194A0A140LIT1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc194A0A140LIT1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc194A0A140LIT1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc194A0A140LIT1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc194A0A140LIT1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc194A0A140LIT1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc194A0A140LIT1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc194A0A140LIT1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc194A0A140LIT1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc194A0A140LIT1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc194A0A140LIT1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc194A0A140LIT1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc194A0A140LIT1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc194A0A140LIT1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc194A0A140LIT1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc194A0A140LIT1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc194A0A140LIT1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc194A0A140LIT1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc194A0A140LIT1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc194A0A140LIT1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc194A0A140LIT1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc194A0A140LIT1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms