Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
A0A0U1RNP2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
A0A0U1RNP2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
A0A0U1RNP2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
A0A0U1RNP2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
A0A0U1RNP2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
A0A0U1RNP2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
A0A0U1RNP2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
A0A0U1RNP2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
A0A0U1RNP2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
A0A0U1RNP2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
A0A0U1RNP2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
A0A0U1RNP2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
A0A0U1RNP2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
A0A0U1RNP2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
A0A0U1RNP2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
A0A0U1RNP2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
A0A0U1RNP2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
A0A0U1RNP2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
A0A0U1RNP2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
A0A0U1RNP2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
A0A0U1RNP2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
A0A0U1RNP2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
A0A0U1RNP2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
A0A0U1RNP2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
A0A0U1RNP2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
A0A0U1RNP2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
A0A0U1RNP2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
A0A0U1RNP2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
A0A0U1RNP2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
A0A0U1RNP2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
A0A0U1RNP2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
A0A0U1RNP2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
A0A0U1RNP2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
A0A0U1RNP2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
A0A0U1RNP2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
A0A0U1RNP2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
A0A0U1RNP2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
A0A0U1RNP2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
A0A0U1RNP2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
A0A0U1RNP2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
A0A0U1RNP2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
A0A0U1RNP2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
A0A0U1RNP2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
A0A0U1RNP2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
A0A0U1RNP2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
A0A0U1RNP2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
A0A0U1RNP2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
A0A0U1RNP2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
A0A0U1RNP2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
A0A0U1RNP2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
A0A0U1RNP2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
A0A0U1RNP2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
A0A0U1RNP2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
A0A0U1RNP2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
A0A0U1RNP2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
A0A0U1RNP2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
A0A0U1RNP2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
A0A0U1RNP2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
A0A0U1RNP2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
A0A0U1RNP2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
A0A0U1RNP2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
A0A0U1RNP2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
A0A0U1RNP2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
A0A0U1RNP2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
A0A0U1RNP2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
A0A0U1RNP2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
A0A0U1RNP2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
A0A0U1RNP2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
A0A0U1RNP2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
A0A0U1RNP2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
A0A0U1RNP2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
A0A0U1RNP2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
A0A0U1RNP2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
A0A0U1RNP2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
A0A0U1RNP2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
A0A0U1RNP2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
A0A0U1RNP2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
A0A0U1RNP2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
A0A0U1RNP2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
A0A0U1RNP2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
A0A0U1RNP2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
A0A0U1RNP2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
A0A0U1RNP2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
A0A0U1RNP2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
A0A0U1RNP2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
A0A0U1RNP2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
A0A0U1RNP2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
A0A0U1RNP2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
A0A0U1RNP2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
A0A0U1RNP2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
A0A0U1RNP2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
A0A0U1RNP2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
A0A0U1RNP2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
A0A0U1RNP2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
A0A0U1RNP2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
A0A0U1RNP2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
A0A0U1RNP2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
A0A0U1RNP2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
A0A0U1RNP2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.1 ms