Protein–RNA interactions for Protein: A0A0R4J054

4921501E09Rik, RIKEN cDNA 4921501E09, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921501E09RikA0A0R4J054 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4921501E09RikA0A0R4J054 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4921501E09RikA0A0R4J054 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4921501E09RikA0A0R4J054 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
4921501E09RikA0A0R4J054 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4921501E09RikA0A0R4J054 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
4921501E09RikA0A0R4J054 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
4921501E09RikA0A0R4J054 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4921501E09RikA0A0R4J054 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
4921501E09RikA0A0R4J054 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
4921501E09RikA0A0R4J054 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4921501E09RikA0A0R4J054 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4921501E09RikA0A0R4J054 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4921501E09RikA0A0R4J054 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4921501E09RikA0A0R4J054 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
4921501E09RikA0A0R4J054 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4921501E09RikA0A0R4J054 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4921501E09RikA0A0R4J054 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
4921501E09RikA0A0R4J054 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4921501E09RikA0A0R4J054 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4921501E09RikA0A0R4J054 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
4921501E09RikA0A0R4J054 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
4921501E09RikA0A0R4J054 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4921501E09RikA0A0R4J054 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4921501E09RikA0A0R4J054 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
4921501E09RikA0A0R4J054 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4921501E09RikA0A0R4J054 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
4921501E09RikA0A0R4J054 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4921501E09RikA0A0R4J054 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4921501E09RikA0A0R4J054 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
4921501E09RikA0A0R4J054 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
4921501E09RikA0A0R4J054 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4921501E09RikA0A0R4J054 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
4921501E09RikA0A0R4J054 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4921501E09RikA0A0R4J054 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
4921501E09RikA0A0R4J054 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
4921501E09RikA0A0R4J054 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
4921501E09RikA0A0R4J054 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
4921501E09RikA0A0R4J054 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4921501E09RikA0A0R4J054 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4921501E09RikA0A0R4J054 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4921501E09RikA0A0R4J054 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4921501E09RikA0A0R4J054 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4921501E09RikA0A0R4J054 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4921501E09RikA0A0R4J054 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4921501E09RikA0A0R4J054 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4921501E09RikA0A0R4J054 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4921501E09RikA0A0R4J054 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
4921501E09RikA0A0R4J054 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4921501E09RikA0A0R4J054 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4921501E09RikA0A0R4J054 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4921501E09RikA0A0R4J054 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
4921501E09RikA0A0R4J054 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
4921501E09RikA0A0R4J054 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4921501E09RikA0A0R4J054 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4921501E09RikA0A0R4J054 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4921501E09RikA0A0R4J054 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4921501E09RikA0A0R4J054 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4921501E09RikA0A0R4J054 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4921501E09RikA0A0R4J054 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4921501E09RikA0A0R4J054 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4921501E09RikA0A0R4J054 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4921501E09RikA0A0R4J054 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4921501E09RikA0A0R4J054 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
4921501E09RikA0A0R4J054 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
4921501E09RikA0A0R4J054 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4921501E09RikA0A0R4J054 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4921501E09RikA0A0R4J054 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms