RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640634.1

SCARB2-222, Transcript of scavenger receptor class B member 2, human

TSL 5

Gene SCARB2, Length 1,734 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SCARB2-222	ENST00000640634	GPR22	Q99680	433 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	LRRN3	Q9H3W5	708 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	LATS2	Q9NRM7	1088 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	TAS2R13	Q9NYV9	303 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	NCKIPSD	Q9NZQ3	722 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	TXNDC16	Q9P2K2	825 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	ICK	Q9UPZ9	632 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	EXOC1L	A0A1B0GW35	172 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	ARHGEF33	A8MVX0	844 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	PDPK1	O15530	556 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	WISP3	O95389	354 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	GP1BA	P07359	652 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	ABHD2	P08910	425 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	ZNF37A	P17032	561 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	IRF9	Q00978	393 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	KRT33B	Q14525	404 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	USP10	Q14694	798 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	MLC1	Q15049	377 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	CYHR1	Q6ZMK1	362 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	MBOAT1	Q6ZNC8	495 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	TAX1BP1	Q86VP1	789 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	OR4E2	Q8NGC2	313 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	OR10G6	Q8NH81	332 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	OR5K2	Q8NHB8	316 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	GABPB2	Q8TAK5	448 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	SLC44A1	Q8WWI5	657 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	MENT	Q9BUN1	341 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	ABCG4	Q9H172	646 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	SEMA6C	Q9H3T2	930 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	KIR3DX1	Q9H7L2	352 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	NSMCE4A	Q9NXX6	385 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	KLHL3	Q9UH77	587 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	KLK13	Q9UKR3	277 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	RAB21	Q9UL25	225 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	APOBEC2	Q9Y235	224 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	PTPRB	P23467	1997 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634		A0A1W2PNU3	283 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	MED19	A0JLT2	244 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	LILRA5	A6NI73	299 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	SMIM23	A6NLE4	172 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634		D6RAR5	112 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	BTN3A3	O00478	584 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	NTN3	O00634	580 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	KIF1C	O43896	1103 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	UBXN7	O94888	489 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	MATN4	O95460	622 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	C1orf105	O95561	183 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	ALDOA	P04075	364 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	SLCO1A2	P46721	670 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	PHKG1	Q16816	387 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	CCDC92	Q53HC0	331 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	GRTP1	Q5TC63	336 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	C16orf46	Q6P387	395 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	RAB44	Q7Z6P3	723 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	RCBTB1	Q8NDN9	531 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	DENND1A	Q8TEH3	1009 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	THAP3	Q8WTV1	239 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	NCSTN	Q92542	709 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	TRIT1	Q9H3H1	467 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	STN1	Q9H668	368 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	PCDHGA11	Q9Y5H2	935 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	PCDHGA1	Q9Y5H4	931 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	OR6C74	A6NCV1	312 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	NPEPPSL1	A6NEC2	478 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634		F8W8V4	182 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	CDC7	O00311	574 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	BTN3A1	O00481	513 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	KPNA5	O15131	536 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	PROS1	P07225	676 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	SLC35E2B	P0CK96	405 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	PNLIP	P16233	465 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	PEBP1	P30086	187 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	SPR	P35270	261 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	GPR3	P46089	330 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	DLG1	Q12959	904 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	NAB1	Q13506	487 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	COL9A2	Q14055	689 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	SPIDR	Q14159	915 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	ZKSCAN8	Q15776	578 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	TTLL9	Q3SXZ7	439 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	SNAP47	Q5SQN1	464 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	CDCP2	Q5VXM1	449 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	DESI1	Q6ICB0	168 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	FAM20C	Q8IXL6	584 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	LINC01555	Q8NAE3	123 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	EPS8L3	Q8TE67	593 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	ADAMTS14	Q8WXS8	1223 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	GFM1	Q96RP9	751 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	DHRS4	Q9BTZ2	278 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	GPAM	Q9HCL2	828 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	SPHK1	Q9NYA1	384 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	CORO1C	Q9ULV4	474 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	WASF3	Q9UPY6	502 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	UNC13C	Q8NB66	2214 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634		A8MU76	341 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	PSIP1	O75475	530 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	INHBA	P08476	426 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SCARB2-222	ENST00000640634	POLR2C	P19387	275 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71

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