RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	POLR1B	Q9H9Y6	1135 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	CD320	Q9NPF0	282 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	SLC22A14	Q9Y267	594 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	ATP11B	Q9Y2G3	1177 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	PCDHB14	Q9Y5E9	798 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152		U3KQV3	271 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	ELOVL7	A1L3X0	281 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	IFRD1	O00458	451 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	TULP3	O75386	442 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	KRT6A	P02538	564 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	KRT6B	P04259	564 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	IL6	P05231	212 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	CDK4	P11802	303 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	KRT6C	P48668	564 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	MAPK10	P53779	464 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	PTCHD3	Q3KNS1	767 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	C22orf39	Q6P5X5	142 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM25	Q86YD3	366 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	ZDHHC13	Q8IUH4	622 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	SLC22A17	Q8WUG5	538 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	SLC46A2	Q9BY10	475 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	SLC32A1	Q9H598	525 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	CLMP	Q9H6B4	373 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM45A	Q9NWC5	275 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	CHCHD3	Q9NX63	227 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	B4GALT6	Q9UBX8	382 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	TRPS1	Q9UHF7	1281 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	GRXCR2	A6NFK2	248 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	NEDD8-MDP1	E9PL57	170 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	HIST1H2AG	P0C0S8	130 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	HIST1H2AD	P20671	130 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	POM121L1P	Q3SYA9	428 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	USP39	Q53GS9	565 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF648	Q5T619	568 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	ASTL	Q6HA08	431 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	PRR23B	Q6ZRT6	265 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	CBARP	Q8N350	705 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	USP7	Q93009	1102 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	ISOC1	Q96CN7	298 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	HIST1H2AH	Q96KK5	128 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	HIST1H2AJ	Q99878	128 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	INPP5K	Q9BT40	448 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	H2AFJ	Q9BTM1	129 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	ING2	Q9H160	280 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	BRD9	Q9H8M2	597 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	HCFC1R1	Q9NWW0	138 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	PKD2L2	Q9NZM6	624 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF639	Q9UID6	485 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	TRAV19	A0A0A6YYK7	116 aa		12.77	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152		G3V2T6	193 aa		12.77	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152		H0Y858	1186 aa		12.77	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	CXCR6	O00574	342 aa		12.77	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	FKTN	O75072	461 aa		12.77	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	GNRH1	P01148	92 aa		12.77	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	ALPL	P05186	524 aa		12.77	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	OR56A5	P0C7T3	313 aa		12.77	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	MYCLP1	P12525	358 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	PRKACG	P22612	351 aa		12.77	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	CSNK1D	P48730	415 aa		12.77	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	ALDH3A2	P51648	485 aa		12.77	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	RPS14	P62263	151 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	ADARB1	P78563	741 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	GPR107	Q5VW38	600 aa		12.77	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	NEK5	Q6P3R8	708 aa		12.77	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	C12orf43	Q96C57	262 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	SLC47A1	Q96FL8	570 aa		12.77	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	APOLD1	Q96LR9	279 aa		12.77	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	P2RY13	Q9BPV8	354 aa		12.77	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	NPL	Q9BXD5	320 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	ADNP	Q9H2P0	1102 aa		12.77	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	CXorf21	Q9HAI6	301 aa		12.77	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	RDH14	Q9HBH5	336 aa		12.77	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	TMPRSS11E	Q9UL52	423 aa		12.77	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	MICAL3	Q7RTP6	2002 aa		12.77	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	CHD7	Q9P2D1	2997 aa		12.77	□□□□□ -0.37
BRF1-222	ENST00000635152	PABPN1L	A6NDY0	278 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
BRF1-222	ENST00000635152	AGAP14	A8MT82	685 aa		12.77	□□□□□ -0.37
BRF1-222	ENST00000635152	CCL16	O15467	120 aa		12.77	□□□□□ -0.37
BRF1-222	ENST00000635152	FOXD2	O60548	495 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
BRF1-222	ENST00000635152	COQ9	O75208	318 aa		12.77	□□□□□ -0.37
BRF1-222	ENST00000635152	SH3BGRL	O75368	114 aa		12.77	□□□□□ -0.37
BRF1-222	ENST00000635152	C1QC	P02747	245 aa		12.77	□□□□□ -0.37
BRF1-222	ENST00000635152	C8A	P07357	584 aa		12.77	□□□□□ -0.37
BRF1-222	ENST00000635152	C1S	P09871	688 aa		12.77	□□□□□ -0.37
BRF1-222	ENST00000635152	C7	P10643	843 aa		12.77	□□□□□ -0.37
BRF1-222	ENST00000635152	DAG1	Q14118	895 aa		12.77	□□□□□ -0.37
BRF1-222	ENST00000635152	SPESP1	Q6UW49	350 aa		12.77	□□□□□ -0.37
BRF1-222	ENST00000635152	KCTD8	Q6ZWB6	473 aa		12.77	□□□□□ -0.37
BRF1-222	ENST00000635152	ERI1	Q8IV48	349 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
BRF1-222	ENST00000635152	GLB1L3	Q8NCI6	653 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
BRF1-222	ENST00000635152	CDC26	Q8NHZ8	85 aa		12.77	□□□□□ -0.37
BRF1-222	ENST00000635152	FAM81A	Q8TBF8	368 aa		12.77	□□□□□ -0.37
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF689	Q96CS4	500 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
BRF1-222	ENST00000635152	APIP	Q96GX9	242 aa		12.77	□□□□□ -0.37
BRF1-222	ENST00000635152	BBS2	Q9BXC9	721 aa		12.77	□□□□□ -0.37
BRF1-222	ENST00000635152	EBPL	Q9BY08	206 aa		12.77	□□□□□ -0.37
BRF1-222	ENST00000635152	UGT2B28	Q9BY64	529 aa		12.77	□□□□□ -0.37

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