RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630659.2

BBS1-225, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 5 BASIC

Gene BBS1, Length 1,934 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-225	ENST00000630659	TM9SF3	Q9HD45	589 aa		15	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	RUVBL2	Q9Y230	463 aa	Known RBP	15	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	ACOT9	Q9Y305	439 aa		15	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	DOCK6	Q96HP0	2047 aa		14.99	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	TCRBV5S2	A0A599	114 aa		14.99	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	ANGPT2	O15123	496 aa		14.99	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	TPST1	O60507	370 aa		14.99	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	FKBP9	O95302	570 aa		14.99	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	DLGAP3	O95886	979 aa		14.99	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	MT-CO1	P00395	513 aa		14.99	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	STMN1	P16949	149 aa		14.99	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	CLCN5	P51795	746 aa		14.99	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	POU4F1	Q01851	419 aa		14.99	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	IL18R1	Q13478	541 aa		14.99	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	CDK10	Q15131	360 aa		14.99	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	DDX59	Q5T1V6	619 aa	Known RBP eCLIP	14.99	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	CNST	Q6PJW8	725 aa		14.99	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	CCNYL1	Q8N7R7	359 aa		14.99	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	LPCAT1	Q8NF37	534 aa		14.99	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	OR13C4	Q8NGS5	318 aa		14.99	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	HCAR2	Q8TDS4	363 aa		14.99	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	ERLEC1	Q96DZ1	483 aa		14.99	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	SAMD11	Q96NU1	681 aa		14.99	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	NODAL	Q96S42	347 aa		14.99	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	TDP1	Q9NUW8	608 aa		14.99	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	XPR1	Q9UBH6	696 aa		14.99	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	DPP7	Q9UHL4	492 aa		14.99	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	PCDHGA3	Q9Y5H0	932 aa		14.99	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659		A0A087X1B8	175 aa		14.98	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659		A8MU76	341 aa		14.98	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	ANKRD66	B4E2M5	251 aa		14.98	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	GLP2R	O95838	553 aa		14.98	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	GOT2	P00505	430 aa	Known RBP	14.98	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	SLC35E2B	P0CK96	405 aa		14.98	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	OXTR	P30559	389 aa		14.98	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	CD70	P32970	193 aa		14.98	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	PLK1	P53350	603 aa		14.98	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	SLC12A2	P55011	1212 aa		14.98	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	TPD52	P55327	224 aa	Predicted RBP	14.98	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	NTHL1	P78549	312 aa		14.98	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	FCHO2	Q0JRZ9	810 aa		14.98	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	PTPRCAP	Q14761	206 aa		14.98	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	TAF1A	Q15573	450 aa	Predicted RBP	14.98	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	PLEKHG6	Q3KR16	790 aa		14.98	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	PRSS36	Q5K4E3	855 aa		14.98	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	AGAP6	Q5VW22	663 aa		14.98	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	P2RY8	Q86VZ1	359 aa		14.98	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		14.98	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	GPR150	Q8NGU9	434 aa		14.98	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	GLMN	Q92990	594 aa		14.98	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	AGAP4	Q96P64	663 aa		14.98	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	DHRS9	Q9BPW9	319 aa		14.98	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	MMP27	Q9H306	513 aa		14.98	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	ABCB8	Q9NUT2	735 aa		14.98	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	NLE1	Q9NVX2	485 aa	Predicted RBP	14.98	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	STMN3	Q9NZ72	180 aa		14.98	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	OR51F1	A6NGY5	319 aa		14.98	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659		K7ERQ8	282 aa		14.98	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	PER2	O15055	1255 aa		14.98	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	INPP4B	O15327	924 aa		14.98	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	TPPP	O94811	219 aa		14.98	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	PRSS23	O95084	383 aa		14.98	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	APOA1	P02647	267 aa		14.98	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	CA3	P07451	260 aa		14.98	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	PCMT1	P22061	227 aa		14.98	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	PKLR	P30613	574 aa		14.98	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	SHMT2	P34897	504 aa		14.98	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	NUDT1	P36639	197 aa		14.98	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	CCR10	P46092	362 aa		14.98	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF140	P52738	457 aa	Predicted RBP	14.98	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	EEFSEC	P57772	596 aa	Known RBP	14.98	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	TAS2R39	P59534	338 aa		14.98	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	AP1S1	P61966	158 aa		14.98	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF45	Q02386	682 aa		14.98	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	MVK	Q03426	396 aa		14.98	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	CLC	Q05315	142 aa		14.98	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	GPM6B	Q13491	265 aa		14.98	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	SUZ12	Q15022	739 aa	Known RBP	14.98	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	CCDC58	Q4VC31	144 aa		14.98	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF789	Q5FWF6	425 aa		14.98	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		14.98	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	ATXN7L2	Q5T6C5	722 aa	Predicted RBP	14.98	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	14.98	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	LAYN	Q6UX15	382 aa		14.98	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	GLT6D1	Q7Z4J2	308 aa		14.98	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	METTL3	Q86U44	580 aa	Known RBP	14.98	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	CEP97	Q8IW35	865 aa		14.98	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	POC5	Q8NA72	575 aa		14.98	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	MDGA1	Q8NFP4	955 aa		14.98	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	PSMA8	Q8TAA3	256 aa		14.98	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	RORB	Q92753	470 aa		14.98	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	CDKN2AIPNL	Q96HQ2	116 aa		14.98	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	OMD	Q99983	421 aa		14.98	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	DGCR6L	Q9BY27	220 aa		14.98	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	CLPB	Q9H078	707 aa		14.98	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	MARCH4	Q9P2E8	410 aa	Predicted RBP	14.98	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	ZMYM5	Q9UJ78	669 aa		14.98	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	C2orf81	A6NN90	581 aa		14.97	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	CD3EAP	O15446	510 aa	Known RBP	14.97	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	TRIM16	O95361	564 aa		14.97	□□□□□ -0.01

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