RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629846.2

PFKM-232, Transcript of phosphofructokinase, muscle, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene PFKM, Length 381 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKM-232ENST00000629846 PRPS1L1P21108 318 aa6.99□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 PPIBP23284 216 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 IL12AP29459 219 aa6.99□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 HLA-FP30511 346 aa6.99□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 GKP32189 559 aa6.99□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 CCR7P32248 378 aa6.99□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 HALP42357 657 aa6.99□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 GDF5P43026 501 aa6.99□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 STK19P49842 368 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 HTR6P50406 440 aa6.99□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 RPS6KA3P51812 740 aa6.99□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 ZXDBP98169 803 aa6.99□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 IRF8Q02556 426 aa6.99□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 CYP4F3Q08477 520 aa6.99□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 LSAMPQ13449 338 aa6.99□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 BIRC2Q13490 618 aa6.99□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 PTPRRQ15256 657 aa6.99□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP6.99□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 PHKG1Q16816 387 aa6.99□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 RFX4Q33E94 735 aa6.99□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa6.99□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 SLC36A3Q495N2 470 aa6.99□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 RUNDC3AQ59EK9 446 aa6.99□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 ZNF805Q5CZA5 627 aa6.99□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa6.99□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 ERICH5Q6P6B1 374 aa6.99□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 NECAB2Q7Z6G3 386 aa6.99□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 TSPAN33Q86UF1 283 aa6.99□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 GPR180Q86V85 440 aa6.99□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 SATL1Q86VE3 508 aa6.99□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 TMEM25Q86YD3 366 aa6.99□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa6.99□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 KIAA2013Q8IYS2 634 aa6.99□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 EID3Q8N140 333 aa6.99□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 KLHL23Q8NBE8 558 aa6.99□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 TET1Q8NFU7 2136 aa6.99□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 ZFP28Q8NHY6 868 aa6.99□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 BTN2A2Q8WVV5 523 aa6.99□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 CYGBQ8WWM9 190 aa6.99□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 GTF2H4Q92759 462 aa6.99□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 FAM162AQ96A26 154 aa6.99□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 TMEM159Q96B96 161 aa6.99□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 TESCQ96BS2 214 aa6.99□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 NRBF2Q96F24 287 aa6.99□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 VPS50Q96JG6 964 aa6.99□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 TEX37Q96LM6 180 aa6.99□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 PPM1MQ96MI6 270 aa6.99□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 VPS35Q96QK1 796 aa6.99□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 SEPHS2Q99611 448 aa6.99□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 TCF25Q9BQ70 676 aa6.99□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 CCM2Q9BSQ5 444 aa6.99□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 ADI1Q9BV57 179 aa6.99□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 CLMPQ9H6B4 373 aa6.99□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 EPHX3Q9H6B9 360 aa6.99□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 PRM3Q9NNZ6 103 aa6.99□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 MARK1Q9P0L2 795 aa6.99□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 DNAJB9Q9UBS3 223 aa6.99□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 B4GALT6Q9UBX8 382 aa6.99□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa6.99□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 LIMD1Q9UGP4 676 aa6.99□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 IL36AQ9UHA7 158 aa6.99□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa6.99□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 ADGRE2Q9UHX3 823 aa6.99□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 CORO2BQ9UQ03 480 aa6.99□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 CCL27Q9Y4X3 112 aa6.99□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 FADS3Q9Y5Q0 445 aa6.99□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa6.99□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 A0A0U1RQS6 177 aa6.98□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 TSPAN11A1L157 253 aa6.98□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 ASPDHA6ND91 283 aa6.98□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 FAM220BPB1ANY3 271 aa6.98□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 C9JVG2 144 aa6.98□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 G3V2T6 193 aa6.98□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 CXCR6O00574 342 aa6.98□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 WNT9AO14904 365 aa6.98□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 TPST1O60507 370 aa6.98□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 NOL3O60936 208 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 SLCO2B1O94956 709 aa6.98□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 ADH1CP00326 375 aa6.98□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 PDYNP01213 254 aa6.98□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 PRNPP04156 253 aa6.98□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 C1SP09871 688 aa6.98□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 SMIM18P0DKX4 95 aa6.98□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 JUPP14923 745 aa6.98□□□□□ -1.29
PFKM-232ENST00000629846 NCK1P16333 377 aa6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms