RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627440.2

SNAP23-223, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-223	ENST00000627440	KIF5A	Q12840	1032 aa		5.85	□□□□□ -1.47
SNAP23-223	ENST00000627440	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
SNAP23-223	ENST00000627440	TBCEL	Q5QJ74	424 aa		5.85	□□□□□ -1.47
SNAP23-223	ENST00000627440	BRAT1	Q6PJG6	821 aa		5.85	□□□□□ -1.47
SNAP23-223	ENST00000627440	NLRP9	Q7RTR0	991 aa		5.85	□□□□□ -1.47
SNAP23-223	ENST00000627440	TAC4	Q86UU9	113 aa		5.85	□□□□□ -1.47
SNAP23-223	ENST00000627440	CILP2	Q8IUL8	1156 aa		5.85	□□□□□ -1.47
SNAP23-223	ENST00000627440	RELL1	Q8IUW5	271 aa		5.85	□□□□□ -1.47
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF655	Q8N720	491 aa	Predicted RBP	5.85	□□□□□ -1.47
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF525	Q8N782	197 aa		5.85	□□□□□ -1.47
SNAP23-223	ENST00000627440	ANKRD52	Q8NB46	1076 aa		5.85	□□□□□ -1.47
SNAP23-223	ENST00000627440	HCAR2	Q8TDS4	363 aa		5.85	□□□□□ -1.47
SNAP23-223	ENST00000627440	AKAP1	Q92667	903 aa	Known RBP eCLIP	5.85	□□□□□ -1.47
SNAP23-223	ENST00000627440	ARHGEF2	Q92974	986 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
SNAP23-223	ENST00000627440	SARAF	Q96BY9	339 aa		5.85	□□□□□ -1.47
SNAP23-223	ENST00000627440	MARK4	Q96L34	752 aa		5.85	□□□□□ -1.47
SNAP23-223	ENST00000627440	REEP2	Q9BRK0	252 aa		5.85	□□□□□ -1.47
SNAP23-223	ENST00000627440	CBWD1	Q9BRT8	395 aa		5.85	□□□□□ -1.47
SNAP23-223	ENST00000627440	CNPPD1	Q9BV87	410 aa		5.85	□□□□□ -1.47
SNAP23-223	ENST00000627440	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		5.85	□□□□□ -1.47
SNAP23-223	ENST00000627440	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		5.85	□□□□□ -1.47
SNAP23-223	ENST00000627440	ASB8	Q9H765	288 aa		5.85	□□□□□ -1.47
SNAP23-223	ENST00000627440	CNGB3	Q9NQW8	809 aa		5.85	□□□□□ -1.47
SNAP23-223	ENST00000627440	ACSS1	Q9NUB1	689 aa	Predicted RBP	5.85	□□□□□ -1.47
SNAP23-223	ENST00000627440	RPUSD1	Q9UJJ7	312 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
SNAP23-223	ENST00000627440	C3orf18	Q9UK00	162 aa		5.85	□□□□□ -1.47
SNAP23-223	ENST00000627440	PPIAL4A	Q9Y536	164 aa		5.85	□□□□□ -1.47
SNAP23-223	ENST00000627440	PCYT1B	Q9Y5K3	369 aa	Predicted RBP	5.85	□□□□□ -1.47
SNAP23-223	ENST00000627440	LIPG	Q9Y5X9	500 aa		5.85	□□□□□ -1.47
SNAP23-223	ENST00000627440	DNAH3	Q8TD57	4116 aa		5.85	□□□□□ -1.47
SNAP23-223	ENST00000627440	DOCK4	Q8N1I0	1966 aa		5.84	□□□□□ -1.47
SNAP23-223	ENST00000627440	OR52A4P	A6NMU1	304 aa		5.84	□□□□□ -1.47
SNAP23-223	ENST00000627440		K7EIL1	84 aa		5.84	□□□□□ -1.47
SNAP23-223	ENST00000627440	ACOT7	O00154	380 aa		5.84	□□□□□ -1.47
SNAP23-223	ENST00000627440	SUSD5	O60279	629 aa		5.84	□□□□□ -1.47
SNAP23-223	ENST00000627440	S1PR4	O95977	384 aa		5.84	□□□□□ -1.47
SNAP23-223	ENST00000627440	PLAU	P00749	431 aa		5.84	□□□□□ -1.47
SNAP23-223	ENST00000627440	MCM7	P33993	719 aa		5.84	□□□□□ -1.47
SNAP23-223	ENST00000627440	LONP1	P36776	959 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
SNAP23-223	ENST00000627440	GEMIN4	P57678	1058 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
SNAP23-223	ENST00000627440	TMPRSS15	P98073	1019 aa		5.84	□□□□□ -1.47
SNAP23-223	ENST00000627440	KLC1	Q07866	573 aa		5.84	□□□□□ -1.47
SNAP23-223	ENST00000627440	AP1B1	Q10567	949 aa		5.84	□□□□□ -1.47
SNAP23-223	ENST00000627440	TAF9	Q16594	264 aa		5.84	□□□□□ -1.47
SNAP23-223	ENST00000627440	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		5.84	□□□□□ -1.47
SNAP23-223	ENST00000627440	AFMID	Q63HM1	303 aa		5.84	□□□□□ -1.47
SNAP23-223	ENST00000627440	SH2D5	Q6ZV89	423 aa		5.84	□□□□□ -1.47
SNAP23-223	ENST00000627440	GPSM1	Q86YR5	675 aa		5.84	□□□□□ -1.47
SNAP23-223	ENST00000627440	GALNT12	Q8IXK2	581 aa		5.84	□□□□□ -1.47
SNAP23-223	ENST00000627440	PRSS58	Q8IYP2	241 aa		5.84	□□□□□ -1.47
SNAP23-223	ENST00000627440	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		5.84	□□□□□ -1.47
SNAP23-223	ENST00000627440	C10orf105	Q8TEF2	133 aa		5.84	□□□□□ -1.47
SNAP23-223	ENST00000627440	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		5.84	□□□□□ -1.47
SNAP23-223	ENST00000627440	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		5.84	□□□□□ -1.47
SNAP23-223	ENST00000627440	FAF2	Q96CS3	445 aa		5.84	□□□□□ -1.47
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	5.84	□□□□□ -1.47
SNAP23-223	ENST00000627440	THAP11	Q96EK4	314 aa		5.84	□□□□□ -1.47
SNAP23-223	ENST00000627440	ZC3HAV1L	Q96H79	300 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
SNAP23-223	ENST00000627440	CAPZA3	Q96KX2	299 aa		5.84	□□□□□ -1.47
SNAP23-223	ENST00000627440	COQ10A	Q96MF6	247 aa		5.84	□□□□□ -1.47
SNAP23-223	ENST00000627440	FIZ1	Q96SL8	496 aa		5.84	□□□□□ -1.47
SNAP23-223	ENST00000627440	ALG2	Q9H553	416 aa		5.84	□□□□□ -1.47
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF703	Q9H7S9	590 aa	Predicted RBP	5.84	□□□□□ -1.47
SNAP23-223	ENST00000627440	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
SNAP23-223	ENST00000627440	KLC4	Q9NSK0	619 aa		5.84	□□□□□ -1.47
SNAP23-223	ENST00000627440	RNF112	Q9ULX5	631 aa		5.84	□□□□□ -1.47
SNAP23-223	ENST00000627440	KIAA1549	Q9HCM3	1950 aa		5.84	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440		A0A1W2PP18	115 aa		5.83	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440		A0A1W2PQ72	361 aa		5.83	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440		A8MX80	341 aa		5.83	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	TULP2	O00295	520 aa		5.83	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	XPO1	O14980	1071 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	CD160	O95971	181 aa		5.83	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	BCL10	O95999	233 aa		5.83	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	CSF3	P09919	207 aa		5.83	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	LCP1	P13796	627 aa		5.83	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	XBP1	P17861	261 aa		5.83	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	CTSS	P25774	331 aa		5.83	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	TIMP3	P35625	211 aa		5.83	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	CPOX	P36551	454 aa		5.83	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF131	P52739	623 aa		5.83	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	WNT3	P56703	355 aa		5.83	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	IL17A	Q16552	155 aa		5.83	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	ATP13A4	Q4VNC1	1196 aa		5.83	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	BEX5	Q5H9J7	111 aa		5.83	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	RNF20	Q5VTR2	975 aa		5.83	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	DENND2C	Q68D51	928 aa		5.83	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	ZFAND6	Q6FIF0	208 aa		5.83	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	KDELC1	Q6UW63	502 aa		5.83	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	CDHR3	Q6ZTQ4	885 aa		5.83	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	KIAA0408	Q6ZU52	694 aa		5.83	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	COX15	Q7KZN9	410 aa		5.83	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	DPPA4	Q7L190	304 aa		5.83	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	TFAP2D	Q7Z6R9	452 aa		5.83	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	CBWD2	Q8IUF1	395 aa		5.83	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	CRLF3	Q8IUI8	442 aa		5.83	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	SULF2	Q8IWU5	870 aa		5.83	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	SCML4	Q8N228	414 aa		5.83	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	PAF1	Q8N7H5	531 aa		5.83	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	ZFP62	Q8NB50	900 aa	Predicted RBP	5.83	□□□□□ -1.48

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