RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618610.1

PTPRT-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 3,230 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-211ENST00000618610 NME7Q9Y5B8 376 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 SCN1AP35498 2009 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 DPYSL4O14531 572 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 GSTA4O15217 222 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 EDNRBP24530 442 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 GLUD2P49448 558 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 DGKQP52824 942 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 KCNK10P57789 538 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF45Q02386 682 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 GNA13Q14344 377 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 GALNT3Q14435 633 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 GBX1Q14549 363 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 PTPRCAPQ14761 206 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 GPR68Q15743 365 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 PRMT9Q6P2P2 845 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 ARSKQ6UWY0 536 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 DET1Q7L5Y6 550 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 PRSS48Q7RTY5 328 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 VN1R5Q7Z5H4 357 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM199Q8N511 208 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 ZFAND1Q8TCF1 268 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 TWIST2Q8WVJ9 160 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 NCLNQ969V3 563 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 NAT9Q9BTE0 207 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 KIFC1Q9BW19 673 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 CCSER2Q9H7U1 834 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 VNN3Q9NY84 501 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 FLRT1Q9NZU1 646 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 ATPIF1Q9UII2 106 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 KCNH4Q9UQ05 1017 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 CASTOR2A6NHX0 329 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 M0R082 166 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 M0R129 80 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 UBXN8O00124 270 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 TREHO43280 583 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 SERPINI2O75830 405 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 CYP11A1P05108 521 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 LGALS2P05162 132 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 OR4Q2P0C623 313 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 RAP2AP10114 183 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 BMP1P13497 986 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 TNNI3P19429 210 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 MYL9P24844 172 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 ACVR2AP27037 513 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 TNFSF8P32971 234 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 KRT20P35900 424 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 HNF4AP41235 474 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 CTSKP43235 329 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 SCNN1GP51170 649 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 C5orf22Q49AR2 442 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 TMC8Q8IU68 726 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 OR52K2Q8NGK3 314 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 GPR151Q8TDV0 419 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 SLC38A4Q969I6 547 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 TESCQ96BS2 214 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 PTPN18Q99952 460 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 GON7Q9BXV9 100 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 GSTO2Q9H4Y5 243 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 BRD7Q9NPI1 651 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 CASS4Q9NQ75 786 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 USE1Q9NZ43 259 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 NUP50Q9UKX7 468 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 TPRKBQ9Y3C4 175 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 COL6A3P12111 3177 aa8.02□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 MUC3AQ02505 3323 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 OR2A25A4D2G3 310 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 TEX46H3BTG2 121 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 NFKB1P19838 968 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 SDHBP21912 280 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 EVI2BP34910 448 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 B2MP61769 119 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 TIGD6Q17RP2 521 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 NOMO2Q5JPE7 1267 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 CXCL17Q6UXB2 119 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 LIPIQ6XZB0 460 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 TLK2Q86UE8 772 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 PIM3Q86V86 326 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 LINC00469Q8N7U9 141 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 SPATA22Q8NHS9 363 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 RAET1EQ8TD07 263 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP8.02□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 DPF3Q92784 378 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 RNF34Q969K3 372 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 ESAMQ96AP7 390 aa8.02□□□□□ -1.13
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