RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618056.4

PMS1-220, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 1,468 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-220ENST00000618056 CBLBQ13191 982 aa24.08■■□□□ 1.45
PMS1-220ENST00000618056 ZNF549Q6P9A3 640 aa24.08■■□□□ 1.45
PMS1-220ENST00000618056 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
PMS1-220ENST00000618056 CNTN4Q8IWV2 1026 aa24.08■■□□□ 1.45
PMS1-220ENST00000618056 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
PMS1-220ENST00000618056 BBOF1Q8ND07 529 aa24.08■■□□□ 1.45
PMS1-220ENST00000618056 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa24.08■■□□□ 1.45
PMS1-220ENST00000618056 KCNJ9Q92806 393 aa24.08■■□□□ 1.45
PMS1-220ENST00000618056 FAM136AQ96C01 138 aa24.08■■□□□ 1.45
PMS1-220ENST00000618056 FOPNLQ96NB1 174 aa24.08■■□□□ 1.45
PMS1-220ENST00000618056 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa24.08■■□□□ 1.45
PMS1-220ENST00000618056 CCDC68Q9H2F9 335 aa24.08■■□□□ 1.45
PMS1-220ENST00000618056 PLAC1Q9HBJ0 212 aa24.08■■□□□ 1.45
PMS1-220ENST00000618056 SYTL2Q9HCH5 934 aa24.08■■□□□ 1.45
PMS1-220ENST00000618056 SPHK1Q9NYA1 384 aa24.08■■□□□ 1.45
PMS1-220ENST00000618056 GALPQ9UBC7 116 aa24.08■■□□□ 1.45
PMS1-220ENST00000618056 PLAGL1Q9UM63 463 aa24.08■■□□□ 1.45
PMS1-220ENST00000618056 MED16Q9Y2X0 877 aa24.08■■□□□ 1.45
PMS1-220ENST00000618056 SNX24Q9Y343 169 aa24.08■■□□□ 1.45
PMS1-220ENST00000618056 ATRXP46100 2492 aa24.08■■□□□ 1.44
PMS1-220ENST00000618056 ANKRD12Q6UB98 2062 aa24.08■■□□□ 1.44
PMS1-220ENST00000618056 F7P08709 466 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
PMS1-220ENST00000618056 ERVK-10P10266 1014 aa24.07■■□□□ 1.44
PMS1-220ENST00000618056 ST6GAL1P15907 406 aa24.07■■□□□ 1.44
PMS1-220ENST00000618056 UGT2B7P16662 529 aa24.07■■□□□ 1.44
PMS1-220ENST00000618056 ZNF28P17035 718 aa24.07■■□□□ 1.44
PMS1-220ENST00000618056 KIR2DS3Q14952 304 aa24.07■■□□□ 1.44
PMS1-220ENST00000618056 STEAP4Q687X5 459 aa24.07■■□□□ 1.44
PMS1-220ENST00000618056 ESX1Q8N693 406 aa24.07■■□□□ 1.44
PMS1-220ENST00000618056 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
PMS1-220ENST00000618056 RAD51AP1Q96B01 352 aa24.07■■□□□ 1.44
PMS1-220ENST00000618056 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
PMS1-220ENST00000618056 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
PMS1-220ENST00000618056 ERP44Q9BS26 406 aa24.07■■□□□ 1.44
PMS1-220ENST00000618056 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
PMS1-220ENST00000618056 NFS1Q9Y697 457 aa24.07■■□□□ 1.44
PMS1-220ENST00000618056 KALRNO60229 2985 aa24.07■■□□□ 1.44
PMS1-220ENST00000618056 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa24.07■■□□□ 1.44
PMS1-220ENST00000618056 E7ESA3 106 aa24.07■■□□□ 1.44
PMS1-220ENST00000618056 RAD51CO43502 376 aa24.07■■□□□ 1.44
PMS1-220ENST00000618056 HAUS5O94927 633 aa24.07■■□□□ 1.44
PMS1-220ENST00000618056 C1orf105O95561 183 aa24.07■■□□□ 1.44
PMS1-220ENST00000618056 CCNFP41002 786 aa24.07■■□□□ 1.44
PMS1-220ENST00000618056 MPP1Q00013 466 aa24.07■■□□□ 1.44
PMS1-220ENST00000618056 RHDQ02161 417 aa24.07■■□□□ 1.44
PMS1-220ENST00000618056 C2orf54Q08AI8 447 aa24.07■■□□□ 1.44
PMS1-220ENST00000618056 TTC23LQ6PF05 361 aa24.07■■□□□ 1.44
PMS1-220ENST00000618056 KIAA0408Q6ZU52 694 aa24.07■■□□□ 1.44
PMS1-220ENST00000618056 LINC01555Q8NAE3 123 aa24.07■■□□□ 1.44
PMS1-220ENST00000618056 CERS2Q96G23 380 aa24.07■■□□□ 1.44
PMS1-220ENST00000618056 ELMO2Q96JJ3 720 aa24.07■■□□□ 1.44
PMS1-220ENST00000618056 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
PMS1-220ENST00000618056 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa24.07■■□□□ 1.44
PMS1-220ENST00000618056 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa24.07■■□□□ 1.44
PMS1-220ENST00000618056 WHRNQ9P202 907 aa24.07■■□□□ 1.44
PMS1-220ENST00000618056 CHMP2BQ9UQN3 213 aa24.07■■□□□ 1.44
PMS1-220ENST00000618056 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa24.07■■□□□ 1.44
PMS1-220ENST00000618056 MAP3K7O43318 606 aa24.06■■□□□ 1.44
PMS1-220ENST00000618056 KIAA0754O94854 1291 aa24.06■■□□□ 1.44
PMS1-220ENST00000618056 WT1P19544 449 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
PMS1-220ENST00000618056 CD9P21926 228 aa24.06■■□□□ 1.44
PMS1-220ENST00000618056 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
PMS1-220ENST00000618056 GPR19Q15760 415 aa24.06■■□□□ 1.44
PMS1-220ENST00000618056 TTLL9Q3SXZ7 439 aa24.06■■□□□ 1.44
PMS1-220ENST00000618056 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa24.06■■□□□ 1.44
PMS1-220ENST00000618056 CNSTQ6PJW8 725 aa24.06■■□□□ 1.44
PMS1-220ENST00000618056 NEK10Q6ZWH5 1172 aa24.06■■□□□ 1.44
PMS1-220ENST00000618056 GALNT7Q86SF2 657 aa24.06■■□□□ 1.44
PMS1-220ENST00000618056 OR2L8Q8NGY9 312 aa24.06■■□□□ 1.44
PMS1-220ENST00000618056 MAGEC3Q8TD91 643 aa24.06■■□□□ 1.44
PMS1-220ENST00000618056 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
PMS1-220ENST00000618056 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa24.05■■□□□ 1.44
PMS1-220ENST00000618056 RASGRF2O14827 1237 aa24.05■■□□□ 1.44
PMS1-220ENST00000618056 TIAF1O95411 115 aa24.05■■□□□ 1.44
PMS1-220ENST00000618056 LIFP15018 202 aa24.05■■□□□ 1.44
PMS1-220ENST00000618056 PVRP15151 417 aa24.05■■□□□ 1.44
PMS1-220ENST00000618056 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
PMS1-220ENST00000618056 STAT5AP42229 794 aa24.05■■□□□ 1.44
PMS1-220ENST00000618056 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
PMS1-220ENST00000618056 SLC5A12Q1EHB4 618 aa24.05■■□□□ 1.44
PMS1-220ENST00000618056 ACSBG2Q5FVE4 666 aa24.05■■□□□ 1.44
PMS1-220ENST00000618056 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
PMS1-220ENST00000618056 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
PMS1-220ENST00000618056 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa24.05■■□□□ 1.44
PMS1-220ENST00000618056 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
PMS1-220ENST00000618056 SLC30A3Q99726 388 aa24.05■■□□□ 1.44
PMS1-220ENST00000618056 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
PMS1-220ENST00000618056 FANCEQ9HB96 536 aa24.05■■□□□ 1.44
PMS1-220ENST00000618056 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa24.05■■□□□ 1.44
PMS1-220ENST00000618056 DHRS7Q9Y394 339 aa24.05■■□□□ 1.44
PMS1-220ENST00000618056 A0A0J9YY10 115 aa24.04■■□□□ 1.44
PMS1-220ENST00000618056 MT-ND3P03897 115 aa24.04■■□□□ 1.44
PMS1-220ENST00000618056 CALCOCO2Q13137 446 aa24.04■■□□□ 1.44
PMS1-220ENST00000618056 KLHL38Q2WGJ6 581 aa24.04■■□□□ 1.44
PMS1-220ENST00000618056 DUPD1Q68J44 220 aa24.04■■□□□ 1.44
PMS1-220ENST00000618056 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
PMS1-220ENST00000618056 GALNT6Q8NCL4 622 aa24.04■■□□□ 1.44
PMS1-220ENST00000618056 GIMAP7Q8NHV1 300 aa24.04■■□□□ 1.44
PMS1-220ENST00000618056 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
PMS1-220ENST00000618056 SLC22A18Q96BI1 424 aa24.04■■□□□ 1.44
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