RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617958.4

CPEB1-215, Transcript of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 1, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene CPEB1, Length 2,776 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CPEB1-215	ENST00000617958	SYT16	Q17RD7	645 aa		10.5	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	BTBD16	Q32M84	506 aa		10.5	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	LAMTOR1	Q6IAA8	161 aa		10.5	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	TMEM65	Q6PI78	240 aa		10.5	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	DENND6A	Q8IWF6	608 aa		10.5	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	SLC35F5	Q8WV83	523 aa		10.5	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	MYDGF	Q969H8	173 aa		10.5	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	PMEPA1	Q969W9	287 aa		10.5	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	GIMAP5	Q96F15	307 aa		10.5	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	TUBB1	Q9H4B7	451 aa		10.5	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	ING3	Q9NXR8	418 aa		10.5	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958		V9GYH0	126 aa		10.5	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958		A0A0G2JMZ2	1700 aa		10.5	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		10.5	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	VPS26A	O75436	327 aa		10.5	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	MAGEA2	P43356	314 aa		10.5	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	KCNC1	P48547	511 aa		10.5	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	NRIP1	P48552	1158 aa		10.5	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	CD83	Q01151	205 aa		10.5	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	RGS1	Q08116	209 aa		10.5	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	PRKG2	Q13237	762 aa		10.5	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	CTBP1	Q13363	440 aa		10.5	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	XKR7	Q5GH72	579 aa		10.5	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	IER5	Q5VY09	327 aa		10.5	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	ENPP6	Q6UWR7	440 aa		10.5	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	RPS27L	Q71UM5	84 aa	Known RBP	10.5	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	PRSS42	Q7Z5A4	293 aa		10.5	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	TMEM179B	Q7Z7N9	219 aa		10.5	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	KRT73	Q86Y46	540 aa		10.5	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	ZNF548	Q8NEK5	533 aa	Predicted RBP	10.5	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	ZC3HAV1L	Q96H79	300 aa	Known RBP	10.5	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	CRELD1	Q96HD1	420 aa		10.5	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	CAPNS2	Q96L46	248 aa		10.5	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	HYLS1	Q96M11	299 aa		10.5	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	ZNF583	Q96ND8	569 aa		10.5	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	TMEM209	Q96SK2	561 aa		10.5	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	SRR	Q9GZT4	340 aa		10.5	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	FAM25E	A8MYX2	175 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	ZBTB24	O43167	697 aa	Predicted RBP	10.49	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	PROM1	O43490	865 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	TSPAN12	O95859	305 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	CCNC	P24863	283 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	RPL34	P49207	117 aa	Known RBP	10.49	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	CPT1A	P50416	773 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	PLK1	P53350	603 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	DIO3	P55073	304 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	PWP1	Q13610	501 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	CAPS	Q13938	189 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	KCNC3	Q14003	757 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	STXBP2	Q15833	593 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	GOLGA7B	Q2TAP0	167 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	SLC35F1	Q5T1Q4	408 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	ARHGAP36	Q6ZRI8	547 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	ARMCX2	Q7L311	632 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	ABI1	Q8IZP0	508 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	OR2T12	Q8NG77	320 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	TNIP3	Q96KP6	325 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	DCLRE1C	Q96SD1	692 aa	Known RBP	10.49	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	NT5C1A	Q9BXI3	368 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	ERVMER34-1	Q9H9K5	563 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	SMURF1	Q9HCE7	757 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	MID1IP1	Q9NPA3	183 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	OLA1	Q9NTK5	396 aa	Known RBP	10.49	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	WDR70	Q9NW82	654 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	SLAMF8	Q9P0V8	285 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	ADGRE2	Q9UHX3	823 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	GABRQ	Q9UN88	632 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958		C9JVG2	144 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	KCNK1	O00180	336 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	STX16	O14662	325 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	ZNF623	O75123	536 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	RECQL5	O94762	991 aa	Predicted RBP	10.49	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	HMGCL	P35914	325 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	ERVK-8	P63133	956 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	GALE	Q14376	348 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	GARNL3	Q5VVW2	1013 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	KIAA1614	Q5VZ46	1190 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	CPZ	Q66K79	652 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	ANKRD34A	Q69YU3	496 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	GPR149	Q86SP6	731 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	CYP4Z1	Q86W10	505 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	FAM86B1	Q8N7N1	296 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	LINC00469	Q8N7U9	141 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	PPHLN1	Q8NEY8	458 aa	Known RBP	10.49	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	TTL	Q8NG68	377 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	TEX37	Q96LM6	180 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	GPR137	Q96N19	417 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	MCCC1	Q96RQ3	725 aa	Predicted RBP	10.49	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	PRKD2	Q9BZL6	878 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	SCPEP1	Q9HB40	452 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	10.49	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	PAK6	Q9NQU5	681 aa	Predicted RBP	10.49	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	TREX1	Q9NSU2	369 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	DCAF13	Q9NV06	445 aa	Known RBP	10.49	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	LIMD1	Q9UGP4	676 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	PSORS1C1	Q9UIG5	152 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	OR5K4	A6NMS3	321 aa		10.48	□□□□□ -0.73

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