RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616768.4

MLH1-223, Transcript of mutL homolog 1, human

TSL 2

Gene MLH1, Length 721 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MLH1-223	ENST00000616768	TRRAP	Q9Y4A5	3859 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	ITIH6	Q6UXX5	1313 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	FAM92A	A1XBS5	289 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	LINC01548	A6NM66	108 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	TARM1	B6A8C7	271 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	RNF103	O00237	685 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	POLR1C	O15160	346 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	TBL1X	O60907	577 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	KIAA0754	O94854	1291 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	TMEM63A	O94886	807 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	SLCO2B1	O94956	709 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	TJP3	O95049	919 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	SYT1	P21579	422 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	LMO1	P25800	156 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	RPA1	P27694	616 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	CA5A	P35218	305 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	GNL1	P36915	607 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	CA7	P43166	264 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	ALDH9A1	P49189	494 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF134	P52741	427 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	SMS	P52788	366 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	SOX8	P57073	446 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	PFN3	P60673	137 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	MAPK7	Q13164	816 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	GTF2H3	Q13889	308 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	KCNAB1	Q14722	419 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	LONRF1	Q17RB8	773 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	DEFB113	Q30KQ7	82 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	VWA5B1	Q5TIE3	1220 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	FAM46C	Q5VWP2	391 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	MTFR2	Q6P444	385 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	GFRAL	Q6UXV0	394 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768		Q6ZS92	163 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	C1QL2	Q7Z5L3	287 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	MFN1	Q8IWA4	741 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	TMEM161B	Q8NDZ6	487 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	FAM46D	Q8NEK8	389 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	OR4D9	Q8NGE8	314 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	OR8D1	Q8WZ84	308 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	SNX21	Q969T3	373 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	TTC17	Q96AE7	1141 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	TMA16	Q96EY4	203 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	RMND5B	Q96G75	393 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	ELMO2	Q96JJ3	720 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	TBATA	Q96M53	351 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	POLDIP3	Q9BY77	421 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	SLC17A9	Q9BYT1	436 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	ASB7	Q9H672	318 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	SERHL	Q9NQF3	203 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	OLAH	Q9NV23	265 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	DDX56	Q9NY93	547 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	IL37	Q9NZH6	218 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	IP6K2	Q9UHH9	426 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	CLIC4	Q9Y696	253 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	PIKFYVE	Q9Y2I7	2098 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	DYSF	O75923	2080 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768		A0A0U1RQS6	177 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	RHPN2P1	A8MT19	583 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	TISP43	B9A030	160 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768		E9PMD0	336 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	KPNA3	O00505	521 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	NUDT21	O43809	227 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	BEST1	O76090	585 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	JTB	O76095	146 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	LATS1	O95835	1130 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	CELA2A	P08217	269 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	PLEK	P08567	350 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	FAM163B	P0C2L3	166 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF18	P17022	549 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	WARS	P23381	471 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	PRPH	P41219	470 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	ARFIP2	P53365	341 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	OTUD4	Q01804	1114 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	CDC16	Q13042	620 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	KYAT1	Q16773	422 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	ALG11	Q2TAA5	492 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	HYI	Q5T013	277 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	C10orf62	Q5T681	223 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	FAM69B	Q5VUD6	431 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	CES4A	Q5XG92	561 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	KCTD16	Q68DU8	428 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	NEK5	Q6P3R8	708 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	RFWD3	Q6PCD5	774 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	FAM199X	Q6PEV8	388 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	CSGALNACT2	Q8N6G5	542 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	ZMIZ2	Q8NF64	920 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64

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