RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590509.5

PTPRS-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRS, Length 893 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-208ENST00000590509 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
PTPRS-208ENST00000590509 FCRL5Q96RD9 977 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRS-208ENST00000590509 EPS8L2Q9H6S3 715 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRS-208ENST00000590509 MVB12BQ9H7P6 319 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRS-208ENST00000590509 EURLQ9NYK6 297 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRS-208ENST00000590509 HACD3Q9P035 362 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRS-208ENST00000590509 PRSS21Q9Y6M0 314 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRS-208ENST00000590509 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa15.35■□□□□ 0.05
PTPRS-208ENST00000590509 A0A0J9YY10 115 aa15.35■□□□□ 0.05
PTPRS-208ENST00000590509 ZNHIT1O43257 154 aa15.35■□□□□ 0.05
PTPRS-208ENST00000590509 ONECUT2O95948 504 aa15.35■□□□□ 0.05
PTPRS-208ENST00000590509 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
PTPRS-208ENST00000590509 MAGP20916 626 aa15.35■□□□□ 0.05
PTPRS-208ENST00000590509 GRIA3P42263 894 aa15.35■□□□□ 0.05
PTPRS-208ENST00000590509 PMP22Q01453 160 aa15.35■□□□□ 0.05
PTPRS-208ENST00000590509 NR1I3Q14994 352 aa15.35■□□□□ 0.05
PTPRS-208ENST00000590509 TLDC1Q6P9B6 456 aa15.35■□□□□ 0.05
PTPRS-208ENST00000590509 NDC1Q9BTX1 674 aa15.35■□□□□ 0.05
PTPRS-208ENST00000590509 FICDQ9BVA6 458 aa15.35■□□□□ 0.05
PTPRS-208ENST00000590509 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa15.35■□□□□ 0.05
PTPRS-208ENST00000590509 ZNF160Q9HCG1 818 aa15.35■□□□□ 0.05
PTPRS-208ENST00000590509 IRAK4Q9NWZ3 460 aa15.35■□□□□ 0.05
PTPRS-208ENST00000590509 PTGFRNQ9P2B2 879 aa15.35■□□□□ 0.05
PTPRS-208ENST00000590509 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
PTPRS-208ENST00000590509 CIDEBQ9UHD4 219 aa15.35■□□□□ 0.05
PTPRS-208ENST00000590509 CRLS1Q9UJA2 301 aa15.35■□□□□ 0.05
PTPRS-208ENST00000590509 PLCL2Q9UPR0 1127 aa15.35■□□□□ 0.05
PTPRS-208ENST00000590509 MAU2Q9Y6X3 613 aa15.35■□□□□ 0.05
PTPRS-208ENST00000590509 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
PTPRS-208ENST00000590509 CACNA1CQ13936 2221 aa15.34■□□□□ 0.05
PTPRS-208ENST00000590509 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa15.34■□□□□ 0.05
PTPRS-208ENST00000590509 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa15.34■□□□□ 0.05
PTPRS-208ENST00000590509 ZNF487B1APH4 448 aa15.34■□□□□ 0.05
PTPRS-208ENST00000590509 MAP3K7O43318 606 aa15.34■□□□□ 0.05
PTPRS-208ENST00000590509 NRP2O60462 931 aa15.34■□□□□ 0.05
PTPRS-208ENST00000590509 KRT1P04264 644 aa15.34■□□□□ 0.05
PTPRS-208ENST00000590509 SERPING1P05155 500 aa15.34■□□□□ 0.05
PTPRS-208ENST00000590509 ACADLP28330 430 aa15.34■□□□□ 0.05
PTPRS-208ENST00000590509 SOX11P35716 441 aa15.34■□□□□ 0.05
PTPRS-208ENST00000590509 CD151P48509 253 aa15.34■□□□□ 0.05
PTPRS-208ENST00000590509 TNFSF10P50591 281 aa15.34■□□□□ 0.05
PTPRS-208ENST00000590509 BRD3Q15059 726 aa15.34■□□□□ 0.05
PTPRS-208ENST00000590509 FCRL6Q6DN72 434 aa15.34■□□□□ 0.05
PTPRS-208ENST00000590509 PID1Q7Z2X4 250 aa15.34■□□□□ 0.05
PTPRS-208ENST00000590509 PRSS58Q8IYP2 241 aa15.34■□□□□ 0.05
PTPRS-208ENST00000590509 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
PTPRS-208ENST00000590509 SIRT6Q8N6T7 355 aa15.34■□□□□ 0.05
PTPRS-208ENST00000590509 CPLX3Q8WVH0 158 aa15.34■□□□□ 0.05
PTPRS-208ENST00000590509 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP15.34■□□□□ 0.05
PTPRS-208ENST00000590509 FKBP10Q96AY3 582 aa15.34■□□□□ 0.05
PTPRS-208ENST00000590509 HAUS1Q96CS2 278 aa15.34■□□□□ 0.05
PTPRS-208ENST00000590509 LMF1Q96S06 567 aa15.34■□□□□ 0.05
PTPRS-208ENST00000590509 CHST11Q9NPF2 352 aa15.34■□□□□ 0.05
PTPRS-208ENST00000590509 CHMP5Q9NZZ3 219 aa15.34■□□□□ 0.05
PTPRS-208ENST00000590509 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
PTPRS-208ENST00000590509 A0A1B0GX78 115 aa15.33■□□□□ 0.04
PTPRS-208ENST00000590509 VSTM2BA6NLU5 285 aa15.33■□□□□ 0.04
PTPRS-208ENST00000590509 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.04
PTPRS-208ENST00000590509 CD63P08962 238 aa15.33■□□□□ 0.04
PTPRS-208ENST00000590509 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.04
PTPRS-208ENST00000590509 PBX1P40424 430 aa15.33■□□□□ 0.04
PTPRS-208ENST00000590509 ARG2P78540 354 aa15.33■□□□□ 0.04
PTPRS-208ENST00000590509 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.04
PTPRS-208ENST00000590509 RBBP7Q16576 425 aa15.33■□□□□ 0.04
PTPRS-208ENST00000590509 C3AR1Q16581 482 aa15.33■□□□□ 0.04
PTPRS-208ENST00000590509 VWA2Q5GFL6 755 aa15.33■□□□□ 0.04
PTPRS-208ENST00000590509 FIGNQ5HY92 759 aa15.33■□□□□ 0.04
PTPRS-208ENST00000590509 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa15.33■□□□□ 0.04
PTPRS-208ENST00000590509 LAPTM4BQ86VI4 370 aa15.33■□□□□ 0.04
PTPRS-208ENST00000590509 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.04
PTPRS-208ENST00000590509 LINC01555Q8NAE3 123 aa15.33■□□□□ 0.04
PTPRS-208ENST00000590509 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.04
PTPRS-208ENST00000590509 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa15.33■□□□□ 0.04
PTPRS-208ENST00000590509 COG1Q8WTW3 980 aa15.33■□□□□ 0.04
PTPRS-208ENST00000590509 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.04
PTPRS-208ENST00000590509 DCUN1D1Q96GG9 259 aa15.33■□□□□ 0.04
PTPRS-208ENST00000590509 SLC26A1Q9H2B4 701 aa15.33■□□□□ 0.04
PTPRS-208ENST00000590509 WDR54Q9H977 334 aa15.33■□□□□ 0.04
PTPRS-208ENST00000590509 TINAGQ9UJW2 476 aa15.33■□□□□ 0.04
PTPRS-208ENST00000590509 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.04
PTPRS-208ENST00000590509 KLHL33A6NCF5 533 aa15.32■□□□□ 0.04
PTPRS-208ENST00000590509 ISM1B1AKI9 464 aa15.32■□□□□ 0.04
PTPRS-208ENST00000590509 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP15.32■□□□□ 0.04
PTPRS-208ENST00000590509 KCNN4O15554 427 aa15.32■□□□□ 0.04
PTPRS-208ENST00000590509 PYGMP11217 842 aa15.32■□□□□ 0.04
PTPRS-208ENST00000590509 TNNT1P13805 278 aa15.32■□□□□ 0.04
PTPRS-208ENST00000590509 ADRA1AP35348 466 aa15.32■□□□□ 0.04
PTPRS-208ENST00000590509 ST13P50502 369 aaKnown RBP15.32■□□□□ 0.04
PTPRS-208ENST00000590509 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP15.32■□□□□ 0.04
PTPRS-208ENST00000590509 EFNA3P52797 238 aa15.32■□□□□ 0.04
PTPRS-208ENST00000590509 TYRO3Q06418 890 aa15.32■□□□□ 0.04
PTPRS-208ENST00000590509 MPP3Q13368 585 aa15.32■□□□□ 0.04
PTPRS-208ENST00000590509 SLC5A12Q1EHB4 618 aa15.32■□□□□ 0.04
PTPRS-208ENST00000590509 TMEM207Q6UWW9 146 aa15.32■□□□□ 0.04
PTPRS-208ENST00000590509 RANBP10Q6VN20 620 aa15.32■□□□□ 0.04
PTPRS-208ENST00000590509 CDH24Q86UP0 819 aa15.32■□□□□ 0.04
PTPRS-208ENST00000590509 HOOK3Q86VS8 718 aa15.32■□□□□ 0.04
PTPRS-208ENST00000590509 PIANPQ8IYJ0 282 aa15.32■□□□□ 0.04
PTPRS-208ENST00000590509 NACC2Q96BF6 587 aa15.32■□□□□ 0.04
PTPRS-208ENST00000590509 COPS8Q99627 209 aa15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms