RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589528.1

ACTN4-211, Transcript of actinin alpha 4, humanhuman

TSL 2

Gene ACTN4, Length 441 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4-211ENST00000589528 MC4RP32245 332 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTN4-211ENST00000589528 ARSFP54793 590 aa14.66□□□□□ -0.06
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ACTN4-211ENST00000589528 GPR33Q49SQ1 333 aa14.66□□□□□ -0.06
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ACTN4-211ENST00000589528 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
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ACTN4-211ENST00000589528 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
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