RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582232.1

GGA3-211, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 2

Gene GGA3, Length 598 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-211	ENST00000582232	LY6G6E	A0A0G2JKS1	128 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	FAM221B	A6H8Z2	402 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	LILRA5	A6NI73	299 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	TK2	O00142	265 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	PPM1D	O15297	605 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	ZWINT	O95229	277 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	TPBGL	P0DKB5	382 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	GLB1	P16278	677 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	GGT5	P36269	586 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	ETV4	P43268	484 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	GPR3	P46089	330 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	BDKRB1	P46663	353 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	HNMT	P50135	292 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	LIMK1	P53667	647 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	MAZ	P56270	477 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	MPP2	Q14168	576 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	KRT33B	Q14525	404 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	CYP2A13	Q16696	494 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	PROX2	Q3B8N5	592 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	CCSMST1	Q4G0I0	132 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	AASDH	Q4L235	1098 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	DUS1L	Q6P1R4	473 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	C16orf46	Q6P387	395 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	TMEM26	Q6ZUK4	368 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	FRA10AC1	Q70Z53	315 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	TCAIM	Q8N3R3	496 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	EID2	Q8N6I1	236 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	OR52E1	Q8NGJ3	308 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	HMGCLL1	Q8TB92	370 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	DENND1A	Q8TEH3	1009 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	ATL1	Q8WXF7	558 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	FBXL8	Q96CD0	374 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	SCYL1	Q96KG9	808 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	PKP4	Q99569	1192 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	RAB11FIP5	Q9BXF6	653 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	LDHAL6B	Q9BYZ2	381 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	NUDT4	Q9NZJ9	180 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	MID2	Q9UJV3	735 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	PADI4	Q9UM07	663 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232		U3KQA8	63 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	ASXL3	Q9C0F0	2248 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	PRAMEF33	A0A0G2JMD5	474 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	TMEM120B	A0PK00	339 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	EME2	A4GXA9	379 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	PABPN1L	A6NDY0	278 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	C4orf47	A7E2U8	309 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	ZNF839	A8K0R7	811 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232		G3V2L1	256 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	SLC16A8	O95907	504 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	ANXA5	P08758	320 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	DHRS4L1	P0CG22	281 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	CKMT1A	P12532	417 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	TAC1	P20366	129 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	SHMT2	P34897	504 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	RAB28	P51157	221 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	EPHA4	P54764	986 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	NFKB2	Q00653	900 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	PRKG2	Q13237	762 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	GPR18	Q14330	331 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	NR0B2	Q15466	257 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	ANKS6	Q68DC2	871 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	SULT1C3	Q6IMI6	304 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	METTL2B	Q6P1Q9	378 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	ZYG11A	Q6WRX3	759 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	KLHDC8A	Q8IYD2	350 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	LRRC56	Q8IYG6	542 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	RAB42	Q8N4Z0	105 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	BAHD1	Q8TBE0	780 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	RHBDF1	Q96CC6	855 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	CCDC126	Q96EE4	140 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	FAM111A	Q96PZ2	611 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	HGH1	Q9BTY7	390 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	KCNK9	Q9NPC2	374 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	EVA1B	Q9NVM1	165 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	ARL15	Q9NXU5	204 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	UTP6	Q9NYH9	597 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	OR6C2	Q9NZP2	312 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	STOX2	Q9P2F5	926 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	CPSF2	Q9P2I0	782 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	SLC17A7	Q9P2U7	560 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	COPG2	Q9UBF2	871 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	LNPEP	Q9UIQ6	1025 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	PTBP2	Q9UKA9	531 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	ICK	Q9UPZ9	632 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	BTBD3	Q9Y2F9	522 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	TDRKH	Q9Y2W6	561 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	RP1	P56715	2156 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	PCNX2	A6NKB5	2137 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232		H3BQF6	201 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	STX16-NPEPL1	H3BU86	382 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	UBXN8	O00124	270 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	STX16	O14662	325 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	CBFA2T3	O75081	653 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	SMIM24	O75264	130 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	IPO13	O94829	963 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	GUCA1C	O95843	209 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	CPA3	P15088	417 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	ATP5F1	P24539	256 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	IMPA1	P29218	277 aa		11.16	□□□□□ -0.62

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