RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568870.1

TCF25-223, Transcript of transcription factor 25, human

TSL 2

Gene TCF25, Length 263 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF25-223	ENST00000568870	C4orf33	Q8N1A6	199 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	OR9A1P	Q8NGU1	263 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	OR10G6	Q8NH81	332 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	ANKRD7	Q92527	254 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	DLG3	Q92796	817 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	KIAA1191	Q96A73	305 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	PTER	Q96BW5	349 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	PKP4	Q99569	1192 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	NRTN	Q99748	197 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	EGFL8	Q99944	293 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	SLC12A9	Q9BXP2	914 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	ABCG4	Q9H172	646 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	SRMS	Q9H3Y6	488 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	TFB2M	Q9H5Q4	396 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	ZNF358	Q9NW07	568 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	ARL15	Q9NXU5	204 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	ICK	Q9UPZ9	632 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	ASXL3	Q9C0F0	2248 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	IGHV1OR21-1	A0A087WYE8	117 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	NCF1B	A6NI72	391 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	NCF1C	A8MVU1	366 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	MYO1C	O00159	1063 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	COPE	O14579	308 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	TM4SF5	O14894	197 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	GIPC1	O14908	333 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	DUX1	O43812	170 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	S100B	P04271	92 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	PROS1	P07225	676 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	GP1BA	P07359	652 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	ENO2	P09104	434 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	TPBGL	P0DKB5	382 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	NCF1	P14598	390 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	PKLR	P30613	574 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	RAB28	P51157	221 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	CCL7	P80098	99 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	SIM1	P81133	766 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	TSTA3	Q13630	321 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	GRB7	Q14451	532 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	NR1D2	Q14995	579 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	ACAP2	Q15057	778 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	OR4D1	Q15615	310 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	ARMC6	Q6NXE6	501 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	SBSN	Q6UWP8	590 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	TAX1BP1	Q86VP1	789 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	OOSP2	Q86WS3	158 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	GPSM1	Q86YR5	675 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	RASGRP3	Q8IV61	690 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	C2orf73	Q8N5S3	287 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	LMNTD1	Q8N9Z9	388 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	FBXO15	Q8NCQ5	510 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	STAG3L4	Q8TBR4	150 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	NCSTN	Q92542	709 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	RTKN	Q9BST9	563 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	RAB11FIP5	Q9BXF6	653 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	SPATA7	Q9P0W8	599 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	LNPEP	Q9UIQ6	1025 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	NOVA2	Q9UNW9	492 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	OARD1	Q9Y530	152 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	PCNX2	A6NKB5	2137 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	GSAP	A4D1B5	854 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	SUPT3H	B4E1H0	165 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	CASC3	O15234	703 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	B4GAT1	O43505	415 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	GLRA3	O75311	464 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	SUPT3H	O75486	399 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	CEACAM1	P13688	526 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	GPLD1	P80108	840 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	PRKAA1	Q13131	559 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	PPP1R3A	Q16821	1122 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	KLHL35	Q6PF15	583 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	USP53	Q70EK8	1073 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	GLRX5	Q86SX6	157 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	CLEC14A	Q86T13	490 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	ISCA2	Q86U28	154 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	SYTL1	Q8IYJ3	562 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	GOLGA6L1	Q8N7Z2	621 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	RSC1A1	Q92681	617 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	PGM2	Q96G03	612 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	CCDC138	Q96M89	665 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	GPR78	Q96P69	363 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	GFM1	Q96RP9	751 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	SMC6	Q96SB8	1091 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	IQCG	Q9H095	443 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	STMN4	Q9H169	189 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	LRRN3	Q9H3W5	708 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	VIPAS39	Q9H9C1	493 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	ABCF3	Q9NUQ8	709 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	HRASLS2	Q9NWW9	162 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	CD274	Q9NZQ7	290 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	DCDC2	Q9UHG0	476 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	ATXN7L1	Q9ULK2	861 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	UNC13C	Q8NB66	2214 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870		A0A1W2PQM1	296 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	PIPSL	A2A3N6	862 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	DCDC2B	A2VCK2	349 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	FAM221B	A6H8Z2	402 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	ZNF839	A8K0R7	811 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	BTN3A3	O00478	584 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	KERA	O60938	352 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	SPAG7	O75391	227 aa		13.47	□□□□□ -0.25

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