RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568530.5

PDPR-210, Transcript of pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDPR, Length 7,223 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPR-210ENST00000568530 SLC17A6Q9P2U8 582 aa8.3□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 ENOPH1Q9UHY7 261 aa8.3□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 ZNF221Q9UK13 617 aa8.3□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 ADAM28Q9UKQ2 775 aa8.3□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 SLC35F4A4IF30 521 aa8.3□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 SIGLEC16A6NMB1 481 aa8.3□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 HOXB2P14652 356 aa8.3□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 CASP7P55210 303 aa8.3□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 ARSKQ6UWY0 536 aa8.3□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 OR4C6Q8NH72 309 aa8.3□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 HEXDCQ8WVB3 486 aa8.3□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 ALPK1Q96QP1 1244 aa8.3□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 PHB2Q99623 299 aa8.3□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 IFT27Q9BW83 186 aa8.3□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 TPSD1Q9BZJ3 242 aa8.3□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 SERTAD3Q9UJW9 196 aa8.3□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 CCL22O00626 93 aa8.3□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 CXCL11O14625 94 aa8.3□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 DHX15O43143 795 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 GNRHRP30968 328 aa8.3□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 RTP1P59025 263 aa8.3□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 QPRTQ15274 297 aa8.3□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 CLEC6AQ6EIG7 209 aa8.3□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 KDELC1Q6UW63 502 aa8.3□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa8.3□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 PTF1AQ7RTS3 328 aa8.3□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 CERS2Q96G23 380 aa8.3□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 ADAP2Q9NPF8 381 aa8.3□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 TBC1D14Q9P2M4 693 aa8.3□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 ENSAO43768 121 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 NARSO43776 548 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 DGUOKQ16854 277 aa8.3□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 CPTPQ5TA50 214 aa8.3□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 ABHD13Q7L211 337 aa8.3□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 SPPL2CQ8IUH8 684 aa8.3□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 JOSD2Q8TAC2 188 aa8.3□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 SSR3Q9UNL2 185 aa8.3□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 RTCAO00442 366 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 METTL18O95568 372 aa8.3□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 PGRP06401 933 aa8.3□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 ALADP13716 330 aa8.3□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 TFEBP19484 476 aa8.3□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 FAUP35544 74 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 C1orf61Q13536 156 aa8.3□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 VPS26BQ4G0F5 336 aa8.3□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa8.3□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 FAM35AQ86V20 835 aa8.3□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 KREMEN2Q8NCW0 462 aa8.3□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 MSLNLQ96KJ4 702 aa8.3□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 Q96MT0 163 aa8.3□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 COPS8Q99627 209 aa8.3□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 BTBD1Q9H0C5 482 aa8.3□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 TBC1D17Q9HA65 648 aa8.3□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 SNX15Q9NRS6 342 aa8.3□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 MALT1Q9UDY8 824 aa8.3□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 FAM234BA2RU67 622 aa8.29□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 HAT1O14929 419 aa8.29□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 SYN3O14994 580 aa8.29□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 CHADO15335 359 aa8.29□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 KLRC4O43908 158 aa8.29□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 PRNPP04156 253 aa8.29□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 FCGR1AP12314 374 aa8.29□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 ADAM8P78325 824 aa8.29□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 MCL1Q07820 350 aa8.29□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 ELP6Q0PNE2 266 aa8.29□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 SLC14A2Q15849 920 aa8.29□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 HKDC1Q2TB90 917 aa8.29□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 ZNF410Q86VK4 478 aa8.29□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 PXYLP1Q8TE99 480 aa8.29□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 C9orf16Q9BUW7 83 aa8.29□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 PORCNQ9H237 461 aa8.29□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 IL36AQ9UHA7 158 aa8.29□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa8.29□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 CDC7O00311 574 aa8.29□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 CD247P20963 164 aa8.29□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 CPOXP36551 454 aa8.29□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 PXNP49023 591 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP8.29□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 RPS15P62841 145 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms