RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566784.5

PKD1-231, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, human

TSL 5

Gene PKD1, Length 493 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKD1-231	ENST00000566784	GOLGA8M	H3BSY2	632 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	USP1	O94782	785 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	FAM87A	P0C7U9	286 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	PVR	P15151	417 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	OAS2	P29728	719 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	ATP5D	P30049	168 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	CCR10	P46092	362 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	ABR	Q12979	859 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	GBX1	Q14549	363 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	PPP1R7	Q15435	360 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	ZNF789	Q5FWF6	425 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	RNASEH2B	Q5TBB1	312 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	PAPD7	Q5XG87	772 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	CDHR3	Q6ZTQ4	885 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	CENPU	Q71F23	418 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	OR1L3	Q8NH93	324 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	ZNF669	Q96BR6	464 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	TCTN2	Q96GX1	697 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	SIGLEC10	Q96LC7	697 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	RAB11FIP5	Q9BXF6	653 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	GPR87	Q9BY21	358 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	INTS10	Q9NVR2	710 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	GEMIN8	Q9NWZ8	242 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	PCYOX1	Q9UHG3	505 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	TUBD1	Q9UJT1	453 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	SERTAD3	Q9UJW9	196 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	PLAGL1	Q9UM63	463 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	CCDC88C	Q9P219	2028 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	ANKRD12	Q6UB98	2062 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	HEATR5B	Q9P2D3	2071 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784		B8ZZF3	427 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	CREG1	O75629	220 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	S1PR4	O95977	384 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	KLK3	P07288	261 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	PRKAR1A	P10644	381 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	PEBP1	P30086	187 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	FMO4	P31512	558 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	ITGA1	P56199	1179 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	POLE2	P56282	527 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	GPS2	Q13227	327 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	PTK6	Q13882	451 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	GRB7	Q14451	532 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	ZNF470	Q6ECI4	717 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	C16orf46	Q6P387	395 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	TTC23L	Q6PF05	361 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	PCGF5	Q86SE9	256 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	ZNF605	Q86T29	641 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	TRIM73	Q86UV7	250 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	LMNTD2	Q8IXW0	634 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	DSEL	Q8IZU8	1212 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	LINC01555	Q8NAE3	123 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	SLC38A9	Q8NBW4	561 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	OR2L8	Q8NGY9	312 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	CFAP61	Q8NHU2	1237 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	SEC14L1	Q92503	715 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	RAD51AP1	Q96B01	352 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	SLC22A18	Q96BI1	424 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	FOPNL	Q96NB1	174 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	TRIM56	Q9BRZ2	755 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	KLHL25	Q9H0H3	589 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	DDX47	Q9H0S4	455 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	AKIRIN1	Q9H9L7	192 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	STARD5	Q9NSY2	213 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	CRYL1	Q9Y2S2	319 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	ISM1	B1AKI9	464 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784		E7EQ34	232 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	DNALI1	O14645	258 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	RASGRF2	O14827	1237 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	NIPSNAP2	O75323	286 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	KATNA1	O75449	491 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	FKBP9	O95302	570 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	C1orf105	O95561	183 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	HBQ1	P09105	142 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	PKM	P14618	531 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	CYP2A7	P20853	494 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	CD9	P21926	228 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	PTPN4	P29074	926 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	RORA	P35398	523 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	CCNF	P41002	786 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	GABRA4	P48169	554 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	GNG11	P61952	73 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	ZIC1	Q15915	447 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	LONRF1	Q17RB8	773 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	CREG2	Q8IUH2	290 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	AGGF1	Q8N302	714 aa	eCLIP	13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	CALML6	Q8TD86	181 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	APOBEC4	Q8WW27	367 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	MR1	Q95460	341 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	DPH2	Q9BQC3	489 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	ACTL8	Q9H568	366 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	ACTR5	Q9H9F9	607 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	FAM60A	Q9NP50	221 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	IL1RAPL1	Q9NZN1	696 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	ASIC3	Q9UHC3	531 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	SLC39A10	Q9ULF5	831 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	POLH	Q9Y253	713 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	MAD1L1	Q9Y6D9	718 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	CTAGE9	A4FU28	777 aa		13.35	□□□□□ -0.27

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.6 ms