RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548620.1

USP15-209, Transcript of ubiquitin specific peptidase 15, humanhuman

TSL 3

Gene USP15, Length 816 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15-209ENST00000548620 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa4.6□□□□□ -1.67
USP15-209ENST00000548620 ADAM20O43506 726 aa4.59□□□□□ -1.67
USP15-209ENST00000548620 DANCRP0C864 163 aa4.59□□□□□ -1.67
USP15-209ENST00000548620 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP4.59□□□□□ -1.67
USP15-209ENST00000548620 LUMP51884 338 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
USP15-209ENST00000548620 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP4.59□□□□□ -1.67
USP15-209ENST00000548620 TEAD2Q15562 447 aa4.59□□□□□ -1.67
USP15-209ENST00000548620 CBWD6Q4V339 395 aa4.59□□□□□ -1.67
USP15-209ENST00000548620 CBWD3Q5JTY5 395 aa4.59□□□□□ -1.67
USP15-209ENST00000548620 ELFN2Q5R3F8 820 aa4.59□□□□□ -1.67
USP15-209ENST00000548620 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
USP15-209ENST00000548620 Q6ZSR9 355 aa4.59□□□□□ -1.67
USP15-209ENST00000548620 BRINP3Q76B58 766 aa4.59□□□□□ -1.67
USP15-209ENST00000548620 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
USP15-209ENST00000548620 CCDC107Q8WV48 283 aa4.59□□□□□ -1.67
USP15-209ENST00000548620 DHX58Q96C10 678 aa4.59□□□□□ -1.67
USP15-209ENST00000548620 SPDL1Q96EA4 605 aa4.59□□□□□ -1.67
USP15-209ENST00000548620 WNT5BQ9H1J7 359 aa4.59□□□□□ -1.67
USP15-209ENST00000548620 FGF21Q9NSA1 209 aa4.59□□□□□ -1.67
USP15-209ENST00000548620 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa4.59□□□□□ -1.67
USP15-209ENST00000548620 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa4.59□□□□□ -1.67
USP15-209ENST00000548620 TAB2Q9NYJ8 693 aa4.59□□□□□ -1.67
USP15-209ENST00000548620 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
USP15-209ENST00000548620 CACNG4Q9UBN1 327 aa4.59□□□□□ -1.67
USP15-209ENST00000548620 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
USP15-209ENST00000548620 RPS6KA6Q9UK32 745 aa4.59□□□□□ -1.67
USP15-209ENST00000548620 KAT6BQ8WYB5 2073 aa4.58□□□□□ -1.68
USP15-209ENST00000548620 KLF11O14901 512 aa4.58□□□□□ -1.68
USP15-209ENST00000548620 ARHGEF9O43307 516 aa4.58□□□□□ -1.68
USP15-209ENST00000548620 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
USP15-209ENST00000548620 IGHV4-31P0DP07 118 aa4.58□□□□□ -1.68
USP15-209ENST00000548620 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
USP15-209ENST00000548620 KRTAP10-12P60413 245 aa4.58□□□□□ -1.68
USP15-209ENST00000548620 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
USP15-209ENST00000548620 SNAPC1Q16533 368 aa4.58□□□□□ -1.68
USP15-209ENST00000548620 KLHL26Q53HC5 615 aa4.58□□□□□ -1.68
USP15-209ENST00000548620 WDR78Q5VTH9 848 aa4.58□□□□□ -1.68
USP15-209ENST00000548620 CFAP161Q6P656 301 aa4.58□□□□□ -1.68
USP15-209ENST00000548620 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
USP15-209ENST00000548620 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa4.58□□□□□ -1.68
USP15-209ENST00000548620 OR11H4Q8NGC9 324 aa4.58□□□□□ -1.68
USP15-209ENST00000548620 CFAP61Q8NHU2 1237 aa4.58□□□□□ -1.68
USP15-209ENST00000548620 SUSD6Q92537 303 aa4.58□□□□□ -1.68
USP15-209ENST00000548620 DYRK2Q92630 601 aa4.58□□□□□ -1.68
USP15-209ENST00000548620 PTERQ96BW5 349 aa4.58□□□□□ -1.68
USP15-209ENST00000548620 POM121L2Q96KW2 1035 aa4.58□□□□□ -1.68
USP15-209ENST00000548620 GCNAQ96QF7 691 aa4.58□□□□□ -1.68
USP15-209ENST00000548620 OPA3Q9H6K4 179 aa4.58□□□□□ -1.68
USP15-209ENST00000548620 RNF186Q9NXI6 227 aa4.58□□□□□ -1.68
USP15-209ENST00000548620 DPP3Q9NY33 737 aa4.58□□□□□ -1.68
USP15-209ENST00000548620 SPHK1Q9NYA1 384 aa4.58□□□□□ -1.68
USP15-209ENST00000548620 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
USP15-209ENST00000548620 ANKRD61A6NGH8 418 aa4.57□□□□□ -1.68
USP15-209ENST00000548620 MSGN1A6NI15 193 aa4.57□□□□□ -1.68
USP15-209ENST00000548620 MEIS2O14770 477 aa4.57□□□□□ -1.68
USP15-209ENST00000548620 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
USP15-209ENST00000548620 DFFBO76075 338 aa4.57□□□□□ -1.68
USP15-209ENST00000548620 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
USP15-209ENST00000548620 PTPN3P26045 913 aa4.57□□□□□ -1.68
USP15-209ENST00000548620 NNMTP40261 264 aa4.57□□□□□ -1.68
USP15-209ENST00000548620 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
USP15-209ENST00000548620 ZNF415Q09FC8 603 aa4.57□□□□□ -1.68
USP15-209ENST00000548620 SYT14P1Q58G82 188 aa4.57□□□□□ -1.68
USP15-209ENST00000548620 GARNL3Q5VVW2 1013 aa4.57□□□□□ -1.68
USP15-209ENST00000548620 TMPRSS11BQ86T26 416 aa4.57□□□□□ -1.68
USP15-209ENST00000548620 MARVELD2Q8N4S9 558 aa4.57□□□□□ -1.68
USP15-209ENST00000548620 OR2T6Q8NHC8 308 aa4.57□□□□□ -1.68
USP15-209ENST00000548620 SSMEM1Q8WWF3 244 aa4.57□□□□□ -1.68
USP15-209ENST00000548620 SLAMF9Q96A28 289 aa4.57□□□□□ -1.68
USP15-209ENST00000548620 LINC00479Q96M42 142 aa4.57□□□□□ -1.68
USP15-209ENST00000548620 DGAT2Q96PD7 388 aa4.57□□□□□ -1.68
USP15-209ENST00000548620 RAD9AQ99638 391 aa4.57□□□□□ -1.68
USP15-209ENST00000548620 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa4.57□□□□□ -1.68
USP15-209ENST00000548620 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
USP15-209ENST00000548620 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
USP15-209ENST00000548620 ANTXRLA6NF34 631 aa4.56□□□□□ -1.68
USP15-209ENST00000548620 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa4.56□□□□□ -1.68
USP15-209ENST00000548620 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
USP15-209ENST00000548620 XKR3Q5GH77 459 aa4.56□□□□□ -1.68
USP15-209ENST00000548620 RTN4RL2Q86UN3 420 aa4.56□□□□□ -1.68
USP15-209ENST00000548620 NUDT13Q86X67 352 aa4.56□□□□□ -1.68
USP15-209ENST00000548620 DCLK2Q8N568 766 aa4.56□□□□□ -1.68
USP15-209ENST00000548620 OR52N5Q8NH56 324 aa4.56□□□□□ -1.68
USP15-209ENST00000548620 NXNL1Q96CM4 212 aa4.56□□□□□ -1.68
USP15-209ENST00000548620 KLHL4Q9C0H6 718 aa4.56□□□□□ -1.68
USP15-209ENST00000548620 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa4.56□□□□□ -1.68
USP15-209ENST00000548620 GKN1Q9NS71 199 aa4.56□□□□□ -1.68
USP15-209ENST00000548620 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
USP15-209ENST00000548620 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
USP15-209ENST00000548620 TRIM17Q9Y577 477 aa4.56□□□□□ -1.68
USP15-209ENST00000548620 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
USP15-209ENST00000548620 PASKQ96RG2 1323 aa4.55□□□□□ -1.68
USP15-209ENST00000548620 NDUFAF8A1L188 74 aa4.55□□□□□ -1.68
USP15-209ENST00000548620 K7ENM7 598 aa4.55□□□□□ -1.68
USP15-209ENST00000548620 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
USP15-209ENST00000548620 SMIM18P0DKX4 95 aa4.55□□□□□ -1.68
USP15-209ENST00000548620 NR2F1P10589 423 aa4.55□□□□□ -1.68
USP15-209ENST00000548620 PFKFB1P16118 471 aa4.55□□□□□ -1.68
USP15-209ENST00000548620 TYMPP19971 482 aa4.55□□□□□ -1.68
USP15-209ENST00000548620 MPZP25189 248 aa4.55□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.2 ms