RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528462.5

PACSIN3-205, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 2

Gene PACSIN3, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-205ENST00000528462 SIRPGQ9P1W8 387 aa21.39■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 SLC17A7Q9P2U7 560 aa21.39■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 SIGLEC6O43699 453 aa21.38■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 MAZP56270 477 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 NFKB2Q00653 900 aa21.38■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 PRKG2Q13237 762 aa21.38■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 CCSMST1Q4G0I0 132 aa21.38■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 TMEM26Q6ZUK4 368 aa21.38■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 ASCL5Q7RTU5 278 aa21.38■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 ZNF438Q7Z4V0 828 aa21.38■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 ATL1Q8WXF7 558 aa21.38■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 PHOX2BQ99453 314 aa21.38■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 PKP4Q99569 1192 aa21.38■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa21.38■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 SPATA7Q9P0W8 599 aa21.38■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa21.37■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 H3BQF6 201 aa21.37■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 SLC16A8O95907 504 aa21.37■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 ANXA5P08758 320 aa21.37■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 DHRS4L1P0CG22 281 aa21.37■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 CD59P13987 128 aa21.37■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 GLB1P16278 677 aa21.37■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 GPR18Q14330 331 aa21.37■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 NR1D2Q14995 579 aa21.37■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 TCAIMQ8N3R3 496 aa21.37■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 EID2Q8N6I1 236 aa21.37■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 OR52E1Q8NGJ3 308 aa21.37■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 HMGCLL1Q8TB92 370 aa21.37■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 RHBDF1Q96CC6 855 aa21.37■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 FBXL8Q96CD0 374 aa21.37■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 APOLD1Q96LR9 279 aa21.37■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 TWSG1Q9GZX9 223 aa21.37■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 COPG2Q9UBF2 871 aa21.37■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 ANKRD12Q6UB98 2062 aa21.36■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa21.36■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 FAM221BA6H8Z2 402 aa21.36■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 LILRA5A6NI73 299 aa21.36■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 G3V2L1 256 aa21.36■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 UBXN8O00124 270 aa21.36■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 PPM1DO15297 605 aa21.36■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 TAC1P20366 129 aa21.36■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 HPDP32754 393 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 GGT5P36269 586 aa21.36■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 RAB28P51157 221 aa21.36■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 PPP2R2AP63151 447 aa21.36■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 CYP2A13Q16696 494 aa21.36■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 PROX2Q3B8N5 592 aa21.36■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 SULT1C3Q6IMI6 304 aa21.36■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 ZYG11AQ6WRX3 759 aa21.36■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 RAB42Q8N4Z0 105 aa21.36■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 ARMC2Q8NEN0 867 aa21.36■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 CCDC126Q96EE4 140 aa21.36■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 CD274Q9NZQ7 290 aa21.36■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa21.36■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 PADI4Q9UM07 663 aa21.36■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 U3KQA8 63 aa21.36■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 ZNF839A8K0R7 811 aa21.36■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 SUPT3HB4E1H0 165 aa21.36■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 SUPT3HO75486 399 aa21.36■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 GUCA1CO95843 209 aa21.36■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 PNLIPP16233 465 aa21.36■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 IMPA1P29218 277 aa21.36■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 GPR3P46089 330 aa21.36■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 NR0B2Q15466 257 aa21.36■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 ZNF480Q8WV37 535 aa21.36■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa21.36■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 OR6C2Q9NZP2 312 aa21.36■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 BTBD3Q9Y2F9 522 aa21.36■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa21.35■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 STX16O14662 325 aa21.35■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 SMIM24O75264 130 aa21.35■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 CKMT1AP12532 417 aa21.35■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 CPA3P15088 417 aa21.35■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 NR1D1P20393 614 aa21.35■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 PKLRP30613 574 aa21.35■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 SHMT2P34897 504 aa21.35■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 ANKS6Q68DC2 871 aa21.35■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa21.35■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 SLC22A9Q8IVM8 553 aa21.35■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 LCN9Q8WX39 176 aa21.35■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 EGFL8Q99944 293 aa21.35■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 LRIT1Q9P2V4 623 aa21.35■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 ICKQ9UPZ9 632 aa21.35■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
PACSIN3-205ENST00000528462 KRT87PA6NCN2 255 aa21.34■■□□□ 1.01
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