RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528252.5

SOX6-210, Transcript of SRY-box 6, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene SOX6, Length 2,707 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX6-210ENST00000528252 RAD51BO15315 384 aa8.05□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 OR4F21O95013 312 aa8.05□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 CHEK2O96017 543 aa8.05□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 NAT2P11245 290 aa8.05□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 HGFP14210 728 aa8.05□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 JAK1P23458 1154 aa8.05□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 AKT1P31749 480 aa8.05□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 VIPR1P32241 457 aa8.05□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 CCR7P32248 378 aa8.05□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 ETV3P41162 512 aa8.05□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 NME5P56597 212 aa8.05□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 NRF1Q16656 503 aa8.05□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 DUSP6Q16828 381 aa8.05□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 ZNF805Q5CZA5 627 aa8.05□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 C16orf89Q6UX73 402 aa8.05□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa8.05□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 GPR141Q7Z602 305 aa8.05□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 FBXW8Q8N3Y1 598 aa8.05□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 RNF148Q8N7C7 305 aa8.05□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 CDYL2Q8N8U2 506 aa8.05□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 SMARCD2Q92925 531 aa8.05□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 EGFL8Q99944 293 aa8.05□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 WDR41Q9HAD4 459 aa8.05□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 EPS15L1Q9UBC2 864 aa8.05□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 POLG2Q9UHN1 485 aa8.05□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 ERGIC3Q9Y282 383 aa8.05□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa8.05□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 C16orf96A6NNT2 1141 aa8.05□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 HEPACAM2A8MVW5 462 aa8.05□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 CFAP99D6REC4 459 aa8.05□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 H6PDO95479 791 aa8.05□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 HLA-EP13747 358 aa8.05□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 ZNF30P17039 623 aa8.05□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 FSHRP23945 695 aa8.05□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 GDF5P43026 501 aa8.05□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 HSPA7P48741 367 aa8.05□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 PKNOX1P55347 436 aa8.05□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 ERVPABLB-1P60509 514 aa8.05□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 STX1BP61266 288 aa8.05□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 HSPA14Q0VDF9 509 aa8.05□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 PTK2BQ14289 1009 aa8.05□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 KIF19Q2TAC6 998 aa8.05□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 TTLL9Q3SXZ7 439 aa8.05□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa8.05□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa8.05□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa8.05□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa8.05□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa8.05□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 CCDC138Q96M89 665 aa8.05□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 PKP2Q99959 881 aa8.05□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 KCTD5Q9NXV2 234 aa8.05□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 DEC1Q9P2X7 70 aa8.05□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 MOSPD1Q9UJG1 213 aa8.05□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 SARDHQ9UL12 918 aa8.05□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 CDH7Q9ULB5 785 aa8.05□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa8.05□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 GBF1Q92538 1859 aa8.05□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 H3BMQ9 156 aa8.04□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 H3BNH8 94 aa8.04□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 TAPBPO15533 448 aa8.04□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 SH3BP5O60239 455 aa8.04□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 KATNA1O75449 491 aa8.04□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 NFATC1O95644 943 aa8.04□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 OR56A5P0C7T3 313 aa8.04□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 UROSP10746 265 aa8.04□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 LBPP18428 481 aa8.04□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 DPP6P42658 865 aa8.04□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 THOP1P52888 689 aa8.04□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 METAP1P53582 386 aa8.04□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 IFITM2Q01629 132 aa8.04□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 STX5Q13190 355 aa8.04□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP8.04□□□□□ -1.123e-6■■■□□ 17.8
SOX6-210ENST00000528252 LETMD1Q6P1Q0 360 aa8.04□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa8.04□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa8.04□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 FUNDC1Q8IVP5 155 aa8.04□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 SFTPA1Q8IWL2 248 aa8.04□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 PDPRQ8NCN5 879 aa8.04□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 ATP6V1E2Q96A05 226 aa8.04□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 ULK4Q96C45 1275 aa8.04□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 COG8Q96MW5 612 aa8.04□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 ZNF382Q96SR6 550 aa8.04□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 SFXN1Q9H9B4 322 aa8.04□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 MRGBPQ9NV56 204 aa8.04□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms