RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514813.6

RRN3P1-201, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor pseudogene 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RRN3P1, Length 3,645 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1-201ENST00000514813 GPR21Q99679 349 aa6.38□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 ATG10Q9H0Y0 220 aa6.38□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 VPS11Q9H270 941 aa6.38□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 THSD1Q9NS62 852 aa6.38□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 TMEM9Q9P0T7 183 aa6.38□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 NFU1Q9UMS0 254 aa6.38□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 LOXL2Q9Y4K0 774 aa6.38□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 DCHS1Q96JQ0 3298 aa6.38□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 RGSL1A5PLK6 1076 aa6.37□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 OR5K4A6NMS3 321 aa6.37□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 RFPL1O75677 317 aa6.37□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 ACRV1P26436 265 aa6.37□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 BDKRB1P46663 353 aa6.37□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 SLCO1A2P46721 670 aa6.37□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 PPP2R2AP63151 447 aa6.37□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 CDK16Q00536 496 aa6.37□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 CLCA4Q14CN2 919 aa6.37□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 IYDQ6PHW0 289 aa6.37□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 CERS6Q6ZMG9 384 aa6.37□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 CEP112Q8N8E3 955 aa6.37□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 STK35Q8TDR2 534 aa6.37□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 RUNDC3BQ96NL0 473 aa6.37□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 TRIM54Q9BYV2 358 aa6.37□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 VPS18Q9P253 973 aa6.37□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa6.37□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 HAUS5O94927 633 aa6.37□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 IVLP07476 585 aa6.37□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 INHBAP08476 426 aa6.37□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 CKMT1AP12532 417 aa6.37□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 PKMP14618 531 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 GM2AP17900 193 aa6.37□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 ACADVLP49748 655 aa6.37□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa6.37□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 MROH9Q5TGP6 573 aa6.37□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 LVRNQ6Q4G3 990 aa6.37□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 TMEM26Q6ZUK4 368 aa6.37□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 ZNF765Q7L2R6 523 aa6.37□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 VASH2Q86V25 355 aa6.37□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 CPNE9Q8IYJ1 553 aa6.37□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 PPFIBP2Q8ND30 876 aa6.37□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 ASB12Q8WXK4 309 aa6.37□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 ATP6V1E2Q96A05 226 aa6.37□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 GSX2Q9BZM3 304 aa6.37□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 SEMA6CQ9H3T2 930 aa6.37□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 COG4Q9H9E3 785 aa6.37□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 TLK1Q9UKI8 766 aa6.37□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa6.37□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 NFS1Q9Y697 457 aa6.37□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 DGKBQ9Y6T7 804 aa6.37□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 ZBTB14O43829 449 aa6.37□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 KDM1AO60341 852 aa6.37□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 CATP04040 527 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 TP53P04637 393 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 ADRA1AP35348 466 aa6.37□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 HTR3AP46098 478 aa6.37□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 GLRBP48167 497 aa6.37□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 RPE65Q16518 533 aa6.37□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 ISXQ2M1V0 245 aa6.37□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 KLHL38Q2WGJ6 581 aa6.37□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 ZNF789Q5FWF6 425 aa6.37□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 C1orf189Q5VU69 101 aa6.37□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 TMEM126BQ8IUX1 230 aa6.37□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 HM13Q8TCT9 377 aa6.37□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 HEXDCQ8WVB3 486 aa6.37□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 ERP27Q96DN0 273 aa6.37□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 ZDHHC12Q96GR4 267 aa6.37□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 LYSMD1Q96S90 227 aa6.37□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 MAP3K3Q99759 626 aa6.37□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 RMI1Q9H9A7 625 aa6.37□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa6.37□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa6.37□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa6.36□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 A0A0G2JNG1 304 aa6.36□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 A0A0J9YVX5 310 aa6.36□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 MAGEB16A2A368 324 aa6.36□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 PIPSLA2A3N6 862 aa6.36□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 PMS2P1A4D2B8 440 aa6.36□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 A6NCN8 305 aa6.36□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa6.36□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 KIR2DS3K7RE56 304 aa6.36□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 TPP1O14773 563 aa6.36□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 TBX1O43435 398 aa6.36□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 B4GAT1O43505 415 aa6.36□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 USP1O94782 785 aa6.36□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 SOD1P00441 154 aa6.36□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 ZNF883P0CG24 379 aa6.36□□□□□ -1.39
RRN3P1-201ENST00000514813 ARAFP10398 606 aa6.36□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms