RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514705.5

TSPAN17-208, Transcript of tetraspanin 17, human

TSL 2

Gene TSPAN17, Length 4,445 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TSPAN17-208	ENST00000514705	PIGA	P37287	484 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	CRAT	P43155	626 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	DGKE	P52429	567 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	ACLY	P53396	1101 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	SEMA3A	Q14563	771 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	COQ5	Q5HYK3	327 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	RNF219	Q5W0B1	726 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	DSG4	Q86SJ6	1040 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	RPL3L	Q92901	407 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	13.61	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	PAK1IP1	Q9NWT1	392 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	PADI3	Q9ULW8	664 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	TLR6	Q9Y2C9	796 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	TMED5	Q9Y3A6	229 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	IL6	P05231	212 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	ITPKA	P23677	461 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	HRH2	P25021	359 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	MZF1	P28698	734 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	KIR3DL1	P43629	444 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	YBEY	P58557	167 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	RPS14	P62263	151 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	TAB1	Q15750	504 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	AAK1	Q2M2I8	961 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	UGT3A2	Q3SY77	523 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	UBE2J2	Q8N2K1	259 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	MYDGF	Q969H8	173 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	PYCR2	Q96C36	320 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	KCNC2	Q96PR1	638 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	CDH7	Q9ULB5	785 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	NUP214	P35658	2090 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	CENPX	A8MT69	81 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	GPR39	O43194	453 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	DCT	P40126	519 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	KCNQ1	P51787	676 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	ADARB1	P78563	741 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	EMX1	Q04741	257 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	ACSM2A	Q08AH3	577 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	PON2	Q15165	354 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	ACSM2B	Q68CK6	577 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	OR2T5	Q6IEZ7	315 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	OR2T29	Q8NH02	315 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	TMEM169	Q96HH4	297 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	ALPK1	Q96QP1	1244 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	ENPP5	Q9UJA9	477 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	UPK3BL1	B0FP48	263 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	UPK3BL2	E5RIL1	263 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	STK16	O75716	305 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	CBLB	Q13191	982 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	CLCA4	Q14CN2	919 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	TIGD6	Q17RP2	521 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	ARMC12	Q5T9G4	340 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	PLEKHG7	Q6ZR37	379 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	SREK1IP1	Q8N9Q2	155 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	OR2T11	Q8NH01	316 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	SLC22A17	Q8WUG5	538 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	MED8	Q96G25	268 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	ZIC5	Q96T25	663 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	ZNF451	Q9Y4E5	1061 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705		A8MV72	311 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	COQ9	O75208	318 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	LCK	P06239	509 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	SMN1	Q16637	294 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	ZNF404	Q494X3	552 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	GPR156	Q8NFN8	814 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	PYURF	Q96I23	114 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	AP3M1	Q9Y2T2	418 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	WBP11	Q9Y2W2	641 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	ZFP37	Q9Y6Q3	630 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	LOC730098	B7Z3J9	87 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	STX16	O14662	325 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	CAPN15	O75808	1086 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	GLUD1	P00367	558 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	F2	P00734	622 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	NR4A2	P43354	598 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	GSTM4	Q03013	218 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	CDK5R2	Q13319	367 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	SPATS1	Q496A3	300 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	MORN1	Q5T089	497 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	TPRG1L	Q5T0D9	272 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	OR4F3	Q6IEY1	312 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	DHRS4L2	Q6PKH6	230 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	FAM9C	Q8IZT9	166 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	ITPKC	Q96DU7	683 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	GPN2	Q9H9Y4	310 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	PRDM8	Q9NQV8	689 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	IFRD1	O00458	451 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	AQP9	O43315	295 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	SEC14L2	O76054	403 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	ALDH2	P05091	517 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	MTHFD2	P13995	350 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	FAM189B	P81408	668 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	IRF8	Q02556	426 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	TAF1A	Q15573	450 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TSPAN17-208	ENST00000514705	KCNJ8	Q15842	424 aa		13.59	□□□□□ -0.23

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