RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511747.5

SH3BP2-221, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-221ENST00000511747 TRPS1Q9UHF7 1281 aa26.47■■□□□ 1.83
SH3BP2-221ENST00000511747 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
SH3BP2-221ENST00000511747 DOLKQ9UPQ8 538 aa26.47■■□□□ 1.83
SH3BP2-221ENST00000511747 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa26.47■■□□□ 1.83
SH3BP2-221ENST00000511747 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
SH3BP2-221ENST00000511747 PRKCZQ05513 592 aa26.46■■□□□ 1.83
SH3BP2-221ENST00000511747 SLC44A4Q53GD3 710 aa26.46■■□□□ 1.83
SH3BP2-221ENST00000511747 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa26.46■■□□□ 1.83
SH3BP2-221ENST00000511747 TRIM74Q86UV6 250 aa26.46■■□□□ 1.83
SH3BP2-221ENST00000511747 TRIM73Q86UV7 250 aa26.46■■□□□ 1.83
SH3BP2-221ENST00000511747 ABHD11Q8NFV4 315 aa26.46■■□□□ 1.83
SH3BP2-221ENST00000511747 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
SH3BP2-221ENST00000511747 TM6SF2Q9BZW4 377 aa26.46■■□□□ 1.83
SH3BP2-221ENST00000511747 CCDC90BQ9GZT6 254 aa26.46■■□□□ 1.83
SH3BP2-221ENST00000511747 ERGIC3Q9Y282 383 aa26.46■■□□□ 1.83
SH3BP2-221ENST00000511747 DGKBQ9Y6T7 804 aa26.46■■□□□ 1.83
SH3BP2-221ENST00000511747 K7ERQ8 282 aa26.46■■□□□ 1.83
SH3BP2-221ENST00000511747 SLC16A6O15403 523 aa26.46■■□□□ 1.83
SH3BP2-221ENST00000511747 ERN1O75460 977 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
SH3BP2-221ENST00000511747 FUCA1P04066 466 aa26.46■■□□□ 1.83
SH3BP2-221ENST00000511747 GSNP06396 782 aa26.46■■□□□ 1.83
SH3BP2-221ENST00000511747 RPL17P18621 184 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
SH3BP2-221ENST00000511747 PCMT1P22061 227 aa26.46■■□□□ 1.83
SH3BP2-221ENST00000511747 ARHGEF7Q14155 803 aa26.46■■□□□ 1.83
SH3BP2-221ENST00000511747 CALHM3Q86XJ0 350 aa26.46■■□□□ 1.83
SH3BP2-221ENST00000511747 KLHL23Q8NBE8 558 aa26.46■■□□□ 1.83
SH3BP2-221ENST00000511747 MYO19Q96H55 970 aa26.46■■□□□ 1.83
SH3BP2-221ENST00000511747 NMRK2Q9NPI5 230 aa26.46■■□□□ 1.83
SH3BP2-221ENST00000511747 SERHLQ9NQF3 203 aa26.46■■□□□ 1.83
SH3BP2-221ENST00000511747 COL6A1P12109 1028 aa26.45■■□□□ 1.82
SH3BP2-221ENST00000511747 ITIH1P19827 911 aa26.45■■□□□ 1.82
SH3BP2-221ENST00000511747 RYKP34925 604 aa26.45■■□□□ 1.82
SH3BP2-221ENST00000511747 GZMMP51124 257 aa26.45■■□□□ 1.82
SH3BP2-221ENST00000511747 PHEXP78562 749 aa26.45■■□□□ 1.82
SH3BP2-221ENST00000511747 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP26.45■■□□□ 1.82
SH3BP2-221ENST00000511747 LDLRAP1Q5SW96 308 aa26.45■■□□□ 1.82
SH3BP2-221ENST00000511747 PLPP6Q8IY26 295 aa26.45■■□□□ 1.82
SH3BP2-221ENST00000511747 PYURFQ96I23 114 aa26.45■■□□□ 1.82
SH3BP2-221ENST00000511747 ENPP5Q9UJA9 477 aa26.45■■□□□ 1.82
SH3BP2-221ENST00000511747 FAM220BPB1ANY3 271 aa26.44■■□□□ 1.82
SH3BP2-221ENST00000511747 STK16O75716 305 aa26.44■■□□□ 1.82
SH3BP2-221ENST00000511747 PORP16435 677 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
SH3BP2-221ENST00000511747 ACRV1P26436 265 aa26.44■■□□□ 1.82
SH3BP2-221ENST00000511747 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
SH3BP2-221ENST00000511747 SPIDRQ14159 915 aa26.44■■□□□ 1.82
SH3BP2-221ENST00000511747 RGS21Q2M5E4 152 aa26.44■■□□□ 1.82
SH3BP2-221ENST00000511747 ANKRD46Q86W74 232 aa26.44■■□□□ 1.82
SH3BP2-221ENST00000511747 ACPTQ9BZG2 426 aa26.44■■□□□ 1.82
SH3BP2-221ENST00000511747 KCNH6Q9H252 994 aa26.44■■□□□ 1.82
SH3BP2-221ENST00000511747 PARVBQ9HBI1 364 aa26.44■■□□□ 1.82
SH3BP2-221ENST00000511747 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa26.44■■□□□ 1.82
SH3BP2-221ENST00000511747 ORC6Q9Y5N6 252 aa26.44■■□□□ 1.82
SH3BP2-221ENST00000511747 TBL1XO60907 577 aa26.44■■□□□ 1.82
SH3BP2-221ENST00000511747 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
SH3BP2-221ENST00000511747 ITGALP20701 1170 aa26.44■■□□□ 1.82
SH3BP2-221ENST00000511747 TUFMP49411 452 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
SH3BP2-221ENST00000511747 CCR3P51677 355 aa26.44■■□□□ 1.82
SH3BP2-221ENST00000511747 RAD23AP54725 363 aa26.44■■□□□ 1.82
SH3BP2-221ENST00000511747 GP2P55259 537 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
SH3BP2-221ENST00000511747 GSTM4Q03013 218 aa26.44■■□□□ 1.82
SH3BP2-221ENST00000511747 CDK5R2Q13319 367 aa26.44■■□□□ 1.82
SH3BP2-221ENST00000511747 CTF1Q16619 201 aa26.44■■□□□ 1.82
SH3BP2-221ENST00000511747 CES5AQ6NT32 575 aa26.44■■□□□ 1.82
SH3BP2-221ENST00000511747 LRRC8DQ7L1W4 858 aa26.44■■□□□ 1.82
SH3BP2-221ENST00000511747 HIPK1Q86Z02 1210 aa26.44■■□□□ 1.82
SH3BP2-221ENST00000511747 CHPFQ8IZ52 775 aa26.44■■□□□ 1.82
SH3BP2-221ENST00000511747 CNIH3Q8TBE1 160 aa26.44■■□□□ 1.82
SH3BP2-221ENST00000511747 UBTD2Q8WUN7 234 aa26.44■■□□□ 1.82
SH3BP2-221ENST00000511747 OVCA2Q8WZ82 227 aa26.44■■□□□ 1.82
SH3BP2-221ENST00000511747 TNKS2Q9H2K2 1166 aa26.44■■□□□ 1.82
SH3BP2-221ENST00000511747 VPS51Q9UID3 782 aa26.44■■□□□ 1.82
SH3BP2-221ENST00000511747 FBXO10Q9UK96 956 aa26.44■■□□□ 1.82
SH3BP2-221ENST00000511747 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa26.44■■□□□ 1.82
SH3BP2-221ENST00000511747 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa26.44■■□□□ 1.82
SH3BP2-221ENST00000511747 XPNPEP2O43895 674 aa26.43■■□□□ 1.82
SH3BP2-221ENST00000511747 DNAJB5O75953 348 aa26.43■■□□□ 1.82
SH3BP2-221ENST00000511747 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
SH3BP2-221ENST00000511747 CLDN7O95471 211 aa26.43■■□□□ 1.82
SH3BP2-221ENST00000511747 GALTP07902 379 aa26.43■■□□□ 1.82
SH3BP2-221ENST00000511747 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
SH3BP2-221ENST00000511747 IL1RNP18510 177 aa26.43■■□□□ 1.82
SH3BP2-221ENST00000511747 OR1D2P34982 312 aa26.43■■□□□ 1.82
SH3BP2-221ENST00000511747 RELAQ04206 551 aa26.43■■□□□ 1.82
SH3BP2-221ENST00000511747 LRIF1Q5T3J3 769 aa26.43■■□□□ 1.82
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF783Q6ZMS7 281 aa26.43■■□□□ 1.82
SH3BP2-221ENST00000511747 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa26.43■■□□□ 1.82
SH3BP2-221ENST00000511747 DNAJB8Q8NHS0 232 aa26.43■■□□□ 1.82
SH3BP2-221ENST00000511747 ITCHQ96J02 903 aa26.43■■□□□ 1.82
SH3BP2-221ENST00000511747 INPP5KQ9BT40 448 aa26.43■■□□□ 1.82
SH3BP2-221ENST00000511747 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa26.43■■□□□ 1.82
SH3BP2-221ENST00000511747 C2orf78A6NCI8 922 aa26.43■■□□□ 1.82
SH3BP2-221ENST00000511747 CLDN9O95484 217 aa26.43■■□□□ 1.82
SH3BP2-221ENST00000511747 CCDC159P0C7I6 412 aa26.43■■□□□ 1.82
SH3BP2-221ENST00000511747 ELNP15502 786 aa26.43■■□□□ 1.82
SH3BP2-221ENST00000511747 OPRL1P41146 370 aa26.43■■□□□ 1.82
SH3BP2-221ENST00000511747 RPS14P62263 151 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
SH3BP2-221ENST00000511747 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
SH3BP2-221ENST00000511747 RAPSNQ13702 412 aa26.43■■□□□ 1.82
SH3BP2-221ENST00000511747 RFX4Q33E94 735 aa26.43■■□□□ 1.82
SH3BP2-221ENST00000511747 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms