RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504263.1

PCAT4-201, prostate cancer associated transcript 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PCAT4, Length 2,091 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCAT4-201ENST00000504263 PRKAA1Q13131 559 aa3.45□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 PLD1Q13393 1074 aa3.45□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 MAMLD1Q13495 774 aa3.45□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 VGLL4Q14135 290 aa3.45□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 DMC1Q14565 340 aa3.45□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP3.45□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 NCF4Q15080 339 aa3.45□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 PLCL1Q15111 1095 aa3.45□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP3.45□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 MICBQ29980 383 aa3.45□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 AP5B1Q2VPB7 878 aa3.45□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 CBWD6Q4V339 395 aa3.45□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 TFDP3Q5H9I0 405 aa3.45□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 COQ5Q5HYK3 327 aa3.45□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 PITRM1Q5JRX3 1037 aa3.45□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 CBWD3Q5JTY5 395 aa3.45□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 CBWD5Q5RIA9 395 aa3.45□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa3.45□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 MANEALQ5VSG8 457 aa3.45□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 ANKRD22Q5VYY1 191 aa3.45□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 SEL1L3Q68CR1 1132 aa3.45□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 LAIR2Q6ISS4 152 aa3.45□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 PYHIN1Q6K0P9 492 aa3.45□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 CES5AQ6NT32 575 aa3.45□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 BNIPLQ7Z465 357 aa3.45□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 SLC9B2Q86UD5 537 aa3.45□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 IGDCC3Q8IVU1 814 aa3.45□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 PELI3Q8N2H9 469 aa3.45□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 KLHL36Q8N4N3 616 aa3.45□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 MINDY1Q8N5J2 469 aa3.45□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 EMC1Q8N766 993 aa3.45□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 RNF148Q8N7C7 305 aa3.45□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 C12orf29Q8N999 325 aa3.45□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 SLC37A3Q8NCC5 494 aa3.45□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 DUSP18Q8NEJ0 188 aa3.45□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 ZNF555Q8NEP9 628 aa3.45□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 OR1M1Q8NGA1 313 aa3.45□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 OR6M1Q8NGM8 313 aa3.45□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 RDH11Q8TC12 318 aa3.45□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 MAPK15Q8TD08 544 aa3.45□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 BPIFB1Q8TDL5 484 aa3.45□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 ELP5Q8TE02 316 aa3.45□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 TCEAL3Q969E4 200 aa3.45□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 ELMO3Q96BJ8 720 aa3.45□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 GMCL1Q96IK5 515 aa3.45□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 GAD1Q99259 594 aa3.45□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 SLC30A2Q9BRI3 323 aa3.45□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 TCEAL7Q9BRU2 100 aa3.45□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 DGCR6LQ9BY27 220 aa3.45□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 GSX2Q9BZM3 304 aa3.45□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 IL22Q9GZX6 179 aa3.45□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
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PCAT4-201ENST00000504263 RNPEPQ9H4A4 650 aa3.45□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 POPDC2Q9HBU9 364 aa3.45□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 ATP13A1Q9HD20 1204 aa3.45□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 CATSPERZQ9NTU4 200 aa3.45□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 UFSP2Q9NUQ7 469 aa3.45□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 FAM118AQ9NWS6 357 aa3.45□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 RAB20Q9NX57 234 aa3.45□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 BABAM2Q9NXR7 383 aa3.45□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 ACTR10Q9NZ32 417 aa3.45□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 DNAJB9Q9UBS3 223 aa3.45□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 MORF4L1Q9UBU8 362 aa3.45□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 UBQLN2Q9UHD9 624 aa3.45□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa3.45□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 LAMP5Q9UJQ1 280 aa3.45□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 ADAM30Q9UKF2 790 aa3.45□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 ADAM28Q9UKQ2 775 aa3.45□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 CLEC4AQ9UMR7 237 aa3.45□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 EDARQ9UNE0 448 aa3.45□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 AP4E1Q9UPM8 1137 aa3.45□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 ERVW-1Q9UQF0 538 aa3.45□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 CDYLQ9Y232 598 aa3.45□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa3.45□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 CEP290O15078 2479 aa3.44□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa3.44□□□□□ -1.86
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PCAT4-201ENST00000504263 E2F8A0AVK6 867 aa3.44□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 OR2A25A4D2G3 310 aa3.44□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 TRABD2BA6NFA1 517 aa3.44□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 POM121CA8CG34 1229 aa3.44□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 TARM1B6A8C7 271 aa3.44□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 H7C2Y5 167 aa3.44□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 UBXN8O00124 270 aa3.44□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 SGK1O00141 431 aa3.44□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 PIK3R2O00459 728 aa3.44□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
PCAT4-201ENST00000504263 PCDH17O14917 1159 aa3.44□□□□□ -1.86
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