RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492895.1

ANKRD28-211, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 4

Gene ANKRD28, Length 539 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-211ENST00000492895 FAM200BP0CF97 657 aa3.27□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 TRIM49P0CI25 452 aa3.27□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 TRIM49CP0CI26 452 aa3.27□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 P4HA1P13674 534 aa3.27□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 PKMP14618 531 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 PRPH2P23942 346 aa3.27□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 GSTM2P28161 218 aa3.27□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 PIK3CAP42336 1068 aa3.27□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 PTGER3P43115 390 aa3.27□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 GCLMP48507 274 aa3.27□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 PGFP49763 221 aa3.27□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 NDST1P52848 882 aa3.27□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 IRX4P78413 519 aa3.27□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 SLC7A9P82251 487 aa3.27□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 STK4Q13043 487 aa3.27□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 PKP1Q13835 747 aa3.27□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 RAPGEF1Q13905 1077 aa3.27□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 SMTNL2Q2TAL5 461 aa3.27□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 EOGTQ5NDL2 527 aa3.27□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 C10orf120Q5SQS8 335 aa3.27□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa3.27□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa3.27□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 LYSMD4Q5XG99 296 aa3.27□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 SLC30A9Q6PML9 568 aa3.27□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa3.27□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 LPCAT2Q7L5N7 544 aa3.27□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 TMEM25Q86YD3 366 aa3.27□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 NUP93Q8N1F7 819 aa3.27□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 C12orf29Q8N999 325 aa3.27□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 IL17RCQ8NAC3 791 aa3.27□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 DEFB124Q8NES8 71 aa3.27□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 CCDC26Q8TAB7 109 aa3.27□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 GOLGA5Q8TBA6 731 aa3.27□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 WBP2Q969T9 261 aa3.27□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 PAGE5Q96GU1 130 aa3.27□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 ACOX2Q99424 681 aa3.27□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 BBS2Q9BXC9 721 aa3.27□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 HDHD5Q9BXW7 423 aa3.27□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 CLPBQ9H078 707 aa3.27□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 SDCBP2Q9H190 292 aa3.27□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 CUEDC2Q9H467 287 aa3.27□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 PLEKHA2Q9HB19 425 aa3.27□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 NOD2Q9HC29 1040 aa3.27□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 ITM2CQ9NQX7 267 aa3.27□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 THSD1Q9NS62 852 aa3.27□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 ARL15Q9NXU5 204 aa3.27□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 PLK2Q9NYY3 685 aa3.27□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 EHD2Q9NZN4 543 aa3.27□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 DEC1Q9P2X7 70 aa3.27□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 HMGXB4Q9UGU5 601 aa3.27□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa3.27□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 PCDHA7Q9UN72 937 aa3.27□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 LAMP3Q9UQV4 416 aa3.27□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 PKP3Q9Y446 797 aa3.27□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa3.27□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 MYH7BA7E2Y1 1941 aa3.27□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 NAV3Q8IVL0 2385 aa3.26□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 A0A0G2JK05 382 aa3.26□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa3.26□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 LNP1A1A4G5 178 aa3.26□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 CXorf65A6NEN9 183 aa3.26□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 NPIPB13A6NJU9 1138 aa3.26□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 NPIPB5A8MRT5 1133 aa3.26□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 B9A039 149 aa3.26□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 WASH3PC4AMC7 463 aa3.26□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 NPIPB4C9JG80 1138 aa3.26□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 CALUO43852 315 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 CREB3O43889 395 aa3.26□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 AKAP3O75969 853 aa3.26□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 BEST1O76090 585 aa3.26□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 YEATS4O95619 227 aa3.26□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 SYF2O95926 243 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 OAS1P00973 400 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 HLA-DRAP01903 254 aa3.26□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 ALPLP05186 524 aa3.26□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 CYP4B1P13584 511 aa3.26□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 RARGP13631 454 aa3.26□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 KRT13P13646 458 aa3.26□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 ACP5P13686 325 aa3.26□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 TNNT1P13805 278 aa3.26□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 HSD3B1P14060 373 aa3.26□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 HOXB2P14652 356 aa3.26□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 PFKFB1P16118 471 aa3.26□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 PPP3CCP48454 512 aa3.26□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 CCT5P48643 541 aa3.26□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 VAMP7P51809 220 aa3.26□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 RPS6KA3P51812 740 aa3.26□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms