RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa12.56□□□□□ -0.4
PRAME-213ENST00000492657 ASAH2Q9NR71 780 aa12.56□□□□□ -0.4
PRAME-213ENST00000492657 SLC6A13Q9NSD5 602 aa12.56□□□□□ -0.4
PRAME-213ENST00000492657 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
PRAME-213ENST00000492657 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP12.56□□□□□ -0.4
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PRAME-213ENST00000492657 NOTCH4Q99466 2003 aa12.56□□□□□ -0.4
PRAME-213ENST00000492657 JAK1P23458 1154 aa12.56□□□□□ -0.4
PRAME-213ENST00000492657 WEE1P30291 646 aa12.56□□□□□ -0.4
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PRAME-213ENST00000492657 TTLL9Q3SXZ7 439 aa12.56□□□□□ -0.4
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PRAME-213ENST00000492657 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa12.56□□□□□ -0.4
PRAME-213ENST00000492657 SLC13A3Q8WWT9 602 aa12.56□□□□□ -0.4
PRAME-213ENST00000492657 NSMCE2Q96MF7 247 aa12.56□□□□□ -0.4
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PRAME-213ENST00000492657 BBS2Q9BXC9 721 aa12.56□□□□□ -0.4
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PRAME-213ENST00000492657 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP12.55□□□□□ -0.4
PRAME-213ENST00000492657 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP12.55□□□□□ -0.4
PRAME-213ENST00000492657 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa12.55□□□□□ -0.4
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PRAME-213ENST00000492657 UPK3BL2E5RIL1 263 aa12.55□□□□□ -0.4
PRAME-213ENST00000492657 SLC28A1O00337 649 aa12.55□□□□□ -0.4
PRAME-213ENST00000492657 AREL1O15033 823 aa12.55□□□□□ -0.4
PRAME-213ENST00000492657 PRAMEF4O60810 478 aa12.55□□□□□ -0.4
PRAME-213ENST00000492657 POP4O95707 220 aaKnown RBP12.55□□□□□ -0.4
PRAME-213ENST00000492657 LINC00271P0C7V0 271 aa12.55□□□□□ -0.4
PRAME-213ENST00000492657 BCKDHAP12694 445 aa12.55□□□□□ -0.4
PRAME-213ENST00000492657 AOAHP28039 575 aa12.55□□□□□ -0.4
PRAME-213ENST00000492657 AKT1P31749 480 aa12.55□□□□□ -0.4
PRAME-213ENST00000492657 NTHL1P78549 312 aa12.55□□□□□ -0.4
PRAME-213ENST00000492657 SPATS1Q496A3 300 aa12.55□□□□□ -0.4
PRAME-213ENST00000492657 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP12.55□□□□□ -0.4
PRAME-213ENST00000492657 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa12.55□□□□□ -0.4
PRAME-213ENST00000492657 TRIM46Q7Z4K8 759 aa12.55□□□□□ -0.4
PRAME-213ENST00000492657 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa12.55□□□□□ -0.4
PRAME-213ENST00000492657 GOLM1Q8NBJ4 401 aa12.55□□□□□ -0.4
PRAME-213ENST00000492657 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP12.55□□□□□ -0.4
PRAME-213ENST00000492657 OR2A12Q8NGT7 310 aa12.55□□□□□ -0.4
PRAME-213ENST00000492657 UBTD2Q8WUN7 234 aa12.55□□□□□ -0.4
PRAME-213ENST00000492657 FIG4Q92562 907 aa12.55□□□□□ -0.4
PRAME-213ENST00000492657 FOXJ1Q92949 421 aa12.55□□□□□ -0.4
PRAME-213ENST00000492657 ATG10Q9H0Y0 220 aa12.55□□□□□ -0.4
PRAME-213ENST00000492657 RDH14Q9HBH5 336 aa12.55□□□□□ -0.4
PRAME-213ENST00000492657 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP12.55□□□□□ -0.4
PRAME-213ENST00000492657 UTS2RQ9UKP6 389 aa12.55□□□□□ -0.4
PRAME-213ENST00000492657 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP12.55□□□□□ -0.4
PRAME-213ENST00000492657 LTBP2Q14767 1821 aa12.55□□□□□ -0.4
PRAME-213ENST00000492657 KANSL1LA0AUZ9 987 aa12.54□□□□□ -0.4
PRAME-213ENST00000492657 ZBBXA8MT70 800 aa12.54□□□□□ -0.4
PRAME-213ENST00000492657 GRM6O15303 877 aa12.54□□□□□ -0.4
PRAME-213ENST00000492657 RASAL1O95294 804 aa12.54□□□□□ -0.4
PRAME-213ENST00000492657 CLDN9O95484 217 aa12.54□□□□□ -0.4
PRAME-213ENST00000492657 SNAP29O95721 258 aa12.54□□□□□ -0.4
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PRAME-213ENST00000492657 TACR1P25103 407 aa12.54□□□□□ -0.4
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PRAME-213ENST00000492657 FXNQ16595 210 aa12.54□□□□□ -0.4
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PRAME-213ENST00000492657 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP12.54□□□□□ -0.4
PRAME-213ENST00000492657 NEK5Q6P3R8 708 aa12.54□□□□□ -0.4
PRAME-213ENST00000492657 Q6ZVL8 140 aa12.54□□□□□ -0.4
PRAME-213ENST00000492657 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP12.54□□□□□ -0.4
PRAME-213ENST00000492657 RIMKLAQ8IXN7 391 aa12.54□□□□□ -0.4
PRAME-213ENST00000492657 TBC1D21Q8IYX1 336 aa12.54□□□□□ -0.4
PRAME-213ENST00000492657 C10orf111Q8N326 155 aa12.54□□□□□ -0.4
PRAME-213ENST00000492657 ARL10Q8N8L6 244 aa12.54□□□□□ -0.4
PRAME-213ENST00000492657 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP12.54□□□□□ -0.4
PRAME-213ENST00000492657 ZBTB18Q99592 522 aa12.54□□□□□ -0.4
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