RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492545.1

CTDSP1-211, Transcript of CTD small phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDSP1, Length 634 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1-211ENST00000492545 NRTNQ99748 197 aa22.87■■□□□ 1.25
CTDSP1-211ENST00000492545 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa22.87■■□□□ 1.25
CTDSP1-211ENST00000492545 ACTL8Q9H568 366 aa22.87■■□□□ 1.25
CTDSP1-211ENST00000492545 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
CTDSP1-211ENST00000492545 KCNMB2Q9Y691 235 aa22.87■■□□□ 1.25
CTDSP1-211ENST00000492545 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa22.87■■□□□ 1.25
CTDSP1-211ENST00000492545 SEC16AO15027 2179 aa22.86■■□□□ 1.25
CTDSP1-211ENST00000492545 A0A0J9YY10 115 aa22.86■■□□□ 1.25
CTDSP1-211ENST00000492545 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa22.86■■□□□ 1.25
CTDSP1-211ENST00000492545 E7EQ34 232 aa22.86■■□□□ 1.25
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CTDSP1-211ENST00000492545 NEPROQ6NW34 567 aa22.86■■□□□ 1.25
CTDSP1-211ENST00000492545 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa22.86■■□□□ 1.25
CTDSP1-211ENST00000492545 SLC35F6Q8N357 371 aa22.86■■□□□ 1.25
CTDSP1-211ENST00000492545 SLC38A9Q8NBW4 561 aa22.86■■□□□ 1.25
CTDSP1-211ENST00000492545 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa22.86■■□□□ 1.25
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CTDSP1-211ENST00000492545 RAD51AP1Q96B01 352 aa22.86■■□□□ 1.25
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CTDSP1-211ENST00000492545 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa22.86■■□□□ 1.25
CTDSP1-211ENST00000492545 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
CTDSP1-211ENST00000492545 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
CTDSP1-211ENST00000492545 SPHK1Q9NYA1 384 aa22.86■■□□□ 1.25
CTDSP1-211ENST00000492545 SNX12Q9UMY4 172 aa22.86■■□□□ 1.25
CTDSP1-211ENST00000492545 ISM1B1AKI9 464 aa22.85■■□□□ 1.25
CTDSP1-211ENST00000492545 SLC28A2O43868 658 aa22.85■■□□□ 1.25
CTDSP1-211ENST00000492545 PHF2O75151 1096 aa22.85■■□□□ 1.25
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CTDSP1-211ENST00000492545 CD9P21926 228 aa22.85■■□□□ 1.25
CTDSP1-211ENST00000492545 RORAP35398 523 aa22.85■■□□□ 1.25
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CTDSP1-211ENST00000492545 CES3Q6UWW8 571 aa22.85■■□□□ 1.25
CTDSP1-211ENST00000492545 RAB42Q8N4Z0 105 aa22.85■■□□□ 1.25
CTDSP1-211ENST00000492545 CFAP61Q8NHU2 1237 aa22.85■■□□□ 1.25
CTDSP1-211ENST00000492545 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
CTDSP1-211ENST00000492545 MAGEC3Q8TD91 643 aa22.85■■□□□ 1.25
CTDSP1-211ENST00000492545 COG1Q8WTW3 980 aa22.85■■□□□ 1.25
CTDSP1-211ENST00000492545 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
CTDSP1-211ENST00000492545 FOPNLQ96NB1 174 aa22.85■■□□□ 1.25
CTDSP1-211ENST00000492545 BIRC8Q96P09 236 aa22.85■■□□□ 1.25
CTDSP1-211ENST00000492545 NLNQ9BYT8 704 aa22.85■■□□□ 1.25
CTDSP1-211ENST00000492545 CDC14CA4D256 554 aa22.84■■□□□ 1.25
CTDSP1-211ENST00000492545 S1PR4O95977 384 aa22.84■■□□□ 1.25
CTDSP1-211ENST00000492545 ATP5DP30049 168 aa22.84■■□□□ 1.25
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CTDSP1-211ENST00000492545 UGT8Q16880 541 aa22.84■■□□□ 1.25
CTDSP1-211ENST00000492545 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa22.84■■□□□ 1.25
CTDSP1-211ENST00000492545 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa22.84■■□□□ 1.25
CTDSP1-211ENST00000492545 ANKRD22Q5VYY1 191 aa22.84■■□□□ 1.25
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CTDSP1-211ENST00000492545 OR2L8Q8NGY9 312 aa22.84■■□□□ 1.25
CTDSP1-211ENST00000492545 SERPINB12Q96P63 405 aa22.84■■□□□ 1.25
CTDSP1-211ENST00000492545 C17orf62Q9BQA9 187 aa22.84■■□□□ 1.25
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CTDSP1-211ENST00000492545 KLHL25Q9H0H3 589 aa22.84■■□□□ 1.25
CTDSP1-211ENST00000492545 CHST8Q9H2A9 424 aa22.84■■□□□ 1.25
CTDSP1-211ENST00000492545 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
CTDSP1-211ENST00000492545 SLC39A10Q9ULF5 831 aa22.84■■□□□ 1.25
CTDSP1-211ENST00000492545 PLAGL1Q9UM63 463 aa22.84■■□□□ 1.25
CTDSP1-211ENST00000492545 RASGRF2O14827 1237 aa22.83■■□□□ 1.25
CTDSP1-211ENST00000492545 SUV39H1O43463 412 aa22.83■■□□□ 1.25
CTDSP1-211ENST00000492545 OR2B3O76000 313 aa22.83■■□□□ 1.25
CTDSP1-211ENST00000492545 TMEM63AO94886 807 aa22.83■■□□□ 1.25
CTDSP1-211ENST00000492545 AGXTP21549 392 aa22.83■■□□□ 1.25
CTDSP1-211ENST00000492545 FMO4P31512 558 aa22.83■■□□□ 1.25
CTDSP1-211ENST00000492545 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
CTDSP1-211ENST00000492545 TLDC1Q6P9B6 456 aa22.83■■□□□ 1.25
CTDSP1-211ENST00000492545 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa22.83■■□□□ 1.25
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CTDSP1-211ENST00000492545 LMNTD2Q8IXW0 634 aa22.83■■□□□ 1.25
CTDSP1-211ENST00000492545 FAM60AQ9NP50 221 aa22.83■■□□□ 1.25
CTDSP1-211ENST00000492545 PCMTD2Q9NV79 361 aa22.83■■□□□ 1.25
CTDSP1-211ENST00000492545 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
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CTDSP1-211ENST00000492545 ZNF749O43361 778 aa22.82■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 FURINP09958 794 aa22.82■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 TCP1P17987 556 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 TERF1P54274 439 aa22.82■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 PMS2P54278 862 aa22.82■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 GRB7Q14451 532 aa22.82■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 ZIC1Q15915 447 aa22.82■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 CTSL3PQ5NE16 218 aa22.82■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa22.82■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 SYTL1Q8IYJ3 562 aa22.82■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 ABHD17AQ96GS6 310 aa22.82■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 KLHL42Q9P2K6 505 aa22.82■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 PLCL2Q9UPR0 1127 aa22.82■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa22.82■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 GOLGA8KD6RF30 607 aa22.81■■□□□ 1.24
CTDSP1-211ENST00000492545 GOLGA8TH3BQL2 631 aa22.81■■□□□ 1.24
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