RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485274.1

GPATCH2-204, Transcript of G-patch domain containing 2, human

TSL 3

Gene GPATCH2, Length 343 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPATCH2-204	ENST00000485274	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	ANAPC2	Q9UJX6	822 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	C5	P01031	1676 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	SPEF2	Q9C093	1822 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	C5orf60	A6NFR6	353 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	SMTNL1	A8MU46	457 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274		H0YIN7	160 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	UBE2C	O00762	179 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	ACOT8	O14734	319 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	GM2A	P17900	193 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	FUT6	P51993	359 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	ILF3	Q12906	894 aa	Known RBP eCLIP	4.63	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	COASY	Q13057	564 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	IL11RA	Q14626	422 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	STXBP5	Q5T5C0	1151 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	ERMARD	Q5T6L9	678 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	TMEM211	Q6ICI0	200 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	RPUSD3	Q6P087	351 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	DENND5B	Q6ZUT9	1274 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	PLEKHM3	Q6ZWE6	761 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	POGLUT1	Q8NBL1	392 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	OR10S1	Q8NGN2	331 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	ERLEC1	Q96DZ1	483 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	FSD1	Q9BTV5	496 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	SLA2	Q9H6Q3	261 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	TMEM94	Q12767	1356 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274		A0A0D9SFI3	127 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	CTAGE9	A4FU28	777 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	PRAC2	D3DTV9	90 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	T	O15178	435 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	CTAGE5	O15320	804 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	AP5Z1	O43299	807 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	PRAMEF11	O60813	436 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	IGKV5-2	P06315	115 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	CTAGE8	P0CG41	777 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	AHR	P35869	848 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	ZNF75D	P51815	510 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	SNTB1	Q13884	538 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	SYCP1	Q15431	976 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	C9orf152	Q5JTZ5	239 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	IRAK1BP1	Q5VVH5	260 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	ATL3	Q6DD88	541 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	CAPRIN2	Q6IMN6	1127 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	FAM171B	Q6P995	826 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	PLPPR4	Q7Z2D5	763 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	CTAGE4	Q8IX94	777 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	NAGS	Q8N159	534 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	FBXO39	Q8N4B4	442 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	GBGT1	Q8N5D6	347 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	NECAB1	Q8N987	351 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	RBM15B	Q8NDT2	890 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	SPATA20	Q8TB22	786 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	SMPDL3B	Q92485	455 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	PTER	Q96BW5	349 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	ZNF582	Q96NG8	517 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	NEK1	Q96PY6	1258 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	CCDC106	Q9BWC9	280 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	TNMD	Q9H2S6	317 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	MBNL1	Q9NR56	388 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	NFKBIL1	Q9UBC1	381 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	POU2F3	Q9UKI9	436 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	ZNF711	Q9Y462	761 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	KIF3A	Q9Y496	699 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	YIPF1	Q9Y548	306 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	LAMA4	Q16363	1823 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	ALS2	Q96Q42	1657 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274		A0A1B0GUV1	79 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	TCRBV21S2A2	A0A5A6	115 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	ASPDH	A6ND91	283 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	DVL1	O14640	695 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	SSX4	O60224	188 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	NEMF	O60524	1076 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	PFKFB2	O60825	505 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	PSMD10	O75832	226 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	BMP10	O95393	424 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GPATCH2-204	ENST00000485274	GCNT3	O95395	438 aa		4.61	□□□□□ -1.67

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