RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479230.5

GNL3-208, Transcript of G protein nucleolar 3, human

TSL 4

Gene GNL3, Length 547 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GNL3-208	ENST00000479230	RNASEH1	O60930	286 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	STARD3NL	O95772	234 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	WDPCP	O95876	746 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	FAM157C	P0CG43	387 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	SLC9A3	P48764	834 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	VEGFC	P49767	419 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	PDX1	P52945	283 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	TPD52	P55327	224 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	P2RY6	Q15077	328 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	C14orf177	Q52M58	125 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	ENOSF1	Q7L5Y1	443 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	DDHD1	Q8NEL9	900 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	OR13J1	Q8NGT2	312 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	HCAR2	Q8TDS4	363 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	LAT2	Q9GZY6	243 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	TBC1D17	Q9HA65	648 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	A4GALT	Q9NPC4	353 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	SWAP70	Q9UH65	585 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	SAMD9	Q5K651	1589 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	LOC101059948	A0A1B0GTJ6	334 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	SLCO1B7	G3V0H7	640 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	ZNF197	O14709	1029 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	SERPINB2	P05120	415 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	ZNF26	P17031	533 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	CA4	P22748	312 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	DMPK	Q09013	629 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	RNASEH2B	Q5TBB1	312 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	SLC16A9	Q7RTY1	509 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	CFAP206	Q8IYR0	622 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	IRGQ	Q8WZA9	623 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	SPACA9	Q96E40	222 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	EQTN	Q9NQ60	294 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	SLC35C2	Q9NQQ7	365 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	GDE1	Q9NZC3	331 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	CPSF2	Q9P2I0	782 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	CRNN	Q9UBG3	495 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	PPIE	Q9UNP9	301 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	PASK	Q96RG2	1323 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	FEZF1	A0PJY2	475 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	TMEM221	A6NGB7	291 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	TRMU	O75648	421 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	NNMT	P40261	264 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	LMAN1	P49257	510 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	CDH13	P55290	713 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	TUBB2A	Q13885	445 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	TOMM20	Q15388	145 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	CBWD6	Q4V339	395 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	ARHGAP24	Q8N264	748 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	CCDC107	Q8WV48	283 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	TUBB2B	Q9BVA1	445 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	FGF22	Q9HCT0	170 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	SDR39U1	Q9NRG7	319 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	DPP3	Q9NY33	737 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	B3GAT1	Q9P2W7	334 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230		A0A087X002	238 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	TOMM70	O94826	608 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	AP2A2	O94973	939 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	HMBS	P08397	361 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	CA6	P23280	308 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	CDR2	Q01850	454 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	SNAPC1	Q16533	368 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	ZFP69	Q49AA0	526 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	CFAP58	Q5T655	872 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	C16orf54	Q6UWD8	224 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	HPSE2	Q8WWQ2	592 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	PTER	Q96BW5	349 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	GCNA	Q96QF7	691 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	FNBP1	Q96RU3	617 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	ABHD1	Q96SE0	405 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	WNT5B	Q9H1J7	359 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	WDR13	Q9H1Z4	485 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	INTS9	Q9NV88	658 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	STK26	Q9P289	416 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	RIPK3	Q9Y572	518 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	AKNA	Q7Z591	1439 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	KIF21B	O75037	1637 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	IGHV4-4	A0A075B6R2	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	MEIOC	A2RUB1	952 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	ADAM20	O43506	726 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	ERAL1	O75616	437 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	DANCR	P0C864	163 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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