RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478279.5

APTX-222, Transcript of aprataxin, human

TSL 1 (best)

Gene APTX, Length 684 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
APTX-222	ENST00000478279	CRYAB	P02511	175 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	CD1E	P15812	388 aa		10.16	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	PDHA2	P29803	388 aa		10.16	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	SHMT2	P34897	504 aa		10.16	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	KIR3DL1	P43629	444 aa		10.16	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	SMS	P52788	366 aa		10.16	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	ADORA2A-AS1	P86434	159 aa		10.16	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	TLE4	Q04727	773 aa		10.16	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	RPA4	Q13156	261 aa		10.16	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	ZNF658B	Q4V348	819 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	ZNF449	Q6P9G9	518 aa		10.16	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	UNC5A	Q6ZN44	842 aa		10.16	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	SHISA6	Q6ZSJ9	500 aa		10.16	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	SERBP1	Q8NC51	408 aa	Known RBP eCLIP	10.16	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	FLVCR1-AS1	Q8TAF5	88 aa		10.16	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	HEXDC	Q8WVB3	486 aa		10.16	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	CHTF18	Q8WVB6	975 aa		10.16	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	SPOCK3	Q9BQ16	436 aa		10.16	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	MAK16	Q9BXY0	300 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	SOX17	Q9H6I2	414 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	MCCC2	Q9HCC0	563 aa		10.16	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	ANO10	Q9NW15	660 aa		10.16	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	SPHK1	Q9NYA1	384 aa		10.16	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	EURL	Q9NYK6	297 aa		10.16	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	PLA2G3	Q9NZ20	509 aa		10.16	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	BZW2	Q9Y6E2	419 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	LRRD1	A4D1F6	860 aa		10.15	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	C2orf81	A6NN90	581 aa		10.15	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	CFAP99	D6REC4	459 aa		10.15	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	DSCR3	O14972	297 aa		10.15	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	USP1	O94782	785 aa		10.15	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	HP	P00738	406 aa		10.15	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	ESRRA	P11474	423 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	ATP1B2	P14415	290 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	HOXB4	P17483	251 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	NFKB1	P19838	968 aa		10.15	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	MST1	P26927	711 aa		10.15	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	SOX11	P35716	441 aa		10.15	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	CASP6	P55212	293 aa		10.15	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	XIAP	P98170	497 aa		10.15	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	WASHC5	Q12768	1159 aa		10.15	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	YOD1	Q5VVQ6	348 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	COX15	Q7KZN9	410 aa		10.15	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	VSIG1	Q86XK7	387 aa		10.15	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	CEP97	Q8IW35	865 aa		10.15	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	FAM20C	Q8IXL6	584 aa		10.15	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	KBTBD2	Q8IY47	623 aa		10.15	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	IPMK	Q8NFU5	416 aa		10.15	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	OR4K2	Q8NGD2	314 aa		10.15	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	CCDC110	Q8TBZ0	833 aa		10.15	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	ZDHHC19	Q8WVZ1	309 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	PSMF1	Q92530	271 aa		10.15	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	ULK4	Q96C45	1275 aa		10.15	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	OXNAD1	Q96HP4	312 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	FCRL5	Q96RD9	977 aa		10.15	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	COPS8	Q99627	209 aa		10.15	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	CSTF2T	Q9H0L4	616 aa	Known RBP eCLIP	10.15	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	ZNF160	Q9HCG1	818 aa		10.15	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	OR6C2	Q9NZP2	312 aa		10.15	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	FKBPL	Q9UIM3	349 aa		10.15	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	CRLS1	Q9UJA2	301 aa		10.15	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	ARL5A	Q9Y689	179 aa		10.15	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279		A0A087X0T9	212 aa		10.14	□□□□□ -0.79
APTX-222	ENST00000478279	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
APTX-222	ENST00000478279	VSTM2B	A6NLU5	285 aa		10.14	□□□□□ -0.79
APTX-222	ENST00000478279	RASAL1	O95294	804 aa		10.14	□□□□□ -0.79
APTX-222	ENST00000478279	FAM228B	P0C875	321 aa		10.14	□□□□□ -0.79
APTX-222	ENST00000478279	ACPP	P15309	386 aa		10.14	□□□□□ -0.79
APTX-222	ENST00000478279	FDXR	P22570	491 aa		10.14	□□□□□ -0.79
APTX-222	ENST00000478279	CARS	P49589	748 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
APTX-222	ENST00000478279	FANCC	Q00597	558 aa		10.14	□□□□□ -0.79
APTX-222	ENST00000478279	GTF3C1	Q12789	2109 aa		10.14	□□□□□ -0.79
APTX-222	ENST00000478279	MPP3	Q13368	585 aa		10.14	□□□□□ -0.79
APTX-222	ENST00000478279	CDSN	Q15517	529 aa		10.14	□□□□□ -0.79
APTX-222	ENST00000478279	C3AR1	Q16581	482 aa		10.14	□□□□□ -0.79
APTX-222	ENST00000478279	ALKBH5	Q6P6C2	394 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
APTX-222	ENST00000478279	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		10.14	□□□□□ -0.79
APTX-222	ENST00000478279	MCAT	Q8IVS2	390 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
APTX-222	ENST00000478279	OR5AR1	Q8NGP9	310 aa		10.14	□□□□□ -0.79
APTX-222	ENST00000478279	BRIX1	Q8TDN6	353 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
APTX-222	ENST00000478279	ADAMTS18	Q8TE60	1221 aa		10.14	□□□□□ -0.79
APTX-222	ENST00000478279	MESP1	Q9BRJ9	268 aa		10.14	□□□□□ -0.79
APTX-222	ENST00000478279	CRB3	Q9BUF7	120 aa		10.14	□□□□□ -0.79
APTX-222	ENST00000478279	VPS37B	Q9H9H4	285 aa		10.14	□□□□□ -0.79
APTX-222	ENST00000478279	CUTC	Q9NTM9	273 aa		10.14	□□□□□ -0.79
APTX-222	ENST00000478279	IL1RAPL1	Q9NZN1	696 aa		10.14	□□□□□ -0.79
APTX-222	ENST00000478279	PTGFRN	Q9P2B2	879 aa		10.14	□□□□□ -0.79
APTX-222	ENST00000478279	CTTNBP2NL	Q9P2B4	639 aa		10.14	□□□□□ -0.79
APTX-222	ENST00000478279	UVRAG	Q9P2Y5	699 aa		10.14	□□□□□ -0.79
APTX-222	ENST00000478279	CTSF	Q9UBX1	484 aa		10.14	□□□□□ -0.79
APTX-222	ENST00000478279	POLG2	Q9UHN1	485 aa		10.14	□□□□□ -0.79
APTX-222	ENST00000478279	LCMT1	Q9UIC8	334 aa		10.14	□□□□□ -0.79
APTX-222	ENST00000478279	MRPS2	Q9Y399	296 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
APTX-222	ENST00000478279	ABCA4	P78363	2273 aa		10.14	□□□□□ -0.79
APTX-222	ENST00000478279	NSG1	A0A0A6YYJ2	146 aa		10.13	□□□□□ -0.79
APTX-222	ENST00000478279	ISM1	B1AKI9	464 aa		10.13	□□□□□ -0.79
APTX-222	ENST00000478279	MAP2K7	O14733	419 aa		10.13	□□□□□ -0.79

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