RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455631.5

PTPRA-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type A, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRA, Length 1,107 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRA-208ENST00000455631 NKG7Q16617 165 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRA-208ENST00000455631 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
PTPRA-208ENST00000455631 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
PTPRA-208ENST00000455631 OVCH1Q7RTY7 1134 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRA-208ENST00000455631 DNAJC22Q8N4W6 341 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRA-208ENST00000455631 HEXDCQ8WVB3 486 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRA-208ENST00000455631 NR4A3Q92570 626 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRA-208ENST00000455631 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
PTPRA-208ENST00000455631 HIVEP1P15822 2718 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRA-208ENST00000455631 AGAP14A8MT82 685 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRA-208ENST00000455631 CCL21O00585 134 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRA-208ENST00000455631 KLHL18O94889 574 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRA-208ENST00000455631 ZBED6P86452 979 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRA-208ENST00000455631 RPA4Q13156 261 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRA-208ENST00000455631 SLC5A12Q1EHB4 618 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRA-208ENST00000455631 OR13C4Q8NGS5 318 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRA-208ENST00000455631 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRA-208ENST00000455631 VPS50Q96JG6 964 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRA-208ENST00000455631 VAT1Q99536 393 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRA-208ENST00000455631 EURLQ9NYK6 297 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRA-208ENST00000455631 ASF1AQ9Y294 204 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRA-208ENST00000455631 CCDC168Q8NDH2 2452 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRA-208ENST00000455631 ISM1B1AKI9 464 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRA-208ENST00000455631 ALBP02768 609 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRA-208ENST00000455631 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
PTPRA-208ENST00000455631 TNNT1P13805 278 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRA-208ENST00000455631 ARSFP54793 590 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRA-208ENST00000455631 Q0VFX4 171 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRA-208ENST00000455631 MFSD7Q6UXD7 560 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRA-208ENST00000455631 COX15Q7KZN9 410 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRA-208ENST00000455631 SNX20Q7Z614 316 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRA-208ENST00000455631 OR11G2Q8NGC1 345 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRA-208ENST00000455631 TAAR6Q96RI8 345 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRA-208ENST00000455631 LMF1Q96S06 567 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRA-208ENST00000455631 BPIFA3Q9BQP9 254 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRA-208ENST00000455631 CTSFQ9UBX1 484 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRA-208ENST00000455631 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRA-208ENST00000455631 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
PTPRA-208ENST00000455631 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
PTPRA-208ENST00000455631 C5orf60A6NFR6 353 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRA-208ENST00000455631 INAQ16352 499 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRA-208ENST00000455631 KAZNQ674X7 775 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRA-208ENST00000455631 MTFR2Q6P444 385 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRA-208ENST00000455631 TMEM207Q6UWW9 146 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRA-208ENST00000455631 RPTNQ6XPR3 784 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRA-208ENST00000455631 FAM20CQ8IXL6 584 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRA-208ENST00000455631 DENND1AQ8TEH3 1009 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRA-208ENST00000455631 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
PTPRA-208ENST00000455631 APOL2Q9BQE5 337 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRA-208ENST00000455631 SLC26A1Q9H2B4 701 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRA-208ENST00000455631 SEMA3GQ9NS98 782 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRA-208ENST00000455631 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRA-208ENST00000455631 OR6C2Q9NZP2 312 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRA-208ENST00000455631 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
PTPRA-208ENST00000455631 PLAGL1Q9UM63 463 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRA-208ENST00000455631 DYTNA2CJ06 578 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRA-208ENST00000455631 CCL22O00626 93 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRA-208ENST00000455631 CST8O60676 142 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRA-208ENST00000455631 UNC5CO95185 931 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRA-208ENST00000455631 GCGRP47871 477 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRA-208ENST00000455631 FANCCQ00597 558 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRA-208ENST00000455631 TFDP2Q14188 446 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRA-208ENST00000455631 ZNF160Q9HCG1 818 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRA-208ENST00000455631 CAPN11Q9UMQ6 739 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRA-208ENST00000455631 ZFHX3Q15911 3703 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRA-208ENST00000455631 DSCR3O14972 297 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRA-208ENST00000455631 CRTAMO95727 393 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRA-208ENST00000455631 MAGP20916 626 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRA-208ENST00000455631 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
PTPRA-208ENST00000455631 CDKN2BP42772 138 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRA-208ENST00000455631 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
PTPRA-208ENST00000455631 GEMP55040 296 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRA-208ENST00000455631 OLIG2Q13516 323 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRA-208ENST00000455631 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRA-208ENST00000455631 LRRC38Q5VT99 294 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRA-208ENST00000455631 TBC1D21Q8IYX1 336 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRA-208ENST00000455631 CLDN19Q8N6F1 224 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRA-208ENST00000455631 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
PTPRA-208ENST00000455631 SLC35G2Q8TBE7 412 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRA-208ENST00000455631 P3H4Q92791 437 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRA-208ENST00000455631 HAUS1Q96CS2 278 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRA-208ENST00000455631 MESP1Q9BRJ9 268 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRA-208ENST00000455631 CUTCQ9NTM9 273 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRA-208ENST00000455631 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
PTPRA-208ENST00000455631 POLG2Q9UHN1 485 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRA-208ENST00000455631 KLHL20Q9Y2M5 609 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRA-208ENST00000455631 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRA-208ENST00000455631 TRAV17A0A0B4J275 112 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRA-208ENST00000455631 HPP00738 406 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRA-208ENST00000455631 TMEM253P0C7T8 217 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRA-208ENST00000455631 TPBGLP0DKB5 382 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRA-208ENST00000455631 ACRV1P26436 265 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRA-208ENST00000455631 MC4RP32245 332 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRA-208ENST00000455631 CA7P43166 264 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRA-208ENST00000455631 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
PTPRA-208ENST00000455631 KIR2DS3Q14952 304 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRA-208ENST00000455631 MICALCLQ6ZW33 695 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRA-208ENST00000455631 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
PTPRA-208ENST00000455631 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRA-208ENST00000455631 CCDC110Q8TBZ0 833 aa22.26■■□□□ 1.15
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