RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453923.1

DDX39BP2-208, Transcript of DEAD-box helicase 39B pseudogene 2, human

BASIC

Gene DDX39BP2, Length 258 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX39BP2-208	ENST00000453923	BRD8	Q9H0E9	1235 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	STMN4	Q9H169	189 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	NEUROG2	Q9H2A3	272 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	CWH43	Q9H720	699 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	TLR8	Q9NR97	1041 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	APOBEC3C	Q9NRW3	190 aa	Known RBP eCLIP	4.61	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	PIGV	Q9NUD9	493 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	CLIC5	Q9NZA1	410 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	SPG21	Q9NZD8	308 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	IL37	Q9NZH6	218 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	PAK5	Q9P286	719 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	FAM153A	Q9UHL3	310 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	SLC12A6	Q9UHW9	1150 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	FBXW11	Q9UKB1	542 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	NAALADL1	Q9UQQ1	740 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	HEY1	Q9Y5J3	304 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	PTPRS	Q13332	1948 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	SHROOM3	Q8TF72	1996 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	ALPK3	Q96L96	1907 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	DOCK4	Q8N1I0	1966 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	MYO18A	Q92614	2054 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	LOC105369274	A0A096LPK9	316 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	LOC102723532	A0A0G2JNH3	316 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	FAM92A	A1XBS5	289 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	C16orf96	A6NNT2	1141 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	TTC34	A8MYJ7	566 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	HMGB1P1	B2RPK0	211 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	CHAD	O15335	359 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	KCNN4	O15554	427 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	CREB3	O43889	395 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	IGLV3-25	P01717	112 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	FYN	P06241	537 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	IVL	P07476	585 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	NUDT17	P0C025	328 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	MYZAP	P0CAP1	466 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	CSH1	P0DML2	217 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	CSH2	P0DML3	217 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	CSF2RA	P15509	400 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	GOT1	P17174	413 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	IL4R	P24394	825 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	IVD	P26440	423 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	ATP5D	P30049	168 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	SLC8A1	P32418	973 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	ELF1	P32519	619 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	THBS4	P35443	961 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	HSD17B3	P37058	310 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	FDFT1	P37268	417 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	AGTR2	P50052	363 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	ARL4C	P56559	192 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	PITX1	P78337	314 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	BASP1	P80723	227 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	SARNP	P82979	210 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	COG7	P83436	770 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	CBX1	P83916	185 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	GABPB1	Q06547	395 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	PLD1	Q13393	1074 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	VEPH1	Q14D04	833 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	PAFAH1B3	Q15102	231 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	TRADD	Q15628	312 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	TAF12	Q16514	161 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	AAK1	Q2M2I8	961 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	RAB6C	Q53S08	254 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	CEP85L	Q5SZL2	805 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	RNASEH2B	Q5TBB1	312 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	AGBL2	Q5U5Z8	902 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	OTUD1	Q5VV17	481 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	NCBP2-AS2	Q69YL0	99 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	SLC8B1	Q6J4K2	584 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	RFX8	Q6ZV50	586 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	CENPU	Q71F23	418 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	BHLHA9	Q7RTU4	235 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	TAC4	Q86UU9	113 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	CCDC25	Q86WR0	208 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	IQCK	Q8N0W5	287 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	OR4N4	Q8N0Y3	316 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	VPS52	Q8N1B4	723 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	SLC39A11	Q8N1S5	342 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	ZCCHC9	Q8N567	271 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	PQLC3	Q8N755	202 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	ATP6V0D2	Q8N8Y2	350 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	COLGALT1	Q8NBJ5	622 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	ATAD1	Q8NBU5	361 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	STKLD1	Q8NE28	680 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	SCAMP5	Q8TAC9	235 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	TFB1M	Q8WVM0	346 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	NDRG1	Q92597	394 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	ZNF689	Q96CS4	500 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	RTP4	Q96DX8	246 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	ZIM3	Q96PE6	472 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	QKI	Q96PU8	341 aa	Known RBP eCLIP	4.6	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	YME1L1	Q96TA2	773 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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