RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450873.6

RABGEF1-205, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 2,281 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-205ENST00000450873 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 NRSN2Q9GZP1 204 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 SYTL2Q9HCH5 934 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 A0A1W2PQM1 296 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 DUX1O43812 170 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 TCEA3O75764 348 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 AMD1P17707 334 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 CD1CP29017 333 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 GNGT1P63211 74 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP10.3□□□□□ -0.763e-8■■■□□ 15.8
RABGEF1-205ENST00000450873 SPIDRQ14159 915 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 PLCL1Q15111 1095 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 AMZ1Q400G9 498 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 CYHR1Q6ZMK1 362 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 OR5AR1Q8NGP9 310 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 PAFAH2Q99487 392 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 SH3GL3Q99963 347 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 EPB41L4BQ9H329 900 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 FETUBQ9UGM5 382 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 MCM8Q9UJA3 840 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF180Q9UJW8 692 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 APC2O95996 2303 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 KIAA0754O94854 1291 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 UBXN7O94888 489 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 C1orf105O95561 183 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 STMN1P16949 149 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 CNTFP26441 200 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 PRKG2Q13237 762 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 LGSNQ5TDP6 509 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 CDCP2Q5VXM1 449 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 FBXW10Q5XX13 1052 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 AP1ARQ63HQ0 302 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 MYO1HQ8N1T3 1032 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 LCN9Q8WX39 176 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 HGH1Q9BTY7 390 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 ASXL3Q9C0F0 2248 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 ACACAQ13085 2346 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 KRT38O76015 456 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 CPNE6O95741 557 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 MT-CO3P00414 261 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 CATP04040 527 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 CRABP2P29373 138 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 CLDN6P56747 220 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 RAB10P61026 200 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 MROH9Q5TGP6 573 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 NKAIN2Q5VXU1 208 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 USP53Q70EK8 1073 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 CEP97Q8IW35 865 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 OR52E1Q8NGJ3 308 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 ASB11Q8WXH4 323 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 RAD51AP1Q96B01 352 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 LINGO1Q96FE5 620 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 DHRS4Q9BTZ2 278 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 SRMSQ9H3Y6 488 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 CAB39LQ9H9S4 337 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 PPCSQ9HAB8 311 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 GPAMQ9HCL2 828 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 NFS1Q9Y697 457 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 RP1P56715 2156 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa10.28□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 GFYI3L273 518 aa10.28□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC16A5O15375 505 aa10.28□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 ZBTB14O43829 449 aa10.28□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 C8GP07360 202 aa10.28□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 SHMT2P34897 504 aa10.28□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 HSD17B3P37058 310 aa10.28□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 AMIGO1Q86WK6 493 aa10.28□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 RAB42Q8N4Z0 105 aa10.28□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 OR4E2Q8NGC2 313 aa10.28□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 DCAKDQ8WVC6 231 aa10.28□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 NCSTNQ92542 709 aa10.28□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 GRAMD1AQ96CP6 724 aa10.28□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 DEPDC7Q96QD5 511 aa10.28□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 RAB33BQ9H082 229 aa10.28□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 AK5Q9Y6K8 562 aa10.28□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 CAPN7Q9Y6W3 813 aa10.28□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 URB1O60287 2271 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 D6RAR5 112 aa10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.4 ms