RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445304.1

RPL17P1-201, Transcript of ribosomal protein L17 pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene RPL17P1, Length 536 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL17P1-201ENST00000445304 PKLRP30613 574 aa9.03□□□□□ -0.96
RPL17P1-201ENST00000445304 CCR10P46092 362 aa9.03□□□□□ -0.96
RPL17P1-201ENST00000445304 ABRQ12979 859 aa9.03□□□□□ -0.96
RPL17P1-201ENST00000445304 DNASE1L3Q13609 305 aa9.03□□□□□ -0.96
RPL17P1-201ENST00000445304 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
RPL17P1-201ENST00000445304 PPP1R7Q15435 360 aa9.03□□□□□ -0.96
RPL17P1-201ENST00000445304 KYNUQ16719 465 aa9.03□□□□□ -0.96
RPL17P1-201ENST00000445304 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa9.03□□□□□ -0.96
RPL17P1-201ENST00000445304 ZNF789Q5FWF6 425 aa9.03□□□□□ -0.96
RPL17P1-201ENST00000445304 CTSL3PQ5NE16 218 aa9.03□□□□□ -0.96
RPL17P1-201ENST00000445304 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
RPL17P1-201ENST00000445304 NEPROQ6NW34 567 aa9.03□□□□□ -0.96
RPL17P1-201ENST00000445304 TTC23LQ6PF05 361 aa9.03□□□□□ -0.96
RPL17P1-201ENST00000445304 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
RPL17P1-201ENST00000445304 LMNTD2Q8IXW0 634 aa9.03□□□□□ -0.96
RPL17P1-201ENST00000445304 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
RPL17P1-201ENST00000445304 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa9.03□□□□□ -0.96
RPL17P1-201ENST00000445304 CT55Q8WUE5 264 aa9.03□□□□□ -0.96
RPL17P1-201ENST00000445304 SEC14L1Q92503 715 aa9.03□□□□□ -0.96
RPL17P1-201ENST00000445304 SLC22A18Q96BI1 424 aa9.03□□□□□ -0.96
RPL17P1-201ENST00000445304 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
RPL17P1-201ENST00000445304 RNF31Q96EP0 1072 aa9.03□□□□□ -0.96
RPL17P1-201ENST00000445304 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa9.03□□□□□ -0.96
RPL17P1-201ENST00000445304 GPR87Q9BY21 358 aa9.03□□□□□ -0.96
RPL17P1-201ENST00000445304 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
RPL17P1-201ENST00000445304 SPHK1Q9NYA1 384 aa9.03□□□□□ -0.96
RPL17P1-201ENST00000445304 PCYOX1Q9UHG3 505 aa9.03□□□□□ -0.96
RPL17P1-201ENST00000445304 TUBD1Q9UJT1 453 aa9.03□□□□□ -0.96
RPL17P1-201ENST00000445304 PLAGL1Q9UM63 463 aa9.03□□□□□ -0.96
RPL17P1-201ENST00000445304 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
RPL17P1-201ENST00000445304 SPTA1P02549 2419 aa9.02□□□□□ -0.97
RPL17P1-201ENST00000445304 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa9.02□□□□□ -0.97
RPL17P1-201ENST00000445304 USP27XA6NNY8 438 aa9.02□□□□□ -0.97
RPL17P1-201ENST00000445304 ISM1B1AKI9 464 aa9.02□□□□□ -0.97
RPL17P1-201ENST00000445304 B8ZZF3 427 aa9.02□□□□□ -0.97
RPL17P1-201ENST00000445304 RASGRF2O14827 1237 aa9.02□□□□□ -0.97
RPL17P1-201ENST00000445304 NIPSNAP2O75323 286 aa9.02□□□□□ -0.97
RPL17P1-201ENST00000445304 KATNA1O75449 491 aa9.02□□□□□ -0.97
RPL17P1-201ENST00000445304 CREG1O75629 220 aa9.02□□□□□ -0.97
RPL17P1-201ENST00000445304 C1orf105O95561 183 aa9.02□□□□□ -0.97
RPL17P1-201ENST00000445304 S1PR4O95977 384 aa9.02□□□□□ -0.97
RPL17P1-201ENST00000445304 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
RPL17P1-201ENST00000445304 HBQ1P09105 142 aa9.02□□□□□ -0.97
RPL17P1-201ENST00000445304 PVRP15151 417 aa9.02□□□□□ -0.97
RPL17P1-201ENST00000445304 CD9P21926 228 aa9.02□□□□□ -0.97
RPL17P1-201ENST00000445304 PTPN4P29074 926 aa9.02□□□□□ -0.97
RPL17P1-201ENST00000445304 OAS2P29728 719 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
RPL17P1-201ENST00000445304 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
RPL17P1-201ENST00000445304 FMO4P31512 558 aa9.02□□□□□ -0.97
RPL17P1-201ENST00000445304 RORAP35398 523 aa9.02□□□□□ -0.97
RPL17P1-201ENST00000445304 CCNFP41002 786 aa9.02□□□□□ -0.97
RPL17P1-201ENST00000445304 ITGA1P56199 1179 aa9.02□□□□□ -0.97
RPL17P1-201ENST00000445304 POLE2P56282 527 aa9.02□□□□□ -0.97
RPL17P1-201ENST00000445304 GNG11P61952 73 aa9.02□□□□□ -0.97
RPL17P1-201ENST00000445304 RPS15P62841 145 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
RPL17P1-201ENST00000445304 GPS2Q13227 327 aa9.02□□□□□ -0.97
RPL17P1-201ENST00000445304 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
RPL17P1-201ENST00000445304 PTK6Q13882 451 aa9.02□□□□□ -0.97
RPL17P1-201ENST00000445304 GRB7Q14451 532 aa9.02□□□□□ -0.97
RPL17P1-201ENST00000445304 GBX1Q14549 363 aa9.02□□□□□ -0.97
RPL17P1-201ENST00000445304 LONRF1Q17RB8 773 aa9.02□□□□□ -0.97
RPL17P1-201ENST00000445304 IZUMO3Q5VZ72 239 aa9.02□□□□□ -0.97
RPL17P1-201ENST00000445304 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
RPL17P1-201ENST00000445304 ZNF470Q6ECI4 717 aa9.02□□□□□ -0.97
RPL17P1-201ENST00000445304 C16orf46Q6P387 395 aa9.02□□□□□ -0.97
RPL17P1-201ENST00000445304 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa9.02□□□□□ -0.97
RPL17P1-201ENST00000445304 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
RPL17P1-201ENST00000445304 CENPUQ71F23 418 aa9.02□□□□□ -0.97
RPL17P1-201ENST00000445304 PCGF5Q86SE9 256 aa9.02□□□□□ -0.97
RPL17P1-201ENST00000445304 ZNF605Q86T29 641 aa9.02□□□□□ -0.97
RPL17P1-201ENST00000445304 TRIM73Q86UV7 250 aa9.02□□□□□ -0.97
RPL17P1-201ENST00000445304 DSELQ8IZU8 1212 aa9.02□□□□□ -0.97
RPL17P1-201ENST00000445304 RAB42Q8N4Z0 105 aa9.02□□□□□ -0.97
RPL17P1-201ENST00000445304 LINC01555Q8NAE3 123 aa9.02□□□□□ -0.97
RPL17P1-201ENST00000445304 OR2L8Q8NGY9 312 aa9.02□□□□□ -0.97
RPL17P1-201ENST00000445304 OR1L3Q8NH93 324 aa9.02□□□□□ -0.97
RPL17P1-201ENST00000445304 CFAP61Q8NHU2 1237 aa9.02□□□□□ -0.97
RPL17P1-201ENST00000445304 CALML6Q8TD86 181 aa9.02□□□□□ -0.97
RPL17P1-201ENST00000445304 MAGEC3Q8TD91 643 aa9.02□□□□□ -0.97
RPL17P1-201ENST00000445304 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
RPL17P1-201ENST00000445304 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
RPL17P1-201ENST00000445304 RAD51AP1Q96B01 352 aa9.02□□□□□ -0.97
RPL17P1-201ENST00000445304 SIGLEC10Q96LC7 697 aa9.02□□□□□ -0.97
RPL17P1-201ENST00000445304 FOPNLQ96NB1 174 aa9.02□□□□□ -0.97
RPL17P1-201ENST00000445304 RUNDC3BQ96NL0 473 aa9.02□□□□□ -0.97
RPL17P1-201ENST00000445304 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
RPL17P1-201ENST00000445304 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
RPL17P1-201ENST00000445304 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
RPL17P1-201ENST00000445304 ACTL8Q9H568 366 aa9.02□□□□□ -0.97
RPL17P1-201ENST00000445304 STARD5Q9NSY2 213 aa9.02□□□□□ -0.97
RPL17P1-201ENST00000445304 ASIC3Q9UHC3 531 aa9.02□□□□□ -0.97
RPL17P1-201ENST00000445304 SLC39A10Q9ULF5 831 aa9.02□□□□□ -0.97
RPL17P1-201ENST00000445304 CRYL1Q9Y2S2 319 aa9.02□□□□□ -0.97
RPL17P1-201ENST00000445304 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa9.02□□□□□ -0.97
RPL17P1-201ENST00000445304 MAST4O15021 2626 aa9.02□□□□□ -0.97
RPL17P1-201ENST00000445304 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
RPL17P1-201ENST00000445304 CTAGE9A4FU28 777 aa9.01□□□□□ -0.97
RPL17P1-201ENST00000445304 E5RI56 91 aa9.01□□□□□ -0.97
RPL17P1-201ENST00000445304 E7EQ34 232 aa9.01□□□□□ -0.97
RPL17P1-201ENST00000445304 H3BMH7 237 aa9.01□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.4 ms