RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437652.5

UBAP2L-209, Transcript of ubiquitin associated protein 2 like, humanhuman

TSL 3

Gene UBAP2L, Length 911 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2L-209ENST00000437652 TCAF1Q9Y4C2 921 aa25.22■■□□□ 1.63
UBAP2L-209ENST00000437652 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa25.22■■□□□ 1.63
UBAP2L-209ENST00000437652 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
UBAP2L-209ENST00000437652 RPN2P04844 631 aa25.21■■□□□ 1.63
UBAP2L-209ENST00000437652 APOA4P06727 396 aa25.21■■□□□ 1.63
UBAP2L-209ENST00000437652 CD63P08962 238 aa25.21■■□□□ 1.63
UBAP2L-209ENST00000437652 CD97P48960 835 aa25.21■■□□□ 1.63
UBAP2L-209ENST00000437652 SLC5A12Q1EHB4 618 aa25.21■■□□□ 1.63
UBAP2L-209ENST00000437652 DEFB110Q30KQ9 67 aa25.21■■□□□ 1.63
UBAP2L-209ENST00000437652 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
UBAP2L-209ENST00000437652 PCID2Q5JVF3 399 aa25.21■■□□□ 1.63
UBAP2L-209ENST00000437652 C1orf189Q5VU69 101 aa25.21■■□□□ 1.63
UBAP2L-209ENST00000437652 ZNF534Q76KX8 674 aa25.21■■□□□ 1.63
UBAP2L-209ENST00000437652 ANKMY1Q9P2S6 941 aa25.21■■□□□ 1.63
UBAP2L-209ENST00000437652 A6NL46 340 aa25.2■■□□□ 1.62
UBAP2L-209ENST00000437652 VPS4BO75351 444 aa25.2■■□□□ 1.62
UBAP2L-209ENST00000437652 ATXN8OSP0DMR3 200 aa25.2■■□□□ 1.62
UBAP2L-209ENST00000437652 CBSLP0DN79 551 aa25.2■■□□□ 1.62
UBAP2L-209ENST00000437652 CBSP35520 551 aa25.2■■□□□ 1.62
UBAP2L-209ENST00000437652 CCNG2Q16589 344 aa25.2■■□□□ 1.62
UBAP2L-209ENST00000437652 NADK2Q4G0N4 442 aa25.2■■□□□ 1.62
UBAP2L-209ENST00000437652 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
UBAP2L-209ENST00000437652 RHBDD2Q6NTF9 364 aa25.2■■□□□ 1.62
UBAP2L-209ENST00000437652 TLDC1Q6P9B6 456 aa25.2■■□□□ 1.62
UBAP2L-209ENST00000437652 SLC22A15Q8IZD6 547 aa25.2■■□□□ 1.62
UBAP2L-209ENST00000437652 DNAJC22Q8N4W6 341 aa25.2■■□□□ 1.62
UBAP2L-209ENST00000437652 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa25.2■■□□□ 1.62
UBAP2L-209ENST00000437652 CHRAC1Q9NRG0 131 aa25.2■■□□□ 1.62
UBAP2L-209ENST00000437652 CATSPERZQ9NTU4 200 aa25.2■■□□□ 1.62
UBAP2L-209ENST00000437652 TXLNGQ9NUQ3 528 aa25.2■■□□□ 1.62
UBAP2L-209ENST00000437652 VPS4AQ9UN37 437 aa25.2■■□□□ 1.62
UBAP2L-209ENST00000437652 PLCL2Q9UPR0 1127 aa25.2■■□□□ 1.62
UBAP2L-209ENST00000437652 CYSRT1A8MQ03 144 aa25.19■■□□□ 1.62
UBAP2L-209ENST00000437652 HCRTR1O43613 425 aa25.19■■□□□ 1.62
UBAP2L-209ENST00000437652 CEACAM4O75871 244 aa25.19■■□□□ 1.62
UBAP2L-209ENST00000437652 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa25.19■■□□□ 1.62
UBAP2L-209ENST00000437652 OTX2P32243 289 aa25.19■■□□□ 1.62
UBAP2L-209ENST00000437652 RPL22P35268 128 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
UBAP2L-209ENST00000437652 GABRA4P48169 554 aa25.19■■□□□ 1.62
UBAP2L-209ENST00000437652 RAB28P51157 221 aa25.19■■□□□ 1.62
UBAP2L-209ENST00000437652 DCDP81605 110 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
UBAP2L-209ENST00000437652 SEMA3AQ14563 771 aa25.19■■□□□ 1.62
UBAP2L-209ENST00000437652 SSPNQ14714 243 aa25.19■■□□□ 1.62
UBAP2L-209ENST00000437652 KYNUQ16719 465 aa25.19■■□□□ 1.62
UBAP2L-209ENST00000437652 MEI1Q5TIA1 1274 aa25.19■■□□□ 1.62
UBAP2L-209ENST00000437652 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
UBAP2L-209ENST00000437652 C4orf22Q6V702 233 aa25.19■■□□□ 1.62
UBAP2L-209ENST00000437652 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
UBAP2L-209ENST00000437652 FAM26EQ8N5C1 309 aa25.19■■□□□ 1.62
UBAP2L-209ENST00000437652 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
UBAP2L-209ENST00000437652 FDCSPQ8NFU4 85 aa25.19■■□□□ 1.62
UBAP2L-209ENST00000437652 GSDMBQ8TAX9 411 aa25.19■■□□□ 1.62
UBAP2L-209ENST00000437652 SLC22A18Q96BI1 424 aa25.19■■□□□ 1.62
UBAP2L-209ENST00000437652 IP6K3Q96PC2 410 aa25.19■■□□□ 1.62
UBAP2L-209ENST00000437652 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
UBAP2L-209ENST00000437652 NDOR1Q9UHB4 597 aa25.19■■□□□ 1.62
UBAP2L-209ENST00000437652 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
UBAP2L-209ENST00000437652 ANKRD12Q6UB98 2062 aa25.19■■□□□ 1.62
UBAP2L-209ENST00000437652 IQCF5A8MTL0 148 aa25.18■■□□□ 1.62
UBAP2L-209ENST00000437652 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
UBAP2L-209ENST00000437652 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
UBAP2L-209ENST00000437652 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
UBAP2L-209ENST00000437652 DPM1O60762 260 aa25.18■■□□□ 1.62
UBAP2L-209ENST00000437652 GPC4O75487 556 aa25.18■■□□□ 1.62
UBAP2L-209ENST00000437652 TTPAP49638 278 aa25.18■■□□□ 1.62
UBAP2L-209ENST00000437652 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
UBAP2L-209ENST00000437652 ATP1A4Q13733 1029 aa25.18■■□□□ 1.62
UBAP2L-209ENST00000437652 TMED2Q15363 201 aa25.18■■□□□ 1.62
UBAP2L-209ENST00000437652 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
UBAP2L-209ENST00000437652 TTC23LQ6PF05 361 aa25.18■■□□□ 1.62
UBAP2L-209ENST00000437652 GSTA5Q7RTV2 222 aa25.18■■□□□ 1.62
UBAP2L-209ENST00000437652 VRK3Q8IV63 474 aa25.18■■□□□ 1.62
UBAP2L-209ENST00000437652 GLIS1Q8NBF1 620 aa25.18■■□□□ 1.62
UBAP2L-209ENST00000437652 CPT1CQ8TCG5 803 aa25.18■■□□□ 1.62
UBAP2L-209ENST00000437652 PROKR1Q8TCW9 393 aa25.18■■□□□ 1.62
UBAP2L-209ENST00000437652 NDC1Q9BTX1 674 aa25.18■■□□□ 1.62
UBAP2L-209ENST00000437652 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
UBAP2L-209ENST00000437652 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
UBAP2L-209ENST00000437652 SRPK3Q9UPE1 567 aa25.18■■□□□ 1.62
UBAP2L-209ENST00000437652 NAV2Q8IVL1 2488 aa25.17■■□□□ 1.62
UBAP2L-209ENST00000437652 H3BMH7 237 aa25.17■■□□□ 1.62
UBAP2L-209ENST00000437652 AP3B1O00203 1094 aa25.17■■□□□ 1.62
UBAP2L-209ENST00000437652 NPY2RP49146 381 aa25.17■■□□□ 1.62
UBAP2L-209ENST00000437652 UNC5DQ6UXZ4 953 aa25.17■■□□□ 1.62
UBAP2L-209ENST00000437652 HPS6Q86YV9 775 aa25.17■■□□□ 1.62
UBAP2L-209ENST00000437652 KRT222Q8N1A0 295 aa25.17■■□□□ 1.62
UBAP2L-209ENST00000437652 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
UBAP2L-209ENST00000437652 GBP5Q96PP8 586 aa25.17■■□□□ 1.62
UBAP2L-209ENST00000437652 GPR83Q9NYM4 423 aa25.17■■□□□ 1.62
UBAP2L-209ENST00000437652 BFARQ9NZS9 450 aa25.17■■□□□ 1.62
UBAP2L-209ENST00000437652 SLC39A10Q9ULF5 831 aa25.17■■□□□ 1.62
UBAP2L-209ENST00000437652 CDYLQ9Y232 598 aa25.17■■□□□ 1.62
UBAP2L-209ENST00000437652 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
UBAP2L-209ENST00000437652 FER1L5A0AVI2 2057 aa25.17■■□□□ 1.62
UBAP2L-209ENST00000437652 LRRK2Q5S007 2527 aa25.17■■□□□ 1.62
UBAP2L-209ENST00000437652 PEX12O00623 359 aa25.16■■□□□ 1.62
UBAP2L-209ENST00000437652 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
UBAP2L-209ENST00000437652 SLCO2B1O94956 709 aa25.16■■□□□ 1.62
UBAP2L-209ENST00000437652 CD9P21926 228 aa25.16■■□□□ 1.62
UBAP2L-209ENST00000437652 ALAS2P22557 587 aa25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.4 ms