RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 ACPTQ9BZG2 426 aa22.6■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 GID8Q9NWU2 228 aa22.6■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 CMTM6Q9NX76 183 aa22.6■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 CLEC1BQ9P126 229 aa22.6■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 ATXN10Q9UBB4 475 aa22.6■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 SLC28A1O00337 649 aa22.6■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 MID1O15344 667 aa22.6■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 EEDO75530 441 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 ACADSP16219 412 aa22.6■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 DGKQP52824 942 aa22.6■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 SEC13P55735 322 aa22.6■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa22.6■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 CRTC3Q6UUV7 619 aa22.6■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 ZFAND4Q86XD8 727 aa22.6■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 RASGRP3Q8IV61 690 aa22.6■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 SELENOMQ8WWX9 145 aa22.6■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 PSMD13Q9UNM6 376 aa22.6■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 PRKAB1Q9Y478 270 aa22.6■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 FADS3Q9Y5Q0 445 aa22.6■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 TRPM6Q9BX84 2022 aa22.6■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 ANKRD28O15084 1053 aa22.59■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 KRT6AP02538 564 aa22.59■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 KRT6BP04259 564 aa22.59■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 GNPDA1P46926 289 aa22.59■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 KRT6CP48668 564 aa22.59■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 PLIN5Q00G26 463 aa22.59■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 TLR1Q15399 786 aa22.59■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa22.59■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM52BQ4KMG9 183 aa22.59■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 RABL3Q5HYI8 236 aa22.59■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 MINDY1Q8N5J2 469 aa22.59■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 SLC29A3Q9BZD2 475 aa22.59■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 ELOVL6Q9H5J4 265 aa22.59■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 LRTM1Q9HBL6 345 aa22.59■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 EPS15L1Q9UBC2 864 aa22.59■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 DOCK9Q9BZ29 2069 aa22.59■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 CLGNO14967 610 aa22.59■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 LILRB5O75023 590 aa22.59■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 APODP05090 189 aa22.59■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 DRD3P35462 400 aa22.59■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 HALP42357 657 aa22.59■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 COQ5Q5HYK3 327 aa22.59■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 CES5AQ6NT32 575 aa22.59■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 PQLC1Q8N2U9 271 aa22.59■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa22.59■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 CLHC1Q8NHS4 586 aa22.59■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 TSPEARQ8WU66 669 aa22.59■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 FBXL8Q96CD0 374 aa22.59■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 HDAC8Q9BY41 377 aa22.59■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 ABCD2Q9UBJ2 740 aa22.59■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa22.59■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 H3BM21 787 aa22.58■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 SLC16A8O95907 504 aa22.58■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 CHIT1Q13231 466 aa22.58■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 NAE1Q13564 534 aa22.58■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF765Q7L2R6 523 aa22.58■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF547Q8IVP9 402 aa22.58■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 SLC22A15Q8IZD6 547 aa22.58■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 LIX1Q8N485 282 aa22.58■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 RNF175Q8N4F7 328 aa22.58■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 AADATQ8N5Z0 425 aa22.58■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 ELSPBP1Q96BH3 223 aa22.58■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 EGFL7Q9UHF1 273 aa22.58■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa22.58■■□□□ 1.2
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FAAP20-209ENST00000428120 SOX11P35716 441 aa22.58■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 DPTQ07507 201 aa22.58■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 TTC23LQ6PF05 361 aa22.58■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 DOK6Q6PKX4 331 aa22.58■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 AGTRAPQ6RW13 159 aa22.58■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM74Q96NL1 305 aa22.58■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 SERGEFQ9UGK8 458 aa22.58■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 IGLON5A6NGN9 336 aa22.57■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 SUSD1Q6UWL2 747 aa22.57■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 KIAA2013Q8IYS2 634 aa22.57■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa22.57■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 PKP4Q99569 1192 aa22.57■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 ECSITQ9BQ95 431 aa22.57■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 TRIM39Q9HCM9 518 aa22.57■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 PCDH8O95206 1070 aa22.57■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 TIE1P35590 1138 aa22.57■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 ZFP1Q6P2D0 407 aa22.57■■□□□ 1.2
FAAP20-209ENST00000428120 PRMT9Q6P2P2 845 aa22.57■■□□□ 1.2
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