RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF79Q15937 498 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 HKDC1Q2TB90 917 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 STEAP3Q658P3 488 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ATG9BQ674R7 924 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 GDPD3Q7L5L3 318 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 KDELC2Q7Z4H8 507 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 VN1R5Q7Z5H4 357 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 B3GALT6Q96L58 329 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 HEPHQ9BQS7 1158 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 IL21Q9HBE4 155 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ERVK-18Q9QC07 812 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 TBC1D24Q9ULP9 559 aa3.54□□□□□ -1.84
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PGGT1B-203ENST00000419445 VPS4BO75351 444 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 TNFRSF21O75509 655 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 NUDT7P0C024 238 aa3.54□□□□□ -1.84
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PGGT1B-203ENST00000419445 Q5BKY6 102 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 FKBP9P1Q75LS8 142 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 TRILQ7L0X0 811 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 IFNEQ86WN2 208 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 MICU2Q8IYU8 434 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 FBXO39Q8N4B4 442 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 STARD8Q92502 1023 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 SOSTQ9BQB4 213 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 RAD21L1Q9H4I0 556 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 NECTIN3Q9NQS3 549 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 PCDHB8Q9UN66 801 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 A8MU76 341 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 DFFAO00273 331 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 SCELO95171 688 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 LCKP06239 509 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 PLEKHH3Q7Z736 793 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 SDCCAG3Q96C92 435 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 NRBF2Q96F24 287 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 MAGIXQ9H6Y5 334 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 RDH14Q9HBH5 336 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 PFDN4Q9NQP4 134 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 WDR37Q9Y2I8 494 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 PCNAP12004 261 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ITGB6P18564 788 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 HMGCS1Q01581 520 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC13A2Q13183 592 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 GAB1Q13480 694 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 BROXQ5VW32 411 aa3.54□□□□□ -1.84
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PGGT1B-203ENST00000419445 ZZZ3Q8IYH5 903 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 IL17RDQ8NFM7 739 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 OR6J1Q8NGC5 347 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 NDNFQ8TB73 568 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 RNF145Q96MT1 663 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 OR2A14Q96R47 310 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 MTMR11A4FU01 709 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 HRO43593 1189 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 PCDH7O60245 1069 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 GDF5P43026 501 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CLDN8P56748 225 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 SSX1Q16384 188 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CST9Q5W186 159 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC8B1Q6J4K2 584 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa3.54□□□□□ -1.84
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PGGT1B-203ENST00000419445 OR6P1Q8NGX9 317 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 OR6F1Q8NGZ6 308 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC22A12Q96S37 553 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 MAGEH1Q9H213 219 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM50BQ9Y247 325 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 TESMINQ9Y4I5 508 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 IQCF5A8MTL0 148 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 GFYI3L273 518 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 PER2O15055 1255 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ANXA6P08133 673 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 PAX3P23760 479 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CD40LGP29965 261 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 FPGSQ05932 587 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 Q6ZNB5 142 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ENTHD1Q8IYW4 607 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
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