RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

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Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 KLQ9UEF7 1012 aa23.24■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 CDH7Q9ULB5 785 aa23.24■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 XIRP2A4UGR9 3374 aa23.24■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 LOC730098B7Z3J9 87 aa23.24■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 GRM6O15303 877 aa23.24■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 C8GP07360 202 aa23.24■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 ERVFC1P60507 584 aa23.24■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 CREMQ03060 361 aa23.24■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 ZNF33BQ06732 778 aa23.24■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 LMAN2Q12907 356 aa23.24■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 LRIF1Q5T3J3 769 aa23.24■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 PPP2R2DQ66LE6 453 aa23.24■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 CRTC1Q6UUV9 634 aa23.24■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa23.24■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 RGL4Q8IZJ4 473 aa23.24■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 USE1Q9NZ43 259 aa23.24■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 ELOVL7A1L3X0 281 aa23.23■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 SLC16A5O15375 505 aa23.23■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 DFNA5O60443 496 aa23.23■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 SEC22BO75396 215 aa23.23■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 ALPLP05186 524 aa23.23■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 MPC1LP0DKB6 136 aa23.23■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 CDK4P11802 303 aa23.23■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 ITGB6P18564 788 aa23.23■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 NRIP1P48552 1158 aa23.23■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 HNMTP50135 292 aa23.23■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 CLDN8P56748 225 aa23.23■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 RAB30Q15771 203 aa23.23■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa23.23■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 TXNDC8Q6A555 127 aa23.23■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 USP45Q70EL2 814 aa23.23■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 PLPP6Q8IY26 295 aa23.23■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 LIX1Q8N485 282 aa23.23■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 FBXL20Q96IG2 436 aa23.23■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 COPS8Q99627 209 aa23.23■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 SLC12A9Q9BXP2 914 aa23.23■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 KCNH6Q9H252 994 aa23.23■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 MSRAQ9UJ68 235 aa23.23■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 TMED5Q9Y3A6 229 aa23.23■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa23.23■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 GSTA4O15217 222 aa23.22■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 SNAP29O95721 258 aa23.22■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 LRIT3Q3SXY7 679 aa23.22■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 TTC23Q5W5X9 447 aa23.22■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 PAF1Q8N7H5 531 aa23.22■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 GPR26Q8NDV2 337 aa23.22■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 OR6K2Q8NGY2 324 aa23.22■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 SLC22A17Q8WUG5 538 aa23.22■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 TMBIM1Q969X1 311 aa23.22■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 LMLNQ96KR4 655 aa23.22■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 HBEGFQ99075 208 aa23.22■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 ZBP1Q9H171 429 aa23.22■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 TMEM9Q9P0T7 183 aa23.22■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 CIDEBQ9UHD4 219 aa23.22■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 HS3ST2Q9Y278 367 aa23.22■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa23.22■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 FAM220BPB1ANY3 271 aa23.22■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 NUAK1O60285 661 aa23.22■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 LILRB3O75022 631 aa23.22■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 OR56A5P0C7T3 313 aa23.22■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 NFKBIAP25963 317 aa23.22■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 MAPK1P28482 360 aa23.22■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 GDF5P43026 501 aa23.22■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 RPS6KA3P51812 740 aa23.22■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 SP140Q13342 867 aa23.22■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 PTGR1Q14914 329 aa23.22■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 DGKKQ5KSL6 1271 aa23.22■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 GPR180Q86V85 440 aa23.22■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa23.22■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 VOPP1Q96AW1 172 aa23.22■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 SDCCAG3Q96C92 435 aa23.22■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 TIFAQ96CG3 184 aa23.22■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 SNX6Q9UNH7 406 aa23.22■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 ANKRD12Q6UB98 2062 aa23.21■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 A0A096LPI6 279 aa23.21■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 TRIM64BA6NI03 449 aa23.21■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 RFXAPO00287 272 aa23.21■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 THRBP10828 461 aa23.21■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 DCKP27707 260 aa23.21■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 IRS1P35568 1242 aa23.21■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 RPIAP49247 311 aa23.21■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP23.21■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 PYCR3Q53H96 274 aa23.21■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 TBPL2Q6SJ96 375 aa23.21■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 GPR149Q86SP6 731 aa23.21■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 CALHM3Q86XJ0 350 aa23.21■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 MICU2Q8IYU8 434 aa23.21■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 L3MBTL4Q8NA19 623 aa23.21■■□□□ 1.31
PMS1-205ENST00000409985 POF1BQ8WVV4 589 aa23.21■■□□□ 1.31
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