RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394202.8

CNN3-202, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CNN3, Length 1,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-202ENST00000394202 ZNF528Q3MIS6 628 aa22.63■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 C11orf74Q86VG3 221 aa22.63■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 PATE1Q8WXA2 126 aa22.63■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 CCDC138Q96M89 665 aa22.63■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 IL17FQ96PD4 163 aa22.63■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 HGH1Q9BTY7 390 aa22.63■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 TAAR2Q9P1P5 351 aa22.63■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa22.63■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa22.63■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 FANCMQ8IYD8 2048 aa22.63■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 GGT5P36269 586 aa22.63■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 BLKP51451 505 aa22.63■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 PTCHD3Q3KNS1 767 aa22.63■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 OR9A1PQ8NGU1 263 aa22.63■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 BCAS4Q8TDM0 211 aa22.63■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 PPP4R1Q8TF05 950 aa22.63■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 UBTD2Q8WUN7 234 aa22.63■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 ZNF480Q8WV37 535 aa22.63■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 FBXL8Q96CD0 374 aa22.63■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 FERD3LQ96RJ6 166 aa22.63■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 C21orf59P57076 290 aa22.62■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 SH3BP2P78314 561 aa22.62■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 KIF19Q2TAC6 998 aa22.62■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 AGTRAPQ6RW13 159 aa22.62■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 WASH2PQ6VEQ5 465 aa22.62■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 TAF8Q7Z7C8 310 aa22.62■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa22.62■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 TEX9Q8N6V9 391 aa22.62■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 PIGKQ92643 395 aa22.62■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 WASH6PQ9NQA3 447 aa22.62■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 TMEM233B4DJY2 109 aa22.61■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 TNFRSF10AO00220 468 aa22.61■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 STK16O75716 305 aa22.61■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 SLC6A12P48065 614 aa22.61■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 HNMTP50135 292 aa22.61■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa22.61■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 CRLF3Q8IUI8 442 aa22.61■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa22.61■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 MENTQ9BUN1 341 aa22.61■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 GSDMCQ9BYG8 508 aa22.61■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 ZNF225Q9UK10 706 aa22.61■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 CACNA1EQ15878 2313 aa22.61■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 A0A1B0GTW7 788 aa22.61■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 F3P13726 295 aa22.61■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 NAE1Q13564 534 aa22.61■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 LPAL2Q16609 132 aa22.61■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 ZSCAN26Q16670 478 aa22.61■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 TBC1D21Q8IYX1 336 aa22.61■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 OR52B6Q8NGF0 335 aa22.61■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 RFWD2Q8NHY2 731 aa22.61■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 NPHS2Q9NP85 383 aa22.61■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 FSCN3Q9NQT6 498 aa22.61■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 SLC22A14Q9Y267 594 aa22.61■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 SNX11Q9Y5W9 270 aa22.61■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 SDC3O75056 442 aa22.6■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 EPORP19235 508 aa22.6■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 GTF2H2Q13888 395 aa22.6■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa22.6■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 CUZD1Q86UP6 607 aa22.6■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 RAD51AP1Q96B01 352 aa22.6■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 OPTCQ9UBM4 332 aa22.6■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 RAP2CQ9Y3L5 183 aa22.6■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 K7EPI3 171 aa22.59■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 OR7A17O14581 309 aa22.59■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 CNR2P34972 360 aa22.59■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 SERPINB5P36952 375 aa22.59■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 SLC19A1P41440 591 aa22.59■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 HALP42357 657 aa22.59■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 LCP2Q13094 533 aa22.59■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 IYDQ6PHW0 289 aa22.59■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 PIGWQ7Z7B1 504 aa22.59■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 TCAIMQ8N3R3 496 aa22.59■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 LMX1AQ8TE12 382 aa22.59■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 CAMK1GQ96NX5 476 aa22.59■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 CDK15Q96Q40 435 aa22.59■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 KMT2EQ8IZD2 1858 aa22.59■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 PI4KAP42356 2102 aa22.59■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 NDUFAB1O14561 156 aa22.59■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 WDR47O94967 919 aa22.59■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 GNSP15586 552 aa22.59■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 CTSKP43235 329 aa22.59■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 TTC23LQ6PF05 361 aa22.59■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 PRR23BQ6ZRT6 265 aa22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms