RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393203.2

PTGFRN-201, Transcript of prostaglandin F2 receptor inhibitor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTGFRN, Length 6,178 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRN-201ENST00000393203 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 WSCD2Q2TBF2 565 aa14.96□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 TPRG1LQ5T0D9 272 aa14.96□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 MBLAC2Q68D91 279 aa14.96□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 AQP12AQ8IXF9 295 aa14.96□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 OR10H5Q8NGA6 315 aa14.96□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 SPPL2BQ8TCT7 592 aa14.96□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 ANKRA2Q9H9E1 313 aa14.96□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 TRPS1Q9UHF7 1281 aa14.96□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 COQ4Q9Y3A0 265 aa14.96□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 MAGEB3O15480 346 aa14.95□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 GIMD1P0DJR0 217 aa14.95□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 PRPS2P11908 318 aa14.95□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 NDST2P52849 883 aa14.95□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 PTPRJQ12913 1337 aa14.95□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 HFE2Q6ZVN8 426 aa14.95□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 C5orf34Q96MH7 638 aa14.95□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 PSAT1Q9Y617 370 aa14.95□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 XKRYO14609 159 aa14.95□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 SLC22A1O15245 554 aa14.95□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 HTR1BP28222 390 aa14.95□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 PGGT1BP53609 377 aa14.95□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 DSC3Q14574 896 aa14.95□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 PPP1R3AQ16821 1122 aa14.95□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 FBXO42Q6P3S6 717 aa14.95□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 SLCO2A1Q92959 643 aa14.95□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 TMEM209Q96SK2 561 aa14.95□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 PKP4Q99569 1192 aa14.95□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 IFT27Q9BW83 186 aa14.95□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 SMURF2Q9HAU4 748 aa14.95□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 COL1A2P08123 1366 aa14.95□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 NID2Q14112 1375 aa14.95□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 SOWAHBA6NEL2 793 aa14.95□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 FOSL2P15408 326 aa14.95□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 AOC1P19801 751 aa14.95□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 GNALP38405 381 aa14.95□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 MPP2Q14168 576 aa14.95□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 HERC3Q15034 1050 aa14.95□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 LRRC15Q8TF66 581 aa14.95□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 NEK6Q9HC98 313 aa14.95□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 FZD4Q9ULV1 537 aa14.95□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 PHF24Q9UPV7 400 aa14.95□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 SLC22A2O15244 555 aa14.95□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 KERAO60938 352 aa14.95□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP14.95□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 PTGER3P43115 390 aa14.95□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 GSCP56915 257 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 KLHL35Q6PF15 583 aa14.95□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 TREML1Q86YW5 311 aa14.95□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 CCDC36Q8IYA8 594 aa14.95□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 ZNF615Q8N8J6 731 aa14.95□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 TMED9Q9BVK6 235 aa14.95□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 KCTD3Q9Y597 815 aa14.95□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 CDC7O00311 574 aa14.94□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 ESR1P03372 595 aa14.94□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 TM4SF1P30408 202 aa14.94□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 GDF5P43026 501 aa14.94□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 LGI4Q8N135 537 aa14.94□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 PMEPA1Q969W9 287 aa14.94□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 TIFAQ96CG3 184 aa14.94□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 CGREF1Q99674 301 aa14.94□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 ZBTB26Q9HCK0 441 aa14.94□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 FKBP7Q9Y680 259 aa14.94□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 XPNPEP2O43895 674 aa14.94□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 PTNP21246 168 aa14.94□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 VARSP26640 1264 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 PTGS2P35354 604 aa14.94□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 DNASE1L1P49184 302 aa14.94□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 IL10RBQ08334 325 aa14.94□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 SIRPB2Q5JXA9 342 aa14.94□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 ATCAYQ86WG3 371 aa14.94□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa14.94□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 CD320Q9NPF0 282 aa14.94□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 FAM53CQ9NYF3 392 aa14.94□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 SPEF1Q9Y4P9 236 aa14.94□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 J3KR12 359 aa14.94□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 TGFB1P01137 390 aa14.94□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 LINGO3P0C6S8 592 aa14.94□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 CPN2P22792 545 aa14.94□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 CLCN4P51793 760 aa14.94□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 GFOD2Q3B7J2 385 aa14.94□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.3 ms