RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380221.7

TRAPPC10-202, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC10, Length 1,763 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-202ENST00000380221 HERVK_113P63132 956 aa26.98■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 CDKL1Q00532 357 aa26.98■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 SETDB1Q15047 1291 aa26.98■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF678Q5SXM1 525 aa26.98■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 WASH2PQ6VEQ5 465 aa26.98■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF781Q8N8C0 355 aa26.98■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR5K2Q8NHB8 316 aa26.98■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 PKP4Q99569 1192 aa26.98■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 ERVK-6Q9BXR3 956 aa26.98■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 WASH6PQ9NQA3 447 aa26.98■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 ASB1Q9Y576 335 aa26.98■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 VPS13AQ96RL7 3174 aa26.98■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 A6NCN8 305 aa26.97■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 CTSKP43235 329 aa26.97■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 AQP5P55064 265 aa26.97■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 PRKG2Q13237 762 aa26.97■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 RPE65Q16518 533 aa26.97■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 SULT1C3Q6IMI6 304 aa26.97■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 L3HYPDHQ96EM0 354 aa26.97■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 FERD3LQ96RJ6 166 aa26.97■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 SIKE1Q9BRV8 207 aa26.97■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa26.97■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 STX16O14662 325 aa26.97■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 HGSO14964 777 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 DCTN3O75935 186 aa26.97■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 SERPINB5P36952 375 aa26.97■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 HALP42357 657 aa26.97■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 LSMEM2Q8N112 164 aa26.97■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 FITM2Q8N6M3 262 aa26.97■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 LMX1AQ8TE12 382 aa26.97■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 CNDP1Q96KN2 507 aa26.97■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 TMEM79Q9BSE2 394 aa26.97■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 WWOXQ9NZC7 414 aa26.97■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 RAP2CQ9Y3L5 183 aa26.97■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 R4GN57 208 aa26.97■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa26.96■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 SUPT7LO94864 414 aa26.96■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 F3P13726 295 aa26.96■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 HSPA7P48741 367 aa26.96■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 NUBP1P53384 320 aa26.96■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 UNC50Q53HI1 259 aa26.96■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 CCDC138Q96M89 665 aa26.96■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 FSCN3Q9NQT6 498 aa26.96■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 TMEM131Q92545 1883 aa26.96■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa26.95■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 SDC3O75056 442 aa26.95■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 MPSTP25325 297 aa26.95■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP26.95■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 ELOCQ15369 112 aa26.95■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 CDKL4Q5MAI5 379 aa26.95■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 TTC23LQ6PF05 361 aa26.95■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa26.95■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 TBC1D21Q8IYX1 336 aa26.95■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 MAGEC3Q8TD91 643 aa26.95■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 HGH1Q9BTY7 390 aa26.95■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa26.95■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 SPASTQ9UBP0 616 aa26.95■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 PLAGL1Q9UM63 463 aa26.95■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 LAMA1P25391 3075 aa26.95■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 MYO1CO00159 1063 aa26.94■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 SLC16A8O95907 504 aa26.94■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 RPN2P04844 631 aa26.94■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 GDF5P43026 501 aa26.94■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 PRKAA1Q13131 559 aa26.94■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 GRB7Q14451 532 aa26.94■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR9A1PQ8NGU1 263 aa26.94■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 LRRC37BQ96QE4 947 aa26.94■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 CFIP05156 583 aa26.94■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 HNMTP50135 292 aa26.94■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 CDH13P55290 713 aa26.94■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 KRT33BQ14525 404 aa26.94■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 SFTPA2Q8IWL1 248 aa26.94■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 FAM46DQ8NEK8 389 aa26.94■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 AGR3Q8TD06 166 aa26.94■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 PATE1Q8WXA2 126 aa26.94■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 RAD51AP1Q96B01 352 aa26.94■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 FBXL8Q96CD0 374 aa26.94■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 NRTNQ99748 197 aa26.94■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa26.94■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 ATG10Q9H0Y0 220 aa26.94■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 GSTO2Q9H4Y5 243 aa26.94■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 HEY2Q9UBP5 337 aa26.94■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 HAO1Q9UJM8 370 aa26.94■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 PATE3B3GLJ2 98 aa26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms